Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 76,322 | 0 | G | A | 58.2% | 230.5 / inf | 673 | intergenic (+380/‑754) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 677 total aligned reads displayed.
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(MQ=14) atCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGAc > 2:348698/1‑141 (MQ=0) cTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑aa > 2:760939/1‑106 (MQ=255) aaGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATa > 1:167449/1‑141 (MQ=39) gggAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATaaa < 1:368380/141‑1 (MQ=40) | ATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAA > CP000730/76182‑76461 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |