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(MQ=11) tatGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑aaaaaagcttat > 1:820202/1‑134 (MQ=11) aagctATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGAGTAAACGTTCATCAATCAACGATCTACCGAAGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTCAATACCAAATCTGGAAGAAAAAGCATAAAAAAACTAATTACAAAta > 1:41474/5‑140 (MQ=1) tATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTa < 2:212114/141‑1 (MQ=40) tCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTAtt > 2:461817/1‑141 (MQ=39) cTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑aa < 1:760939/106‑1 (MQ=255) aCGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGCAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGa > 2:363894/1‑141 (MQ=38) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |