| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 293,940 | C→T | 19.6% | intergenic (+57/‑471) | USA300HOU_0261 → / → ispD2 | zinc (Zn2+)‑binding dehydrogenase/2‑C‑methyl‑D‑erythritol 4‑phosphate cytidylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 293,940 | 0 | C | T | 19.6% | 136.4 / 30.2 | 73 | intergenic (+57/‑471) | USA300HOU_0261/ispD2 | zinc (Zn2+)‑binding dehydrogenase/2‑C‑methyl‑D‑erythritol 4‑phosphate cytidylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/25); new base T (7/7); total (41/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.23e-02 | |||||||||||
CCGTTAGAAAAAGGCCCGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTAAAATGAGATGGCAATATTTGATAA > CP000730/293800‑294080 | ccGTTAGAAAAAGGCCCGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGc < 1:694294/141‑1 (MQ=255)ccGTTAGAAAAAGGCCCGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGc < 2:808773/141‑1 (MQ=255) gTTAGAAAAAGGCCCGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGCACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCg < 1:806144/141‑1 (MQ=255) gTTAGAAAAAGGCCCGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCg < 2:295822/141‑1 (MQ=255) aGAAAAAGGCCCGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCt < 2:847103/141‑1 (MQ=255) gAAAAAGGCCCGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTg < 2:708056/141‑1 (MQ=255) aaGGCCCGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGTCGTCTGGTCt < 1:279417/141‑1 (MQ=255) aGGCCCGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGAGTTCTTAGTATGCACCTTTGAGAACGAAAACGCTGGTGTAGTTATAGCTATGAAACGGCGAATGACGTCTGGtata > 2:243664/1‑141 (MQ=255) ggCCCGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGTCGTCTGGTCtat < 2:13603/141‑1 (MQ=255) cccGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATACCGGCGCGCTGGCGGTTTATACCAGTTCAGCTATGAGGACGAAAGCGAGGCGATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAg > 1:901640/1‑141 (MQ=255) cccGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAg > 1:789951/1‑141 (MQ=255) cccGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAg > 1:713489/1‑141 (MQ=255) gagaCATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATAc > 2:872379/1‑141 (MQ=255) gagaCATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGATGGTTTTGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATAc < 1:479176/141‑1 (MQ=255) agaCATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTGTGAAAGTGCGAATGCCGGCTGGTCTATAGATACt > 2:239430/1‑141 (MQ=255) agaCATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACt > 1:179741/1‑141 (MQ=255) cATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATc > 2:536225/1‑141 (MQ=255) atgtGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGCTCTATAGATACTATCg < 1:505820/138‑1 (MQ=255) ttGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGaa > 1:458081/1‑141 (MQ=255) aTAAATTAGGTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTGACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAaata < 1:682169/141‑1 (MQ=255) ttAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCa > 1:597583/1‑141 (MQ=255) ttAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGTCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCtt < 1:534480/141‑1 (MQ=255) gaaagaaCGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCGCCTTTGAGGAAGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGACGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATGTTCGCatat > 2:149543/1‑141 (MQ=255) gaaagaaCGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAatat > 1:16399/1‑141 (MQ=255) gaaagaaCGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAatat > 1:4200/1‑141 (MQ=255) gaaagaaCGATTTGATAAAGTCATATTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAatat > 1:664348/1‑141 (MQ=255) gaaCGCTTTGATAAAGTCATGTTCACGCTATATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGt > 2:881483/1‑141 (MQ=255) aaCGATTAGATAAAGTGATGTTTACGATGTATTAGTAAGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGGGATAGCGATGAAAGTGCGAATGTCGGCGAGTCTATAGATACTATCGAAATAATGCAACTTCGAatacaggct > 2:278005/1‑135 (MQ=255) gATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGAt > 1:69316/1‑141 (MQ=255) aTTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATa > 2:657372/1‑141 (MQ=255) aaaGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGTCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGcc < 1:331743/141‑1 (MQ=255) aGTCATGTTTACGATTTATTAGTGTGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCgg < 1:78925/141‑1 (MQ=255) aGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCgg < 1:681234/141‑1 (MQ=255) ctaagTTTACGATTAATTAGGATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGTTATGAAAGTGCGAATGCCGTCGGGTCTATAGATACGATCGAATGTATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATATCCGGtt < 2:398878/137‑1 (MQ=255) cATGTTGACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTAAAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGttt > 2:572725/1‑141 (MQ=255) tGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTAc < 2:659993/141‑1 (MQ=255) tttAAGATATAGTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGATGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGACTGCCGTGTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGGTTAAtt > 2:334390/1‑141 (MQ=255) ttACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGATCTATAGATACTTTCGAAACACTTCATCTTCGAATATACGTTGCTAAATAGCCGGTTTACttt > 1:186305/1‑140 (MQ=255) aCGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGTCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAATTAGCGGGTGTACTtgtg > 2:480696/1‑141 (MQ=255) aCGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTtgtg < 2:61604/141‑1 (MQ=255) aCGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTggtg > 2:566620/1‑141 (MQ=255) tattaGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAat > 2:608159/1‑141 (MQ=255) gTATCCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGTCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTCATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATACt > 1:618334/1‑141 (MQ=255) aCCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGTAATATGCTTGTGaa < 1:594581/141‑1 (MQ=255) tGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGACAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATGTACGTGGATAAATAGCCGCGTTACTTTAGTGTCATTCGCCTGTGATTCggg > 1:16376/1‑140 (MQ=255) tGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGTCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGgt < 1:761522/141‑1 (MQ=255) tGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTTTGAAATATTCTTGTGAATCGgt > 1:150645/1‑141 (MQ=255) tGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGgt > 1:838279/1‑141 (MQ=255) tGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGgt < 1:441554/141‑1 (MQ=255) ggagggaaaCGCTGGTATAGTTAGAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTCCTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATGGgttgt > 2:906492/7‑141 (MQ=255) ggACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGTCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGgttgt > 2:764693/1‑141 (MQ=255) ggACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGgttgt < 1:872379/141‑1 (MQ=255) cGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGtttt < 2:627249/141‑1 (MQ=255) aaCGCCGGTATAGTTATAGCAATGAAAGTGCGAATACCGTCTGGTCAATAAATACAATCGAAAACATTCATCTACGAATCTCCGTTGATAAATAGCTGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGACTCGGTTGTTTTGCAt > 2:28013/1‑141 (MQ=255) ggtataggtataGCTATGAAGGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGta > 1:568676/1‑141 (MQ=255) gTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATACTTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATAGGTTGTTTTGCATTTTGtat < 1:572725/141‑1 (MQ=255) ataGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATAc > 1:21530/1‑141 (MQ=255) ataGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATAc > 1:327458/1‑141 (MQ=255) ataGTTATAGCTAAGAAAGTGCAAATTCCGACTGTTCCATAGATACTATCGAAATAATTCATCCTCGAATATACGTTGATAAATAGGCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATAc < 2:118859/141‑1 (MQ=255) taGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTTTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACt < 1:239430/141‑1 (MQ=255) taGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACt < 2:179741/141‑1 (MQ=255) ataGCTATGAAAGTGCGAATGTCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTaaaa < 1:480696/141‑1 (MQ=255) aaaGCTATGAAAGTGAGAATGCCGACTGGTCTATAGATACTATCGGAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTcaaa < 2:155162/139‑1 (MQ=255) taGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTAAAAt > 1:76904/1‑141 (MQ=255) aGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTAAAATg < 2:870862/141‑1 (MQ=255) aGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTAAAATg < 2:774285/141‑1 (MQ=255) gCTATGAAAGTGCGAATGTCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTAAAATga > 1:711920/1‑141 (MQ=255) aTGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTAAAATGAGAt > 1:628779/1‑141 (MQ=255) tGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTATAATGAGATg < 1:818369/141‑1 (MQ=255) tGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTAAAATGAGATg < 2:359140/141‑1 (MQ=255) gTGCGAATGTCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTAAAATGAGATGGCAat > 2:738791/1‑141 (MQ=255) gTGCGAATGCCGTCAGGTCTATCGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGCTGTTTTGCATTTTGTATACTTAAAATGAGATGGCaaa > 2:26662/1‑140 (MQ=255) gAATGTCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATCTCCTCGCGTGGCGGTGGGTTTGCATTTTGTATACTTAAAATGAGATGGCAATAttt > 1:428597/1‑141 (MQ=255) gAATGTCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTAAAATGAGATGGCAATAttt < 1:373127/141‑1 (MQ=255) aaTGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCGTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGAGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTAAAAATGAGATGGCAATAttgg > 2:611235/1‑139 (MQ=255) ccGGCTGGTCTATAGATACTATCGGAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTTTCCTTAAAATGAGATGGCACTGTTTGAGaa > 2:532847/1‑141 (MQ=255) | CCGTTAGAAAAAGGCCCGGAGACATTTGATAAATTAGTTAACAAGAAAGAACGATTTGATAAAGTCATGTTTACGATTTATTAGTATGCACCTTTGAGGACGAAAACGCTGGTATAGTTATAGCTATGAAAGTGCGAATGCCGTCTGGTCTATAGATACTATCGAAATAATTCATCTTCGAATATACGTTGATAAATAGCCGGTTTACTTGTGTGAAATATGCTTGTGAATCGGTTGTTTTGCATTTTGTATACTTAAAATGAGATGGCAATATTTGATAA > CP000730/293800‑294080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |