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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 622,479 | 0 | T | C | 9.5% | 262.4 / 2.0 | 122 | D1014D (GAT→GAC) | sdrE | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrE |
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Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTC‑AGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGAT > CP000730/622339‑622611 | gattccgaTAGCCTCTCAGATTCCCATAGAGAACCTGATTCGAACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGCTTTCGATAGCGGTTCTATATTCA‑TCTGCGACAAAGTTTCAGATAGAGATTCGGACTCAGACAGCGAt < 2:328026/141‑1 (MQ=9)gattcagaCAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTC‑AGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGAt < 1:462581/141‑1 (MQ=255) atgcagaCAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTAGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTC‑AGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGAtt < 2:167003/138‑1 (MQ=255) ttcagaCAGCGACTCAGCTTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCCGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTC‑AGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTc < 2:535125/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ggACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGTGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGTga < 1:220940/141‑1 (MQ=255) gACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACGGCGACTCAGAGTGTGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGCATCAGATTCGGACAGCGATTCGGATTCTGGTAGCGGGTGAGACGTAGAGAGTggt > 2:148582/1‑139 (MQ=14) gACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGTgat > 1:105261/1‑141 (MQ=255) aCTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGTgatt > 1:913874/1‑141 (MQ=255) aCTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACACAGACAGTgatt > 2:438689/1‑141 (MQ=255) aCTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAAACCCCGACAGTgatc > 2:161650/1‑140 (MQ=255) aCTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCgatt > 2:487290/1‑141 (MQ=255) aCTCAGACAGCGATACAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGTgatt > 1:486959/1‑141 (MQ=255) tCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGTgattca > 2:764695/1‑141 (MQ=255) aGACTGCTACTCAGACGCAGACAGCGAGTCACCCTCAGCCGGCGACTGAGATTCTGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGTgattcaga < 2:512896/141‑1 (MQ=14) gACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACACTgattcagat > 1:905033/1‑141 (MQ=255) | GATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTC‑AGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGAT > CP000730/622339‑622611 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |