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2:153176/135‑1 (MQ=255) atCCGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑A‑AAAAG‑CTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACg < 1:114905/141‑1 (MQ=38) atCCGAAATAATAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑A‑AAAAG‑CTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACg < 1:199508/141‑1 (MQ=255) gggAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGGTTCCTCTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑A‑AAAAG‑CTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATaaa < 1:260730/141‑1 (MQ=14) tggtgTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑A‑AAAAG‑CTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGaaaa > 1:116885/1‑141 (MQ=39) ggtgGAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑A‑AAAAG‑CTAATTACAAATGGCGTGTTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAAt > 1:243407/1‑141 (MQ=255) atcatTCAACGGTCTACCGGTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑A‑AAAAG‑CTAATTACAAAAGGAGTATTCCTGCAACTAACTTCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTAGTtata > 2:162196/1‑141 (MQ=14) atTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑A‑AAAAG‑CTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGAAAAATGGAGCTATTTATATct > 1:139175/1‑140 (MQ=255) cAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑A‑AAAAG‑CTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGc < 2:260613/141‑1 (MQ=38) | GTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑A‑AAAAG‑CTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCATT > CP000730/76213‑76492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |