| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,107,008 | A→G | 4.4% | A350A (GCA→GCG) | pdhD → | dihydrolipoyl dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,107,008 | 0 | A | G | 4.4% | 257.5 / 2.2 | 92 | A350A (GCA→GCG) | pdhD | dihydrolipoyl dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/45); new base G (2/2); total (45/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.06e-01 | |||||||||||
ACGTCTATCAGCAATATCTATGCAATTGGTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCATTAGATGATACTAAC > CP000730/1106868‑1107143 | aCGTTTATCAGCAATGTCTACGAAATGGGTGATATCGTTCCAGTTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCcagca < 2:208870/141‑1 (MQ=255) ctatatCTAGGCAAGTGGTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTAc < 2:788300/139‑1 (MQ=255) tCTATGCAATTGGTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAAc < 1:662065/141‑1 (MQ=255) tCTATGCAATTGGTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGATCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATGGGTCTGCAAGCAGTATGCTGTACTGagc > 2:561736/1‑139 (MQ=255) cTATGCAATTGGTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTAACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACCTTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAAcc > 2:544601/1‑141 (MQ=255) aTGCAATTGGTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAg < 1:544565/141‑1 (MQ=255) aTTGGTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGATGCTAAAGTTGCTGCTGCAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGGTTACATTCGTATGCCAGCAGTATGCTTTAcgcagccgacatta > 2:318138/1‑128 (MQ=255) tgggTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAg < 2:26670/139‑1 (MQ=255) ggTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCGGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCGGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCt > 2:821542/1‑141 (MQ=255) gTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTTCTGGAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGACAGCCATATACTTTACTAAACCCGacggctcga > 1:189333/1‑133 (MQ=255) gTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTa < 1:240044/141‑1 (MQ=255) tGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGATGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGTTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTAc < 2:33562/141‑1 (MQ=255) tGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCGGCAGTATGCTTTAGTGAACCAGAATTAGCTaa > 2:223824/1‑140 (MQ=255) tGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGAAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTAc > 2:134597/1‑141 (MQ=255) tGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCCAAAGTTGTTGCTGAAGCAATTGATGCTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTCGTATGCCATCAGTCTGCTTTACTGAACCAGAATTGGCTAc < 1:616857/141‑1 (MQ=255) atatCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAg < 1:254963/141‑1 (MQ=255) atatCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAg < 2:582243/141‑1 (MQ=255) atatCGTTCCAGGTTTACCAATCGCTCACAAACCTAGCTTTGATTAAATGGCAACGTGTTAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAg < 1:394476/141‑1 (MQ=255) tatCGTTTCAGTTTTATCACCTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGt < 2:312277/141‑1 (MQ=255) tatCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCGGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGt > 1:231363/1‑141 (MQ=255) tatCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCGGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGt > 1:573323/1‑141 (MQ=255) gtaccAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGGTGCTGAAGCAATGAATGGTAAAGCTGCGGAAGGTGATAACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGt > 2:576904/4‑141 (MQ=255) gTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGt > 2:30785/1‑141 (MQ=255) tCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTa > 1:664273/1‑141 (MQ=255) gtcaCCGCTTGCTCACGAAGCTAGCTATGAAGCTAACGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGTTATGCCAGCAATATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGa < 2:580131/138‑1 (MQ=255) ttACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGaa < 2:310475/141‑1 (MQ=255) ttACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCCAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCGGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGaa < 2:689203/141‑1 (MQ=255) tACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAg > 1:810313/1‑141 (MQ=255) cACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAgcgc > 1:58729/1‑141 (MQ=255) cACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAgcgc < 2:677832/141‑1 (MQ=255) acaAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAaag < 1:348020/141‑1 (MQ=255) acaAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTCGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGATGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTaaaa > 2:7724/1‑140 (MQ=255) acaAAGCGAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAaag > 1:522780/1‑141 (MQ=255) aaGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAaagaag < 2:501404/141‑1 (MQ=255) ggagctaGGAATCTAAGGTTGCGGCTGAAGCAATTGGTGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACTAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCGAaagaagaag < 2:65504/139‑1 (MQ=255) agctaTGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGt < 2:99952/141‑1 (MQ=255) taTGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGGAGAAGGTTTa > 1:758491/1‑141 (MQ=255) gAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATGGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCa > 1:745039/1‑141 (MQ=255) aaGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAg > 1:229134/1‑141 (MQ=255) aGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGc > 2:48717/1‑141 (MQ=255) gTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGACGGTTTAGCAATTAAAGCt > 2:44287/1‑141 (MQ=255) gTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCt < 1:783046/141‑1 (MQ=255) gTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCt > 1:715663/1‑141 (MQ=255) gTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGATGATTACAGTGGTAAGCCAGCCGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTAGTTATTCAGAAGCGCAAGCGAAAGAAAAAGGAATAGCAATTAAAggt > 2:100903/1‑139 (MQ=255) tgctgcTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTc < 2:310403/141‑1 (MQ=255) tgctgcTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATGAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTc < 1:643923/141‑1 (MQ=255) gctgctGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCt < 2:372251/141‑1 (MQ=255) gccgctgAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCt < 2:247822/138‑1 (MQ=255) tgctgAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGACGAGCAAGCTAAAGAAGTAGGTATAGCCTTGAAAGCTTCCaa < 2:284150/141‑1 (MQ=255) tgctgAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTaa < 2:579626/141‑1 (MQ=255) tgctgAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTaa > 1:62471/1‑141 (MQ=255) gctgAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCATAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTaaa < 1:825528/141‑1 (MQ=255) gctgAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTaaa < 1:631873/141‑1 (MQ=255) ctgAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTATAGAAAATAACGCATCTAAAt < 2:701214/141‑1 (MQ=255) tgAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAAtt > 1:583407/1‑141 (MQ=255) gAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTc > 2:250693/1‑141 (MQ=255) aaGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCACGCTAAAGAAGAAAGTTTAGCAATTCAAGCTTCTAAATTcc > 2:652892/1‑141 (MQ=255) cAATTGATGGTCAAGCTGCTGGAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACAAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCat < 1:564070/141‑1 (MQ=255) aaTTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCata < 1:30362/141‑1 (MQ=255) aTGGTCAAGCTGCTGGAGTTGATTAAATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATCAAGAAGCGCAAGCTACAAAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTACTAAATTACCAGACgcag > 2:623831/1‑141 (MQ=255) ggTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATgcagca < 1:311279/141‑1 (MQ=255) gTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCaa > 1:483611/1‑141 (MQ=255) tcaagggtataaaGTTTATTTCATTGGCATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAAGGAGAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCaaa < 2:767528/130‑1 (MQ=255) tCAAGCTGCTGTAGGGTAGTAAATTGTGATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAAGTAGCTACAGTTGGTTATTTAGAAGCGCAATCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCaaa < 2:541862/141‑1 (MQ=255) cAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAAt > 2:119059/1‑141 (MQ=255) aaGCTGCTGAGGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGGTGTACTGAAACAGAATTAGCGACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATg < 2:773583/141‑1 (MQ=255) aaGCTGCTGAAGTTGATTGCATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGATACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATg < 2:389543/141‑1 (MQ=255) aaGCTGCTGAAGTTGATTAAATTGGTATGCCAGCAGTAGGCTGTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCAGATGCAGCAAATg < 2:278001/141‑1 (MQ=255) ctgctgAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGtg > 2:521992/1‑140 (MQ=255) ctgctgAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGACGCAAAGGGTc > 2:709762/1‑141 (MQ=255) ctgctgAAGATGATTACGTTGGTATGATATCAGTATGCTTTGTTGAACAAGAATAAACTACAGTTGGGAATTTAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGACGGGATAGTNATTAAAGCGTCTAAATTCCCATTTgcgtcaacaggtc > 2:227388/1‑130 (MQ=255) gctgAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGt > 2:267169/1‑141 (MQ=255) gctgAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGt > 1:220526/1‑141 (MQ=255) gctgAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGt > 2:636186/1‑141 (MQ=255) tgAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTATACTGAACCAGAATTAGCTACTGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCCAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGc > 2:403140/1‑141 (MQ=255) tcaaGTTTATTACATTTGTATGTCATCAGTATGCTTTACTGAACAATAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAAAAGCGCAACCTAAACAACACAATATCATGTTTTTGGTTTCTAAATTCCCATATGTAGCAAATGGTCGTGc < 2:137730/139‑1 (MQ=255) gAAGTTGATTACATTGGTAGGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCa < 1:454360/141‑1 (MQ=255) aGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTATTGACCCAGAAGTACCTACAGTGGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCAtt < 1:67223/141‑1 (MQ=255) aGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCAtt < 1:373644/141‑1 (MQ=255) aGTTGATTACATTGGGATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCGACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCAtt < 1:281775/141‑1 (MQ=255) gATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCa > 1:105281/1‑141 (MQ=255) gATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCa > 1:337790/1‑141 (MQ=255) gATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCa > 1:337855/1‑141 (MQ=255) tACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCATTa > 2:637750/1‑141 (MQ=255) tACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCATTa > 2:728538/1‑141 (MQ=255) tGGTAGGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCATTAgatga < 1:442299/141‑1 (MQ=255) gggaTGCCAGCAGTATGCTTTACCGAACCATAATTAGCTACAGTTGGTTATTAAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAATTTCCCATATGTAGCAAATGGTCGTGCATTATCATTAgatgat < 2:69493/138‑1 (MQ=255) ggactcgcagcagTATGCTTCACTGATCCAGGATTAGCTCCAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTCTAGCAATTAAAGCTTCTAAATGCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCCTTATCATTAgatgat < 2:440476/134‑1 (MQ=255) gTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCATTAGATGATa > 2:273987/1‑141 (MQ=255) aTGCCAGCGGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCTGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCATTAGATGATACt < 2:573323/141‑1 (MQ=255) aTGCCAGCGGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCATTAGATGATACt < 2:231363/141‑1 (MQ=255) gCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCATTAGATGATACTaa > 2:324041/1‑141 (MQ=255) ccAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATTGTCGTGCATTATCATTAGATGATACTaaa > 2:518518/1‑140 (MQ=255) ccAGCAGTATGCTCGACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCATTAGATGATACTAAc < 2:475441/141‑1 (MQ=255) | ACGTCTATCAGCAATATCTATGCAATTGGTGATATCGTTCCAGGTTTACCACTTGCTCACAAAGCTAGCTATGAAGCTAAAGTTGCTGCTGAAGCAATTGATGGTCAAGCTGCTGAAGTTGATTACATTGGTATGCCAGCAGTATGCTTTACTGAACCAGAATTAGCTACAGTTGGTTATTCAGAAGCGCAAGCTAAAGAAGAAGGTTTAGCAATTAAAGCTTCTAAATTCCCATATGCAGCAAATGGTCGTGCATTATCATTAGATGATACTAAC > CP000730/1106868‑1107143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |