| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 76,322 | 0 | G | A | 55.4% | 132.4 / inf | 657 | intergenic (+380/‑754) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 661 total aligned reads displayed.
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(MQ=11) tatatCTGAGATATTAAGGGAACGTGGTGTAACCGATCATCATTCCACGGTCTACCGGTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAA‑AAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATgag > 1:577824/1‑141 (MQ=14) ttAAGGAAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAACAAGCATAACAAAGCTAATAACAAATGGCGTATTGATGATACATACATCaaa > 2:653886/1‑141 (MQ=11) aGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAA‑AAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATaa > 1:634021/1‑141 (MQ=39) | ATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAA‑AAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAA > CP000730/76182‑76462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |