| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 76,353 | 0 | G | A | 52.9% | 44.0 / inf | 498 | intergenic (+411/‑723) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 499 total aligned reads displayed.
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1:16827/141‑1 (MQ=255) atGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGCACGTGGTGTAAACGCTCGTCATTCAACGGTCAGCCGTTGGGTTCAAGAATGTGCCCCAATTTTATATCAAATTTGAAAGAAAAAGCATaa‑aacagcgtata > 2:694365/1‑132 (MQ=11) atGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAGTAGGCTCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAA‑AAAGCTAATTa > 1:649631/1‑141 (MQ=255) aTCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAA‑AAAGCTAATTACAAATGGCGTAt < 1:81575/141‑1 (MQ=38) atCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTCTAAACGGTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAA‑AAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACg < 1:110569/141‑1 (MQ=255) ttAAGGAAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAACAAGCATAACAAAGCTAATAACAAATGGCGTATTGATGATACATACATCaaa > 2:653886/1‑141 (MQ=11) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |