| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,693,509 | A→G | 5.3% | L10S (TTA→TCA) | hrcA ← | heat shock transcriptional repressor HrcA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,693,509 | 0 | A | G | 5.3% | 219.8 / 3.2 | 75 | L10S (TTA→TCA) | hrcA | heat shock transcriptional repressor HrcA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/36); new base G (2/2); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.62e-01 | |||||||||||
TCTCGATATAGTTTAAATCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAATTTCAATTTTTTTAATCAT > CP000730/1693369‑1693644 | tctcGATATAGTTTAAATCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATACTCTTCAACAATTGCGTTTa > 1:552204/1‑141 (MQ=255) cGATATAGTTTAAATCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTATAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAata < 1:525058/141‑1 (MQ=255) cGATATAGTTTAAATCTTCAAGCTGTTTCATATCATTTCTAATTGTGGCAGGACTAACATTCACGTTATGTCGCTCAAGTAGTGTTTTAGATCGAACGGGTTGTCCAAAATCAAGATAATCCTCAAGAATTGCGTTTAata > 2:215777/1‑141 (MQ=255) atatAGTTTAAATCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGGTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAAtata > 1:649653/1‑141 (MQ=255) tataGTTTAAATCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATAc < 2:526745/141‑1 (MQ=255) tataGTTTAAATCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATAc < 2:410846/141‑1 (MQ=255) tataGTTTAAATCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTGATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATAc < 1:531415/141‑1 (MQ=255) tataGTTTAAATCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCCAAATGGATCAGTACTTAGATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATAc < 2:277773/141‑1 (MQ=255) tataGTTTAAATCTGCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATAc < 1:9099/141‑1 (MQ=255) tataCTTTAAATCTTCGAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACGAACATTGAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATAc < 2:769891/141‑1 (MQ=255) aataGTTTAAATTTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACCATTGCGTTTAATATAc < 1:392721/140‑1 (MQ=255) tCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCtt > 2:2294/1‑140 (MQ=255) tCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTa < 1:304621/141‑1 (MQ=255) tCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTa > 2:228283/1‑141 (MQ=255) tCTTCAAGCGGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTa < 2:458033/141‑1 (MQ=255) tCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATCTACTCAATTGCCTATCt > 1:684662/1‑141 (MQ=255) cAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTg > 1:84644/1‑141 (MQ=255) aaGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGt < 2:340345/141‑1 (MQ=255) cTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAAt < 2:248125/141‑1 (MQ=255) tGTTTCATTTCATTTCTAATTGGAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCTAAAATCAACATAATCCTCACCAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATc < 2:342437/141‑1 (MQ=255) agTTTTAGCTCATATCTAAGTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGGTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATc < 1:746778/140‑1 (MQ=255) ttCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTGATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATg > 1:562872/1‑141 (MQ=255) ttCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTGATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATg > 1:687738/1‑141 (MQ=255) tCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTTAATTGCCTATCTGTAATCATGt < 2:576429/141‑1 (MQ=255) cATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGtt > 1:635702/1‑141 (MQ=255) ctcATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTc < 1:265309/141‑1 (MQ=255) aTTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCAcc > 2:22815/1‑141 (MQ=255) aTTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCAcc > 1:279753/1‑141 (MQ=255) tCTAATTGTAGCAGGACTATCATTCTAGTTATGTCGCTCATTTAGTGTTTTATAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCATCAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCa < 2:27236/141‑1 (MQ=255) ttAAGTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCAt < 1:94709/140‑1 (MQ=255) cTAATTGGAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCAt < 1:138207/141‑1 (MQ=255) tAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCAtt < 1:519086/141‑1 (MQ=255) tAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCAtt > 1:345540/1‑141 (MQ=255) aTTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAg > 1:700158/1‑141 (MQ=255) gTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGcac > 2:759445/1‑141 (MQ=255) cTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTAtc > 2:297916/1‑141 (MQ=255) cTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTGTAACATTGTCAGTTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTAtc > 1:181931/1‑141 (MQ=255) cTAACATTCAAGTTATGTCGATCACTATGTTGGTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTAtc > 2:559081/1‑141 (MQ=255) aaCGTTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTAtctc < 2:555139/141‑1 (MQ=255) aCATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATGCTCAACAATTGCGTGTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTaaacca > 2:59735/1‑136 (MQ=255) aCATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCa < 2:532229/141‑1 (MQ=255) aCATTCAAGTTATGTCGCTAAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCATCATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTATTCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCa < 2:337023/141‑1 (MQ=255) cATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCaa < 1:534986/141‑1 (MQ=255) aaTTAAATTTATGTCGCGCAATTAGTGTTTTAAAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCaa < 1:635635/140‑1 (MQ=255) ttCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGt < 2:84644/141‑1 (MQ=255) aTGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATCTTAACTAGTTCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATta > 1:775489/1‑141 (MQ=255) tGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATtat > 1:640726/1‑141 (MQ=255) tGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATtat > 1:94194/1‑141 (MQ=255) tGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGAGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAGTTGCGTTTAATATACTCAATTGCATATATGTAATCATGTTTTATCCTCATTAGAACTCCCTTATCTCAGATGCAATTtat > 2:410654/1‑141 (MQ=255) tGTCGCTCAATTAGGGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATtat > 1:514898/1‑141 (MQ=255) aaTTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATc < 2:638941/141‑1 (MQ=255) ttAGTGTTTTAGAACCAGCGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGATTCCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCaa < 2:278807/141‑1 (MQ=255) tgtgagtgttAGAACCCACGGGTTCTCCAAAACCAACATAATCCTCATCAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCTCTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCaa < 1:364947/133‑1 (MQ=255) tgtTTTAGAACCAACGGGTGATTCGGTATGAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTAGCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAGATTg < 2:550464/141‑1 (MQ=255) aaCCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGCTCAcagt > 1:746624/1‑141 (MQ=255) cAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAacgtaag > 2:788838/1‑141 (MQ=255) aCGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTc > 2:308496/1‑141 (MQ=255) cGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAACGTAAGTCa > 2:80685/1‑141 (MQ=255) ggTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAATTAAGTAAAt > 1:364481/1‑141 (MQ=255) gTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATg > 1:89019/1‑141 (MQ=255) aTCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTc > 1:470370/1‑141 (MQ=255) cATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAAt > 1:769336/1‑141 (MQ=255) aTAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAAtt > 2:631688/1‑141 (MQ=255) aTAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAAtt < 2:76432/141‑1 (MQ=255) ccTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAATTTCAAt > 1:559036/1‑141 (MQ=255) cctaactagtGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGGCAATTTTAAAGACTCGAAATTTCAAtt < 2:169065/132‑1 (MQ=255) caacaaTTGCCTTTAATATACTCAATTGCCTATCGGCAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAGGACTCGAAATTTCAAtttt < 2:536570/141‑1 (MQ=255) aacaaTTGCGTTTGATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAATTTCAAttttt < 2:687738/141‑1 (MQ=255) aacaaTTGCGTTTGATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAAGGTCAAttttt < 2:562872/141‑1 (MQ=255) aaTTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAATTTCAAtttttttt > 2:75826/1‑140 (MQ=255) aaTTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAATTTCAATTTTTTTa < 2:190078/141‑1 (MQ=255) aaTTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAATTTCAATTTTTTTa < 1:221586/141‑1 (MQ=255) ttGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAATTTCAATTTTTTTAAt < 1:130836/141‑1 (MQ=255) ttGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAATTTCAATTGTTCTaaa > 2:277102/1‑140 (MQ=255) cGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAATTTCAATTTTTTTAATCAt > 2:652647/1‑141 (MQ=255) cGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAATTTCAATTTTTTTAATCAt > 2:114650/1‑141 (MQ=255) | TCTCGATATAGTTTAAATCTTCAAGCTGTTTCATCTCATTTCTAATTGTAGCAGGACTAACATTCAAGTTATGTCGCTCAATTAGTGTTTTAGAACCAACGGGTTGTCCAAAATCAACATAATCCTCAACAATTGCGTTTAATATACTCAATTGCCTATCTGTAATCATGTTTTCACCTCATTAGCACTCACTTATCTCAAGTGCTAATTATAATTTATCAAATTGGTCAAAGTAAGTCAATGTTAAAGACTCGAAATTTCAATTTTTTTAATCAT > CP000730/1693369‑1693644 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |