| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 824,661 | Δ1 bp | 4.6% | coding (231/1071 nt) | USA300HOU_0773 ← | diguanylate cyclase GGDEF domain protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 824,660 | 0 | C | . | 4.6% | 285.0 / 9.3 | 87 | coding (232/1071 nt) | USA300HOU_0773 | diguanylate cyclase GGDEF domain protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/38); new base . (2/2); total (47/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.13e-01 | |||||||||||
CATTTTGTTTTAAAAATGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTGTCATTAAAACAGTGACATAAGCCTTAGAA > CP000730/824525‑824796 | catTTTGTTTTAAAAATGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCatat > 2:948567/1‑141 (MQ=255) atTTTGTTTTAAAAATGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATAtt > 1:283239/1‑141 (MQ=255) tttGTTTTAAAAATGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCGTATTTg > 1:541247/1‑141 (MQ=255) tttGTTTTAAAAATGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTg > 1:976299/1‑141 (MQ=255) tttGTTTTAAAAATGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTg > 2:713851/1‑141 (MQ=255) ttGTTTTAAAAATGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGt > 1:904708/1‑141 (MQ=255) ttGTTTAAAAAATGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTCGCAGATAATGTATAGACCATATTTGt < 2:684300/141‑1 (MQ=255) aaaaaTGGGCCAATACCACTTGTTAGTGCAGCAAAAACAATCAACGTAAAGCCTGATATAATCGAGTTGTTAAATACTACTACTTTAACAATTGCTACAAGTACTGTGTCAGATAAGGTTTAGACCGTATTTGGAAATTTa < 2:278177/141‑1 (MQ=255) agaTGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTAcc < 2:195097/139‑1 (MQ=255) aaaTGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTAcc < 1:501829/141‑1 (MQ=255) aaaTGGTCCAATAGCAATTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACCATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTAcc < 2:236610/141‑1 (MQ=255) aTGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTa < 2:253665/141‑1 (MQ=255) tGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTaa > 1:512668/1‑141 (MQ=255) ggTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTaaa < 1:199792/141‑1 (MQ=255) aGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATaa < 2:139766/141‑1 (MQ=255) cACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAg > 2:980973/1‑141 (MQ=255) aCTTGTTACTGCAGCACTAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTCGTTAAAAACTCCAATTCCAACAATTGCTATAAATACTGTGGCCGATCATGTCTAGACCATATCTGTAAATATCACTaaaagaagtaaaaa > 2:235077/1‑131 (MQ=255) aCTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAgg > 2:330957/1‑141 (MQ=255) ttGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGaa < 2:828367/141‑1 (MQ=255) tGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAAc > 2:341420/1‑141 (MQ=255) tGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTCTAAATCTACCTAAAAACCATAAAGGAAc > 1:77992/1‑141 (MQ=255) gTTACTGCAGCAATTACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACg < 1:756673/141‑1 (MQ=255) gTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACg < 1:756551/141‑1 (MQ=255) aCTGCAGCAATAACCATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCCTATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGAAACGAAt > 2:125115/1‑141 (MQ=255) aCTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGaac > 2:225868/1‑140 (MQ=255) aCTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATATACCTAAAAACAATAAAGGAACGaag > 2:751229/1‑140 (MQ=255) aCTGCAGCAATAACAATAAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAAt > 2:925333/1‑141 (MQ=255) tGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGA‑CATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGtt > 1:285382/1‑141 (MQ=255) tGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGA‑CATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGtt > 1:220782/1‑141 (MQ=255) gcaATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACCATAAAGGAACGAATGTTAAg < 1:668774/141‑1 (MQ=255) gcaATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAg < 1:887642/141‑1 (MQ=255) acaATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAg < 1:243736/140‑1 (MQ=255) aaCAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAAt < 2:520588/141‑1 (MQ=255) aaCAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAAt < 2:350425/141‑1 (MQ=255) aCAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAAtt > 2:845141/1‑141 (MQ=255) aCAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCAAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAAtt > 2:4852/1‑141 (MQ=255) taaaCGTAACACCTTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAaat < 2:632836/139‑1 (MQ=255) tCAACTTAACACCGTACATAAACAAGTTGTTAAATACTACAATGTCAACAATTGCTACAATTACGGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAaat < 2:214157/141‑1 (MQ=255) tCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAaat < 2:300047/141‑1 (MQ=255) tCAAAGCAACTCCGTACATAAACGAGTGGTTAACTACTACAATTTCAACAAGTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAaat < 2:249786/141‑1 (MQ=255) aaaaCGCAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCACCTTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAaat < 2:551103/139‑1 (MQ=255) aaCGTAACCCCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAaataa < 1:166764/141‑1 (MQ=255) aaCGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTCCAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGACTGATAAGTGAATTAaataa < 1:617617/141‑1 (MQ=255) aaCGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTACATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAaataa < 1:767243/141‑1 (MQ=255) aaCGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAaataa < 1:664920/141‑1 (MQ=255) cGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACACTTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATAGTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAaataatt > 1:1047992/1‑140 (MQ=255) tAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCtt < 2:424954/141‑1 (MQ=255) aaCACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTc < 1:980941/141‑1 (MQ=255) acacCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATATGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCa < 1:676435/141‑1 (MQ=255) acCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACg < 2:377307/141‑1 (MQ=255) cATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAgg > 1:278184/1‑141 (MQ=255) cATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAgg > 1:74355/1‑141 (MQ=255) cATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAgg > 1:818797/1‑141 (MQ=255) aaTCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGAt < 1:350426/141‑1 (MQ=255) gttgttAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTa > 1:443500/1‑141 (MQ=255) gttgttAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTa > 2:383359/1‑141 (MQ=255) gttgttAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGAAGGGGTa > 2:592311/1‑141 (MQ=255) gttAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGAc < 1:905634/141‑1 (MQ=255) gttAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAAAATTAACGGTAAGGGATAGGGTAGaa > 2:581681/1‑140 (MQ=255) ttAAATACTACCATTTCAACAATTGCTACAATTACGGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACa < 2:366319/141‑1 (MQ=255) ttAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACa > 2:788398/1‑141 (MQ=255) ttAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGGATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACa > 1:439852/1‑141 (MQ=255) ttAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAAGTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCTTATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGAAACGAATGTAAAGTGAATGAAATAATCTTGACGATAAggagtagtgaagaaa > 2:176551/1‑128 (MQ=255) aaaTACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGa > 2:299659/1‑141 (MQ=255) aaaTACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGa > 2:750719/1‑141 (MQ=255) aaaTACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGAGAAGGGATAGGGTAGACAGa > 1:287436/1‑141 (MQ=255) aaaTACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATGAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGa > 1:1065320/1‑141 (MQ=255) tactgcAATGTCAACAATTGCTACAAGTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGataa < 2:428380/141‑1 (MQ=255) tactacAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGataa < 1:98623/141‑1 (MQ=255) tactacAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGataa < 1:1075566/141‑1 (MQ=255) actacAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGataat > 1:663679/1‑141 (MQ=255) tacAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGataataa > 2:426058/1‑141 (MQ=255) caacaaTTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATa > 1:605566/1‑141 (MQ=255) acaaTTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGCATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATACTAAGAATGATACg > 1:76243/1‑141 (MQ=255) aTTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGA‑CATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTg < 2:220782/141‑1 (MQ=255) aTTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGA‑CATATTTGTAAAGCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGGGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGAGAGGGTAGACAGATATTAATAATGATACGATTg < 2:285382/141‑1 (MQ=255) tGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTGt > 2:697805/1‑141 (MQ=255) tGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAAACAGATAATAATACTGATACGATTGt > 2:938772/1‑141 (MQ=255) aTTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTAGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTGTAATTaaa > 1:867705/1‑141 (MQ=255) ttACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCAACCGAAAACCAATTAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTGTCATTaaaa > 1:530701/1‑141 (MQ=255) tgtgGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTGTCATTAAAACAgg > 2:278050/1‑140 (MQ=255) aTAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATACTGATACGATTGTCATTAAAACAGTGACATAAg > 1:673076/1‑141 (MQ=255) aaTGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTGTCATTAAAACAGTGACATAAGcc < 1:980973/141‑1 (MQ=255) aTGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTGTCATTAAAACAGTGACATAAGCCt > 2:841074/1‑141 (MQ=255) aTGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTGTCATTAAAACAGTGACATAAGCCt < 1:299659/141‑1 (MQ=255) aTGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTGTCATTAAAACAGTGACATAAGCCt < 2:530701/141‑1 (MQ=255) taGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTGTCATTAAAACAGTGACATAAGCCTTAGaa > 1:667348/1‑141 (MQ=255) | CATTTTGTTTTAAAAATGGTCCAATAGCACTTGTTACTGCAGCAATAACAATCAACGTAACACCGTACATAATCGAGTTGTTAAATACTACAATTTCAACAATTGCTACAATTACTGTGGCAGATAATGTATAGACCATATTTGTAAATCTACCTAAAAACAATAAAGGAACGAATGTTAAGTGAATTAAATAATCTTCACGATAAGGGATAGGGTAGACAGATAATAATAATGATACGATTGTCATTAAAACAGTGACATAAGCCTTAGAA > CP000730/824525‑824796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |