| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,489,727 | C→A | 7.4% | intergenic (+76/+77) | USA300HOU_2350 → / ← USA300HOU_2351 | hypothetical protein/hypothetical lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,489,727 | 0 | C | A | 7.4% | 277.5 / 2.2 | 93 | intergenic (+76/+77) | USA300HOU_2350/USA300HOU_2351 | hypothetical protein/hypothetical lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/49); new base A (2/7); total (37/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAACAACCATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTAACCATTGCTTGTCCAGTATAATCAACCGTTACAAT > CP000730/2489592‑2489863 | gAACAACCATTAGAATCTATTTTGTTACGGATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCaaaaa > 2:508072/1‑141 (MQ=255)gAACAACCATTAGAATCTATTTCAGAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCaaaaa > 1:708836/1‑141 (MQ=255)gAACAACCATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATACAACGTAAATTTTGATACTTTAAAATACGCaaaaa > 2:52060/1‑141 (MQ=255)gAACAACCATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAACCTTTGATACTTTAAAATACGCaaaaa > 2:662458/1‑141 (MQ=255)gAACAACCATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATTCTTTAAAATTCGCaaaaa > 2:137914/1‑141 (MQ=255)gAACAACCATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCGGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCaaaaa > 2:135205/1‑141 (MQ=255)aaacaacCATCAGCATCTACTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATATAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCaaaaa < 1:587351/140‑1 (MQ=255) aacaacCATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCaaaaaa < 2:823743/141‑1 (MQ=255) aacCATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAATCGTAATCTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACgg < 2:249351/141‑1 (MQ=255) aacCATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACgg < 1:394221/141‑1 (MQ=255) aaacATGAGAAACTATTTCACAACTTAAAAAGAATAAAATAACTTCTAATCAATAATGTTTAAATTTCCAAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTCAACTTTGATACTTAAAAAAAAAAAAAAAACgg < 2:637721/138‑1 (MQ=255) ccATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGTTa > 2:181445/1‑141 (MQ=255) ccATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTa > 2:440772/1‑141 (MQ=255) cATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTaa > 2:800961/1‑141 (MQ=255) cATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTaa > 2:223493/1‑141 (MQ=255) ttAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAACCTTTGATACTTTAAAATACGATAAACACGGTAAAc > 1:633823/1‑141 (MQ=255) tAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAAcc < 1:1005917/141‑1 (MQ=255) acaaTCGATTTAAAAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAAccc < 2:599936/139‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAAccc < 2:457484/141‑1 (MQ=255) aaacaaattCACAAATTACATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTGAAATTTCTCAGGGGCAGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATAATAAAAAAAAAAAAAAAAACGGTAAACCCTa < 1:141040/134‑1 (MQ=255) tATTTCACAACTTATATTGTCTAAGTTGACATCTAATCAATAGAGGTTAAATTTCTCTGTGGCTGTGACTGAGGATTAAAAGTACTATATGATGTAAACTTTGATACTTTAGAATACGCAAAAAACGGCAAACCCGGATTc > 2:365236/1‑141 (MQ=255) tttCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCat > 1:662233/1‑141 (MQ=255) aaaCTTGTATTGTCTAAGGAGAAATATAATAAATATTGTTTAATGTTCTCAGTTGCTGTGCATAAGATTTACCAGTACTACTAGACGGAAACTTTGATACTTAAAAAAACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCAtattat < 2:333384/140‑1 (MQ=255) aaCTTATATTGGCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAACCCCTAATTCATATtata < 1:588983/141‑1 (MQ=255) aCTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATag > 1:928971/1‑141 (MQ=255) tttcagtggcaatttAATCAATAGTTTTTAAAGTTCACAAGAGCTCGGACGAAGATTCAAAAGTACTATAAAACGGAAACTTTAATAAATAAAAAAAAAAAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGt < 2:748379/127‑1 (MQ=255) tCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGt < 1:221541/141‑1 (MQ=255) aaGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGtttt < 1:680327/141‑1 (MQ=255) aaGATGACATCTAATCAAAAGTGTTTAAATTTAACAGTGGCTAGCAATAAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAAACTTGAAACTAAAAAAAAAACAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGtttt < 2:477313/141‑1 (MQ=255) aTGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTAtt > 1:1023326/1‑141 (MQ=255) aTGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTAtt > 2:202258/1‑141 (MQ=255) actttaaaTTAATAGTGTTGAAAATTCTCATTGTTTGTGAAATAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTACACTTTGATACATTAAAAAAAGAAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTAttttt < 2:919974/135‑1 (MQ=255) aCATTTAATCAATAGTATTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAGCCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTAttttt < 2:168891/141‑1 (MQ=255) cATCTAAGCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTAtttttt < 1:1013268/141‑1 (MQ=255) aTCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTa < 1:685838/141‑1 (MQ=255) tCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTaa > 2:626084/1‑141 (MQ=255) tAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATTAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACt < 2:664724/141‑1 (MQ=255) tAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACt < 2:12956/141‑1 (MQ=255) tAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACt > 2:340506/1‑141 (MQ=255) tAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACt < 2:870670/141‑1 (MQ=255) tAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACt < 1:849603/141‑1 (MQ=255) caaTCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACAGTTTTATTTTTTAACt > 2:459228/2‑141 (MQ=255) aaTCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACtt < 1:1101933/141‑1 (MQ=255) aaTCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACtt < 1:347448/141‑1 (MQ=255) taaaTAGTGTTTAAATTTCTCAGTTGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAATCTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGc < 2:851604/139‑1 (MQ=255) tCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGc < 2:833920/141‑1 (MQ=255) tCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGAAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTATACCGTTTTATTTTTTAACTTGc > 2:700277/1‑141 (MQ=255) tCAATAGTGTTTAAAATTCTCAGTGACTATTAAGAACGTTTAAAAGCAATTTAAAACGTAAACTTAGATACTAAAAAAAAAAAAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGc < 2:18193/141‑1 (MQ=255) ataaTAGTGTTTAAATTTCGCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGc < 2:749653/139‑1 (MQ=255) acAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGc < 2:18100/140‑1 (MQ=255) acAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGc < 2:909331/140‑1 (MQ=255) acAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAAAGAGGTTAAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGAAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGc < 2:371477/140‑1 (MQ=255) aTAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGcatc > 1:234340/1‑141 (MQ=255) gtgtTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTCTAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTCCATCATa > 2:1025916/1‑141 (MQ=255) gtgtTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTCTAGAGTTAACCGTTTTCTTTTTTAACTTGCTTCATa > 2:1025977/1‑141 (MQ=255) gtgtTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGcatcatt > 2:991744/1‑140 (MQ=255) gtTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGt < 2:928971/141‑1 (MQ=255) gtTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGt < 1:285466/141‑1 (MQ=255) gtTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTAGAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAATCCCGAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGt < 1:472106/141‑1 (MQ=255) aaaTTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTtata < 2:234340/141‑1 (MQ=255) tttCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTa > 1:755003/1‑141 (MQ=255) ttCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTaa < 2:770512/141‑1 (MQ=255) ttCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTaa < 1:959335/141‑1 (MQ=255) ctcAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACa > 1:823382/1‑141 (MQ=255) gtgAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTgg > 2:536805/1‑141 (MQ=255) tattatgattAATATTACTATAAAAAGTAAACTTTGATACTTTAAATTACGCAATAAACCGTAATTCCTAACTCATATTATAAAAGTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATATTTATATTACCATCATTGTTGGTAg < 2:297143/133‑1 (MQ=255) aagtaGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATCCATATTATATAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCAACATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAg < 2:150117/137‑1 (MQ=255) aaTGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAg < 2:18618/141‑1 (MQ=255) agAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTATTTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGtt < 2:378134/140‑1 (MQ=255) gAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGttt > 1:1000576/1‑141 (MQ=255) gAGGTTTAAAAGTACGATAAAACGTCAACTATGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGAAAACCCTAATTCGTAATAAAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGttt > 2:514060/1‑141 (MQ=255) ggttAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGa < 1:793873/139‑1 (MQ=255) gTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGa < 1:135205/141‑1 (MQ=255) gTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTATTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGa < 2:708836/141‑1 (MQ=255) gTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATGATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGa < 1:507688/141‑1 (MQ=255) tttAAAAGTACTATACAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAACTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGAt > 1:824809/1‑141 (MQ=255) tAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCa > 2:828907/1‑141 (MQ=255) aaaGTACTATAACACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCCAAAAACGGTATACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGCTTTATATTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGt < 2:423797/141‑1 (MQ=255) aaaGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGt < 2:977912/141‑1 (MQ=255) aaaGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGt < 1:20062/141‑1 (MQ=255) aaGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTa > 2:820170/1‑141 (MQ=255) aaGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTa > 1:387102/1‑141 (MQ=255) aGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTaa > 2:281400/1‑141 (MQ=255) ataAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTAACCATTg < 1:828907/141‑1 (MQ=255) aataCGTAAACTTTGATACTATAAAATAAGAAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTAACCATTGCt < 2:797555/138‑1 (MQ=255) aaCGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTAACCATTGCTTg < 2:198024/141‑1 (MQ=255) aaCGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTAACCATTGCTTg < 2:895805/141‑1 (MQ=255) aaCTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAAGTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTAACCATTGCTTGTCAAGt > 2:1037919/1‑141 (MQ=255) aCTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTAACCATTGCTTGTCCAGta > 1:621965/1‑141 (MQ=255) tttGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTAACCATTGCTTGTCCAGtata < 1:223493/141‑1 (MQ=255) tttGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTAACCATTGCTTGTCCAGtata < 1:800961/141‑1 (MQ=255) tGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTAACCATTGCTTGTCCAGTATAAt < 2:662233/141‑1 (MQ=255) tACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGTTAGTTTGGATCAGTAACCATTGCTTGTCCAGTATAATCAACCGTTACAAt > 2:192791/1‑141 (MQ=255) | GAACAACCATTAGAATCTATTTCACAACTTATATTGTCTAAGATGACATCTAATCAATAGTGTTTAAATTTCTCAGTGGCTGTGAATGAGGTTTAAAAGTACTATAAAACGTAAACTTTGATACTTTAAAATACGCAAAAAACGGTAAACCCTAATTCATATTATAGAGTTTACCGTTTTATTTTTTAACTTGCATCATAGTTATATTAACATTATTGTTGGTAGTTTGGATCAGTAACCATTGCTTGTCCAGTATAATCAACCGTTACAAT > CP000730/2489592‑2489863 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |