| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,519,798 | T→A | 3.5% | S278S (TCA→TCT) | narG ← | nitrate reductase alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,519,798 | 0 | T | A | 3.5% | 533.8 / 5.2 | 170 | S278S (TCA→TCT) | narG | nitrate reductase alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (74/90); new base A (3/3); total (77/93) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
AAGCGTTCATTAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCT > CP000730/2519658‑2519937 | aaGCGTTCATTTGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACt < 1:317653/141‑1 (MQ=255)aaGCGTTCATTAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACt > 2:352866/1‑141 (MQ=255) gCGTTCATTAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGa > 1:894755/1‑141 (MQ=255) ttCATTAGGTTGATTAACATACTGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAAt < 2:107822/141‑1 (MQ=255) ttCATTAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCGTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAAt < 2:154165/141‑1 (MQ=255) cATTAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAACATAACATGCGTCATTGCTTGTGCACTTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCAAGTTATCTGCAAATTTCACATTTCCTGCGTACTCTGGTGCTACTGAAATGa < 2:924987/141‑1 (MQ=255) aTTAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGGATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCTAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACAGAAATGAc > 1:793780/1‑141 (MQ=255) aTTAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGAc > 1:823885/1‑141 (MQ=255) aTTAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACAGAAATGAc > 1:123417/1‑141 (MQ=255) aTTAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTAATGAAATGAc < 1:810550/141‑1 (MQ=255) aTTAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTAGAGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACAGAAATGAc > 1:984162/1‑141 (MQ=255) aTTAGGTTGATCAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGAc < 1:925941/141‑1 (MQ=255) ttAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACt < 2:980278/141‑1 (MQ=255) ttAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACt < 1:339646/141‑1 (MQ=255) ttAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACt < 1:27048/141‑1 (MQ=255) tcggTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACtt < 2:300770/139‑1 (MQ=255) tAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAGTGCCtt > 1:343878/1‑141 (MQ=255) ggTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGCACAAGGTTGCTGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACtttt < 1:529262/141‑1 (MQ=255) ggTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACtttt < 1:705846/141‑1 (MQ=255) ttAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCt > 2:855069/1‑141 (MQ=255) ttAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTAGtccat > 2:158395/1‑137 (MQ=255) tAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCtt > 1:430152/1‑141 (MQ=255) aCATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGCAATGACTTTTGTACCTTta > 2:634629/1‑141 (MQ=255) aCATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTACAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCtttt > 1:176369/1‑140 (MQ=255) cATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTATTGAAATGACTTTTGTTCGtttgt > 2:218790/1‑139 (MQ=255) cATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGCAATGACTTTTCTACATTtat > 2:710521/1‑141 (MQ=255) cATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTtat > 2:379539/1‑141 (MQ=255) actGTTCTTGTAAAATAACATAAGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACAAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTCTCTGCAAATTTAACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGAGTTTTGTACCttaagaga > 2:938863/3‑135 (MQ=255) tGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCgg < 1:162874/141‑1 (MQ=255) ttcctctAAAACAACAAGCCCCATTGCTTCTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATCTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGCAc < 2:896629/135‑1 (MQ=255) ttCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCTTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGAc < 2:588012/141‑1 (MQ=255) cTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCgggttt < 2:557705/141‑5 (MQ=255) tGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCa < 2:331847/141‑1 (MQ=255) gTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAg < 1:958321/141‑1 (MQ=255) gTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAg > 1:669233/1‑141 (MQ=255) taaaTAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTc < 2:368078/140‑1 (MQ=255) aaaaTAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTc < 2:1098900/141‑1 (MQ=255) aaaaTAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTc < 2:781385/141‑1 (MQ=255) aaaTAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTCTAGCGGACTTCAGTCa > 2:689325/1‑141 (MQ=255) aaaTAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCGACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATGACGGCCTTCAggaa > 1:287690/1‑138 (MQ=255) cATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAAt < 2:669233/141‑1 (MQ=255) aTGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAAtg < 2:904132/141‑1 (MQ=255) tGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGGCTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAAtgt < 2:523938/141‑1 (MQ=255) gCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAAtgtg > 1:66882/1‑141 (MQ=255) gCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTAAtgatatttg > 2:224486/1‑133 (MQ=255) tGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCgg < 1:988036/141‑1 (MQ=255) tGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCgg < 2:327827/141‑1 (MQ=255) tGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCgg > 1:96144/1‑141 (MQ=255) gCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGa > 1:201764/1‑141 (MQ=255) gCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGtcagg > 1:903724/1‑137 (MQ=255) cAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACgtg < 2:96144/141‑1 (MQ=255) aTTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTCCGTGtt > 2:371968/1‑141 (MQ=255) tGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTaa < 1:1008510/141‑1 (MQ=255) tGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTaa > 2:472646/1‑141 (MQ=255) tGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTaa > 1:950852/1‑141 (MQ=255) cagcaTCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGGGTTAAAg > 2:26538/1‑141 (MQ=255) agcaTCTGAACCAGGATTAGGTGCTAGAAAGTTATTTGGAAATTTCACATTTTCTGTGGAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTAACTTTATAGCGGAATTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAgg > 2:397921/1‑141 (MQ=255) agcaTCTGAAACAGGCATCGGTACTAGCCGGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTATACCTTTATAGCGGACTTCGGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAga > 2:952292/1‑140 (MQ=255) gcaTCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGCGTACGTGTTAAAGGt < 1:552834/141‑1 (MQ=255) tCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGCCTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAACGGtccc > 2:541424/1‑138 (MQ=255) tCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGGTAAAGGTACa > 1:446022/1‑141 (MQ=255) tGAACCCGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACAtt < 1:63110/141‑1 (MQ=255) tGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACAGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACAtt < 2:123417/141‑1 (MQ=255) tGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGAGCTACAGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACAtt < 2:793780/141‑1 (MQ=255) ggAACCAGGATGCGGTGCTAGTCAGTTAGCGGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACAtt < 1:296517/140‑1 (MQ=255) gAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAGGGTACATTa < 1:811948/141‑1 (MQ=255) gAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTa < 2:658022/141‑1 (MQ=255) aaCCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTag > 2:293874/1‑141 (MQ=255) aaCCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGCGTTAAAGGTACATTag < 1:550665/141‑1 (MQ=255) ccAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGGTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTagag > 1:861487/1‑141 (MQ=255) gATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGcccc < 2:430152/141‑1 (MQ=255) tCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCcaca < 1:891984/141‑1 (MQ=255) tCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCcaca < 1:372513/141‑1 (MQ=255) cTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTTTTTTTTTATTGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGCGCCCCACAtaataa > 2:415335/1‑141 (MQ=255) tAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATaataat < 2:18589/141‑1 (MQ=255) aGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATg > 1:726519/1‑141 (MQ=255) aGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATg > 1:257451/1‑141 (MQ=255) cAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑Tat > 2:103386/1‑141 (MQ=255) gTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑Tatga < 2:1057171/141‑1 (MQ=255) ttATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑Tatgat > 2:168547/1‑141 (MQ=255) ttATCTCCAAATTCCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑Tatgat < 1:367252/141‑1 (MQ=255) aTCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAAGG‑Tatgatgg > 2:1089381/1‑140 (MQ=255) cTGCAAGTTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCAGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGt > 2:694763/1‑141 (MQ=255) cTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGCGTACGGGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGt > 1:748586/1‑141 (MQ=255) aaTTTCACCTTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATAc < 1:233286/141‑1 (MQ=255) aaTTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATAc < 1:740913/141‑1 (MQ=255) aaTTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATAc < 2:513418/141‑1 (MQ=255) aTTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATAcc > 1:4869/1‑141 (MQ=255) caTTTTCTGCGTAATCTGGTGCGACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATCGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATACCAGTCAc < 1:224367/141‑1 (MQ=255) cttgtcagcttcggcTGGTGCTGCTGAACTTACTTTTGTCGCTTTATAGCTGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTTTTACAGTTACATTAGAGCCCCACCCAA‑AATGTTTTGATGCGTTATACCAGTCACt < 2:783617/127‑1 (MQ=255) ttttCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATACCAGTCACtt < 1:168547/141‑1 (MQ=255) ttatCTGCGTAACCGGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTAGAGCGGACTTCAGTCAGAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTGCATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATACCAGTCACtt < 2:716121/138‑1 (MQ=255) tttCTGCTGAATCTTGTGTCACTGAAATGACTTTTGTCCCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAACTGTGCATTCGGAGGACGTCTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACAGAATAATG‑TATGATGCGTTATACCAGTCACTTg < 2:147710/141‑1 (MQ=255) cTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGGCTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTGATAAATTGTGCATCCGGAGCACGTGTTACTGGTACAGGAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTCATACCAGTCACTTGAtc > 1:1037610/1‑140 (MQ=255) cTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATACGG‑TATGATGCGTTATCACAGTCACTTGCtt > 2:900453/1‑141 (MQ=255) cTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATACCAGGCACTTTAtt > 2:585426/1‑141 (MQ=255) gttcTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGCACTTCATTCATAAAAGGTGCAGCCGGAGTACGTGTTAACGGTACCTTAACACCCACCCTTATCTTG‑GAGGATGCGTTATACCAGTCTCTTGATTCAGGCACATCTg < 2:124660/138‑1 (MQ=255) tatatGAACTTACTTTTGCACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTCCATTCGGAGTACGTGTTAAAGGTATATTAGCGCCCAGCCATCTAATC‑TAGCCAAAGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGttt < 2:671767/137‑1 (MQ=255) aCTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGc > 1:75258/1‑141 (MQ=255) cTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGct > 2:654099/1‑141 (MQ=255) | AAGCGTTCATTAGGTTGATTAACATAATGTTCTTGTAAAATAACATGCGTCATTGCTTGTGCAATTGCAGCATCTGAACCAGGATTCGGTGCTAGCCAGTTATCTGCAAATTTCACATTTTCTGCGTAATCTGGTGCTACTGAAATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATG‑TATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCT > CP000730/2519658‑2519937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |