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1:3485/141‑1 (MQ=255) aTCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAGCCCGGGACTAATGTAGGAAGAAAAAGCATAAA‑AATCTAATTACAAATGGCGTAt > 1:250171/1‑141 (MQ=11) aTCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAA‑AAGCTAATTACAAATGGCGTAt > 1:274894/1‑141 (MQ=38) cGTGATATATCCGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAA‑AAGCTAAGTACAAATGGCGTATtg < 1:882555/141‑1 (MQ=255) tGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAA‑AAGCTAATTACAAATGGCGTATtgat < 1:465924/141‑1 (MQ=40) gATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGACGAAAAAGGATAAA‑AAGCTAATTACAAATGGGGTATtgatg < 1:810176/141‑1 (MQ=255) gATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAA‑AAGCTAATTACAAATGGCGTATtgatg > 1:944243/1‑141 (MQ=40) atatCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTtata > 2:219910/1‑86 (MQ=255) cTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATGAACTTTATAAGAAAAAGAATAAACAAGGAAAATAGAAATGGCGTATTGATGAGAGGt > 1:145626/1‑141 (MQ=11) aaTATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAA‑AAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATc < 2:974772/141‑1 (MQ=40) | ATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAA‑AAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAA > CP000730/76182‑76461 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |