| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 785,677 | G→T | 7.3% | A27E (GCA→GAA) | exsB ← | ExsB family post‑transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 785,677 | 0 | G | T | 7.3% | 370.3 / 3.1 | 125 | A27E (GCA→GAA) | exsB | ExsB family post‑transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (49/65); new base T (9/2); total (58/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.32e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCG > CP000730/785539‑785817 | gtgtTAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCAt < 2:673007/141‑1 (MQ=255) tgATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTAATTCCTTGCTATTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTTAGAATCATTTATTTGGCCATAATTAAACGTGACGAGATCAACTTCGGTGAACTG‑TATTGTTGCATa > 2:586847/1‑141 (MQ=255) taatGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAagag < 1:881194/141‑1 (MQ=255) aatGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAgaga < 2:905643/141‑1 (MQ=255) tatCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACAtgttg < 1:328286/141‑1 (MQ=255) tatCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACAtgttg < 1:1014560/141‑1 (MQ=255) tatCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACAtgttg < 1:879056/141‑1 (MQ=255) tCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAAAG‑ATTTTTTGCATAAAAGAAACATGTTGTa > 2:498358/1‑141 (MQ=255) cTAAAACGTGATGTTTCCTAGATTGATCTGGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATTTTGTAc > 1:265445/1‑141 (MQ=255) cTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCTACTTTTTGTTAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTAc > 1:852033/1‑141 (MQ=255) aaaaCGTTACGTTTCATTCCTTTATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGGACTg < 2:766997/141‑1 (MQ=255) aaaaCGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTAcgt > 2:168163/1‑139 (MQ=255) aaaaCGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTg < 2:934347/141‑1 (MQ=255) aaCGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTc < 2:851458/141‑1 (MQ=255) ggTGAGGTTTCAGTGCTTGATCTTGTGCAATGTGTTTTGCGACTTCAATGTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAAGG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCtt < 2:450509/140‑1 (MQ=255) cGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCtt < 1:1004905/141‑1 (MQ=255) gTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATATTATCTTTGGCAATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTg < 1:803259/141‑1 (MQ=255) tGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCttta > 2:408587/1‑139 (MQ=255) gATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTAAAATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGac > 1:258413/1‑141 (MQ=255) tttCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGTTTTTTTTTGACATGTTGTACTGTCTTGacctcc > 2:880816/1‑141 (MQ=255) tttCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAACGAGACATGTTGTACTGTCTTGaccacc > 1:436630/1‑141 (MQ=255) tCCTTGACCCTGTGCAATTTGGTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTaaa < 1:42506/141‑1 (MQ=255) ccTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTTTTTTTTTTTGATATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTGAAg > 2:111508/1‑141 (MQ=255) ccTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGCTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAg > 1:76214/1‑141 (MQ=255) ttGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGAc < 2:366084/141‑1 (MQ=255) ttGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACCTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGAc < 1:570958/141‑1 (MQ=255) aggATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGTCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATC‑TTTTTTTGCATAAAAAAGACATGTTGTACTATCTTGCCCACCACTAAAGAc > 2:407704/3‑141 (MQ=255) aTCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAAc > 1:11865/1‑141 (MQ=255) ttGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCTATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGAt < 2:691559/141‑1 (MQ=255) tgtgCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTTTATTTAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATg > 2:613349/1‑141 (MQ=255) tgCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGc < 2:440643/141‑1 (MQ=255) ttaTTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGTGACATGTTGTACTGTTTTGACCACCTCTAAAGGCAACGATGGCtt < 2:188430/139‑1 (MQ=255) ttGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCtttttt > 2:624261/1‑140 (MQ=255) ttttGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACAACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCagt > 1:60843/1‑139 (MQ=255) tttGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTTTTTATATTTGACATGTTGTACTGTCTTGACTACCATTAAGGACAACACTGGTTTTTTCattt > 2:164407/1‑140 (MQ=255) tttGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTATGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCCCTAACGACAACGATGGCTTTTTCttta > 2:236132/1‑141 (MQ=255) ttGCGACTTCAATTCCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCattat < 1:998832/141‑1 (MQ=255) tGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTTTTTTTTTTTGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAATGACAACGATGGCTTTTTCattatt > 2:294231/1‑141 (MQ=255) gCGACTTCAATTTCAGTATCATTTCTTTGGCCATAATTTAGCGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTCTTTCATTAttt < 2:376947/141‑1 (MQ=255) aCTTCAATTGCAGTATCACGTCTTTGGACATAATTAAACCTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACAGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAAt < 2:840955/141‑1 (MQ=255) ttCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAAATTTTTTGAAATG‑GTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATac > 1:208359/1‑141 (MQ=255) ttCAATTTCAGTATCAAGCATTAGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATac > 1:814803/1‑141 (MQ=255) aTTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATGTTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACt > 1:894856/1‑141 (MQ=255) aTTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACATTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACtt > 1:1051012/1‑141 (MQ=255) tttCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACttt < 2:529728/141‑1 (MQ=255) tCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTcc > 1:340325/1‑141 (MQ=255) tCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTcc > 2:202101/1‑141 (MQ=255) aGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGAGCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCTTTTTTTAATAGACTCTCCAt > 2:1064979/1‑141 (MQ=255) gTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCAtt < 2:968916/141‑1 (MQ=255) gTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCAtt < 1:147418/141‑1 (MQ=255) cATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGt < 2:880831/141‑1 (MQ=255) cATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGt > 1:910629/1‑141 (MQ=255) cATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGt > 1:942638/1‑141 (MQ=255) cATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGt > 1:683582/1‑141 (MQ=255) cATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGt < 1:178497/141‑1 (MQ=255) cATGTCTTTGGCCATAATTAAAAGTTTCTAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGt > 1:535868/1‑141 (MQ=255) cATGTCTTTCGCTATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTTAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTTTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGt < 2:749827/141‑1 (MQ=255) aaTGTCCTTGGCCATCATTAAACGGTACGAATTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATATAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGt < 1:248134/140‑1 (MQ=255) gTCTTTGGCCATTATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGGTTTT‑TTTTTTCTTTTACTACTGATTGTTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAAt < 2:778944/141‑1 (MQ=255) gTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAAt < 1:324783/141‑1 (MQ=255) tGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTc < 2:441037/141‑1 (MQ=255) tGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTc < 2:848014/141‑1 (MQ=255) cATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCTTAt > 2:1079652/1‑141 (MQ=255) aTAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTTTTTTTTTTTGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGTCAACCAGGGCTTTTTCATTATTCAATTCAATTTCCTGTTTCTCATTGCTCatatt > 2:24095/1‑140 (MQ=255) tAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGCAATG‑TTCTTCTTCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCa < 1:851966/141‑1 (MQ=255) aaTTAAACGTTACGAGTTCAACTTGTTTGAAATG‑TTTTTTTTCATAATAGGGACAGGTTGTACTGTCTTGACAACCACTAAAGATGACGATGGCTTATTCATTATTGAGTTCTCGTTCAATTTTGTAATTTCTCATATCAt > 2:1002619/1‑141 (MQ=255) aaaCGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAAAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATtaat > 1:757796/1‑141 (MQ=255) aaCGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGTTAGATTGTGCTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATtaata > 1:156503/1‑141 (MQ=255) aaCGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCCATAAAAACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATtaata > 2:119024/1‑141 (MQ=255) aaCGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCTTTTTGTACTTCCTCCTATCATtaata > 1:864585/1‑141 (MQ=255) agTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTaataat < 1:669428/140‑1 (MQ=255) cttACGAGTTCAACTTCTTTTTAATG‑TTTTTTCGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGAAGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAataata < 2:942638/140‑1 (MQ=255) ttACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑‑TTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAGTAtt < 1:755220/141‑1 (MQ=255) tACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATAtt < 2:886771/141‑1 (MQ=255) tACGAGTTCAACCTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGGTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATAtt < 1:182905/141‑1 (MQ=255) aCGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATta > 1:1063139/1‑141 (MQ=255) cGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATtaa < 1:338429/141‑1 (MQ=255) gTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATtaataa > 1:589344/1‑141 (MQ=255) tCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATaaaa > 2:633298/1‑140 (MQ=255) tCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAag < 1:1028124/141‑1 (MQ=255) tCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAag < 1:625050/141‑1 (MQ=255) tCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAag < 1:1021463/141‑1 (MQ=255) aCTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAgg < 1:880816/141‑1 (MQ=255) gAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAAGGATGGCGTTTTCAGGATTTTATACAGTGTCCACGTGGTAAATGCTGTGATGATTAATAATGTTAGTAAAGAGGGTAAttga > 1:1059117/1‑138 (MQ=255) aaaTG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTTCTGTCTTGACCACCACTCTAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCAATTTTGTAATTGCTCCTTTCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCa < 2:729912/141‑1 (MQ=255) aaaTG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCa < 2:61608/141‑1 (MQ=255) aaaTG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGAGAGCCGTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCa < 1:1088424/141‑1 (MQ=255) aTG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGCTGTCTTTTTCATTATTTAATACACGTTCCATTTTGTAATTGCTCTTATCATTAATAATATTAATAACGAGTATAATGGCttt > 1:836236/1‑141 (MQ=255) aTG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGATGTTAATGGCAtt > 1:522463/1‑141 (MQ=255) aTG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCAtt > 2:518014/1‑141 (MQ=255) aTG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCAtt > 1:537055/1‑141 (MQ=255) ttttttttCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGAt < 1:184757/141‑1 (MQ=255) tttttttGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACAATGTCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGAt < 1:752896/141‑1 (MQ=255) ttttttGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATa > 1:86403/1‑141 (MQ=255) tttttGCATAAAAGAGATATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGATTAATGGCATTGATaa < 1:547748/141‑1 (MQ=255) tttttGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATaa < 1:375734/141‑1 (MQ=255) ttttcGCATAAATGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTACAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCAATTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAGAGAGGTTACTGGCATTGATaa < 1:571472/141‑1 (MQ=255) tttGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGc < 2:683582/141‑1 (MQ=255) ttGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGcc > 1:977561/1‑141 (MQ=255) gCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCg < 2:11865/141‑1 (MQ=255) | TGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATG‑TTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCG > CP000730/785539‑785817 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |