New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GAACATATAAGATAGAGAAATAAACTAGTGGCCGATTGTGCTTGATGAGCTTGGGACATAAATCCTAACTCGAAATAAATAAGCATATCACTAAACTGATTTTTTAAAGTTTACAGTGATATGCTTATTTTTTTATCTTACGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCTTACTGAGATTATACTAAT > CP000730/36954‑37234 | taacgtacctcttatctgtcattttactgagaactgcttttaacaaacctcttatctgcaattttacttagaattgcttttactattactcttattagtatactctcagttagaatgagtataaaaatgtaaataataacc < 2:414219‑M1/1‑1 (MQ=255) taacgtacctcttatctgtaattttactgagaactgcttttaacaaacctcttatctgcaattttacttagaattgcttttactattcctcttattagtataatctcagtaagaatgcgtataaaaatgaaaattacaacc < 2:43876‑M1/1‑1 (MQ=255) taacgtacctcttatctgtaattttactgagaactgcttttaacaaacctcttatctgcaattttacttagaattgcttttactattcctcttattagtataatctcaataagaatgcgtataaaaatgaaaattacgacc < 2:634032‑M1/1‑1 (MQ=255) aacgtacctcttatctgtaattttactgagaactgcttttaacaaacctcttatctgcaattttacttagaattgcttttactattcctcttattagtataatctcagtaagaatgcgtataaaaatgaaaattacaacCg < 2:386018‑M1/2‑1 (MQ=255) 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tGCTTATTTTTTTATCTTACGATTTTATACGTGCATGCTGGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTc < 2:405025/141‑1 (MQ=255) gCTTATTTTTTTATCTTACGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCt < 1:882546/141‑1 (MQ=255) aTTTTTTTATCTTACGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCTTACt < 1:618152/141‑1 (MQ=255) tttttttATCTTACGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCTTACTg < 2:388239/141‑1 (MQ=255) tttttATCTTACGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCTTACTgag < 1:808480/141‑1 (MQ=255) tttttATCTTACGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCTTACTgag < 1:176637/141‑1 (MQ=255) tttATCTTACGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCTTACTGAGAt > 1:873349/1‑141 (MQ=255) tttATCTCACGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCTTACTGAGAt < 2:666181/141‑1 (MQ=255) tCTTACGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCTTACTGAGATtata < 1:278916/141‑1 (MQ=255) tCTTACGATTTTGTACGGGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCTTACTGAGATtata < 2:368561/141‑1 (MQ=255) aCGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCCTTCTTACTGAGATTATACtaa < 1:486930/141‑1 (MQ=255) CGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCTTACTGAGATTATACtaat > 2:386697‑M1/1‑141 (MQ=255) | GAACATATAAGATAGAGAAATAAACTAGTGGCCGATTGTGCTTGATGAGCTTGGGACATAAATCCTAACTCGAAATAAATAAGCATATCACTAAACTGATTTTTTAAAGTTTACAGTGATATGCTTATTTTTTTATCTTACGATTTTGTACGTGCATGCTTGCCTAGGGGTATGGCTCGAGCCATTAGTCTCTCGCACATACTATTCCCTCAGGCGTCAGCACTTACAAAATCGGTTGTAATTTTCATTTTTATACGCATTCTTACTGAGATTATACTAAT > CP000730/36954‑37234 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |