| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 1822717 = | 60 (0.770) | 3 (0.040) | 3/238 | NT | 5.5% | intergenic (+38/+208) | USA300HOU_1697/ackA | possible universal stress protein/acetate kinase |
| ? | CP000730 | 1822745 = | 49 (0.680) | intergenic (+66/+180) | USA300HOU_1697/ackA | possible universal stress protein/acetate kinase | |||||
GTACTGAAGAGTTACCAGCAGACTTCCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCCTACATAT > CP000730/1822606‑1822885 | gTACTGAAGAGTTACCAGCAGACTTCCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGtttt > 2:808929/1‑141 (MQ=255) aCTGAATAGTGACCAGCAGATTTTCAACTACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGtttttt < 2:30033/141‑1 (MQ=255) cTGAAGAGTTACCAGCAGACTTCCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGCTAATTTGAGGACTACGTGATCATTATGAGCCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGttttttt > 1:178196/1‑140 (MQ=255) cTGAAGAGTTACCAGCAGACTTCCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGtgttttt > 1:707642/1‑140 (MQ=255) cTGAAGAGTTACCAGCAGACTTCCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTa > 1:764306/1‑141 (MQ=255) aaGAGTTACCAGCAGACTTCCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTAttt > 2:353382/1‑140 (MQ=255) actagtgtaatgtctcttttcacgaatatcttaaagaattaagtagtcgaagaagattatgaaaacattattaagtgagttttatttataaacaataaaaaaccaagtgcaactttctgcacttggttTTTTATTGTTtat < 1:917722‑M2/13‑1 (MQ=255) aCCAGCAGACTTACAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTataa < 2:157652/141‑1 (MQ=255) ccAGCAGACGTCCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTataaa < 1:465600/141‑1 (MQ=255) agACTACCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATaaaa < 2:599191/141‑1 (MQ=255) gACTTCCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAAc > 2:40075/1‑141 (MQ=255) aaCTTCCAACCAAAAGTTGCAACAATTTAATTACGTTAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGTTAACTACTTGACCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTGTTTTATTGTTTATAAAGAAAAc < 2:780901/140‑1 (MQ=255) aCTTCCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACt < 1:393283/141‑1 (MQ=255) gtctcttttcacgaatatcttaaagaattaagtagtcgaagaagattatgaaaacattattaagtgagttttatttataaacaataaaaaaccaagtgcaactttctgcacttggttTTTTATTGTTTATAAATAAAACTc > 2:821979‑M2/118‑141 (MQ=255) gtctcttttcacgaatatcttaaagaattaagtagtcgaagaagattatgaaaaaattattaagtgagttttatttataaataataaaaaaccaagtgcagaaagtggaactgggttTTTTATTGTTTCTAAATAAAActa > 1:821979‑M2/118‑140 (MQ=255) ttCCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGAGCATTAGATAGCTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATATATAAAACTcc < 2:163950/141‑2 (MQ=255) aCCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTtaa > 1:478549/1‑141 (MQ=255) ccACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTTCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTtaat < 1:577276/141‑1 (MQ=255) ccACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATAAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTtaat > 2:924821/1‑141 (MQ=255) ccACAAATAGCAACGGCACAATTACGTAAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTTCAACTTTCTGCGTTTGTTTTTTTATTGTTTATAACTTAAACTTACTtaaa > 2:86259/1‑140 (MQ=255) agacaAGTAGCAACAACTGGATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAGGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTtaat > 2:86117/3‑141 (MQ=255) caAGTAGTAACAACTAAATTACGTTAAAAATATAAAAATTAAATTTCGCTGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAAACAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTAGTGTTTATAAATAAAACTCACTTaataat < 1:923835/141‑1 (MQ=255) aaaGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTaataat < 2:768173/140‑1 (MQ=255) aacTCAATTACGTTAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTATGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAAt < 2:54545/141‑1 (MQ=255) cGTAAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGac < 1:900775/141‑1 (MQ=255) gTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGact < 2:766693/141‑1 (MQ=255) gTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGact > 2:505931/1‑141 (MQ=255) aaaaaTATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGactact < 2:478549/141‑1 (MQ=255) aaaaTATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTCATAATGTTTTCATAATCTTCTTAGACTACtt > 2:431711/1‑141 (MQ=255) tatCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGCTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAAtt > 1:655156/1‑141 (MQ=255) tCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCt > 2:490972/1‑141 (MQ=255) aaTTAAACAGAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTaa < 2:175792/141‑1 (MQ=255) ttAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGa < 2:336244/141‑1 (MQ=255) aaTATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGatat > 2:35212/1‑141 (MQ=255) atatAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGAGAtt > 1:650234/1‑141 (MQ=255) tcgatgatCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAATCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCGTAATCTTCTTCGACTACTTAATTATTTAAGATATTCGt < 1:524500/139‑1 (MQ=255) taGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCTAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGt < 1:613511/141‑1 (MQ=255) cATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAagag < 2:655156/141‑1 (MQ=255) tagttttatttagaaacaataaaaAACCCAGTTCCACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTATTTATAAATAAAACTCACTTAATAATTTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGAc > 1:821979‑M1/25‑141 (MQ=255) gagttttatttataaacaataaaaAACCAAGTGCAGAAAGTTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGAc > 2:821979‑M1/25‑141 (MQ=255) tagataagccgttGAGCATTATGAACCAAGTCAGTCCTTCGGCACTTGGTTCACCCCGCTGTATGAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACa > 2:906340/12‑141 (MQ=255) tAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGCCa > 2:659440/1‑141 (MQ=255) gATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACAtt < 1:939517/141‑1 (MQ=255) gATAACTACTGTTTCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGCTGCTTGTTTTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACAtt < 1:358218/141‑1 (MQ=255) aTAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTa > 2:163890/1‑141 (MQ=255) tAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTac > 1:480071/1‑141 (MQ=255) aaCTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAACTAAAACTCACTTAATAATGTTTTCCTAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGACAAGACCCATTacc > 2:409524/1‑140 (MQ=255) tactTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTa < 1:274481/141‑1 (MQ=255) ataaacaataaaaAACCAAGTGCAGAAAGTTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGt < 1:917722‑M1/128‑1 (MQ=255) ttGATAATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGtt < 2:304511/141‑1 (MQ=255) tggattgttATGAGCCNAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCGCTTACTAATGTCTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGtt < 1:861153/134‑1 (MQ=255) tGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTa < 1:881786/141‑1 (MQ=255) aTCATTATGGACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTGTAAATAAATCTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTTAAAAGAGACATTACACTAGTTAAt > 2:430346/1‑141 (MQ=255) aTCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAATAGACATTACACTAGTTAAt > 2:934592/1‑141 (MQ=255) aTCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAAt > 1:907953/1‑141 (MQ=255) tgatgaTGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAGGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAAtt > 2:244806/6‑141 (MQ=255) tCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAAtt < 1:102326/141‑1 (MQ=255) aTGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAGTGTTTTCATAGGCTTCTTCGACTGCTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTACTTTTCaa > 2:568/1‑141 (MQ=255) aTGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCaa > 2:898446/1‑141 (MQ=255) gAACCAAGTGCAACTTTCTTCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAATTAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAAc < 1:332188/141‑1 (MQ=255) AACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACa > 1:32010‑M1/1‑141 (MQ=255) GTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTGATAATCTTCTTCGACTACTTAATTATTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACAGTACACTAATTAATTTTCAAACAATACaa > 1:609616‑M1/1‑141 (MQ=255) GTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACaa < 2:249334‑M1/141‑1 (MQ=255) GCAACTTTCTGCTCTTTGATTTTTATTTTTTATTATTAAAACTCACTTAATAATGTTTTAATACTCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACACTACACTCGTTAATTTTCAAAAAATTCaaaa < 2:306788‑M1/141‑1 (MQ=255) GCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACaaaa < 1:766724‑M1/141‑1 (MQ=255) CAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACaaaaa < 1:403308‑M1/141‑1 (MQ=255) CAACTTTCTGCACTTAATTTTTTATGGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACaaaaa < 1:471406‑M1/141‑1 (MQ=255) cTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCg < 1:894778/141‑1 (MQ=255) aaagttgcacttggttTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCg > 1:301555‑M2/17‑141 (MQ=255) tttCTGCACTTGGTTTTTTATAGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAACCTTCTTCGACTACTTAATCCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGt < 1:669160/141‑1 (MQ=255) tgcacttggttTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTAc < 2:147554‑M2/130‑1 (MQ=255) tgcacttggttTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTAc < 1:751905‑M2/130‑1 (MQ=255) gcacttggttTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTCAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATCCTTTAAGATATTCGTGAAACGAGACACTACACTAGTTAATCTCCAAACAATACAAAAAGCGCCTAcc > 2:900826‑M2/11‑141 (MQ=255) gcacttggttTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCAATTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCTACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAGAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACATTACAAAACGCGCCAAcc > 2:133106‑M2/11‑141 (MQ=255) tggttTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCCTa < 1:54303‑M2/136‑1 (MQ=255) gttTTTTATTGTTTATAAATAAAACCCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCCTACa < 2:590617‑M2/138‑1 (MQ=255) ttttATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCCTACatat > 1:131777/1‑141 (MQ=255) | GTACTGAAGAGTTACCAGCAGACTTCCAACCACAAGTTGCAACAACTCAATTACGTGAAAAATATCAAAATTAAATATAGATGATCATTAGATAACTACTTGATCATTATGAACCAAGTGCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCCTACATAT > CP000730/1822606‑1822885 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |