| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,699,344 | A→T | 4.8% | intergenic (+248/‑43) | copA → / → merP | P‑ATPase superfamily P‑type ATPase copper (Cu2+) transporter/MerTP family mercury (Hg2+) permease, binding protein MerP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,699,344 | 0 | A | T | 4.8% | 284.9 / 8.2 | 104 | intergenic (+248/‑43) | copA/merP | P‑ATPase superfamily P‑type ATPase copper (Cu2+) transporter/MerTP family mercury (Hg2+) permease, binding protein MerP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (61/38); new base T (3/2); total (64/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.89e-02 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGC > CP000730/2699207‑2699484 | attattATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACCACGGTTTACAGTTGTATCATCTCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAgtt > 2:148692/1‑141 (MQ=17) attatAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAattatt > 1:121786/1‑141 (MQ=255) ttatAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAAttatta < 1:823399/141‑1 (MQ=255) tataAATAATAAGTACACTACTGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTCCACCGGAGTATTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATtattat > 1:489495/1‑141 (MQ=14) aataatAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTataaat < 2:744168/141‑1 (MQ=255) aataatAAGTACACTACGGTTTACAGTTGAATCTTCGCACCAACTGACTTTGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACGACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTataaat < 2:905075/141‑1 (MQ=14) taataaGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATGAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACATTTGGATCTTAGCACAAGCAGCTTAAGAGCCAATAAGTATGataaataa > 2:609112/1‑141 (MQ=14) taataaGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGCACTACGGATTAGAGTAGGATCTTCGCTCAAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTatcaatcc > 2:643593/1‑139 (MQ=14) aataaGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTTattatttataataat < 2:286518/141‑10 (MQ=255) aaGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACCCCACGGATGACAGTTGGGTCTTGGCTCAAACTGCATAAGAGCTACAAATTATAATAAAtagtaac > 2:219714/1‑140 (MQ=11) aaGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAg < 2:64819/141‑1 (MQ=38) aGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTGTACAGTTGGATTTTCGCACCAAAAACATTAAAGCCTCAAAttattaacattaatcact > 2:43954/1‑129 (MQ=11) aGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACAGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGACACTAATTATTATAAATAATAAgg > 1:624818/1‑140 (MQ=255) gTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCACCTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTTattatttataataattagtg < 1:783939/141‑15 (MQ=11) gTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACCCTTCGGTTTAGAGTTGGTTCTTGGCTCCAACAGTATTAGAGCCACTACTTATTCTAATTGATCAGTg > 2:300793/1‑141 (MQ=11) gTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTg < 1:834923/141‑1 (MQ=37) tACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTgg < 1:861649/141‑1 (MQ=37) acTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTATTATAAATAATAAGTGGctc > 1:122221/1‑141 (MQ=37) acTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGctc < 1:394080/141‑1 (MQ=37) acTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGctc < 1:859619/141‑1 (MQ=37) aCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCGTAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTaa > 1:589979/1‑141 (MQ=37) ggTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTaaaa > 1:311132/1‑141 (MQ=38) ggTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTaaaa < 2:246884/141‑1 (MQ=38) gTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACATTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGAATAAGAGCTACTAATTATTCTAAATATTAAGTgcatttaggtt > 2:431317/1‑131 (MQ=11) tttACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTGCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTaaaacg > 1:792103/1‑139 (MQ=255) cAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATGAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTTGCTCTAAAAGGAAGt > 2:707885/1‑141 (MQ=255) cAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCAAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATCAATAATAAATGGATCTAAAaggtggg > 2:837017/1‑140 (MQ=11) aGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACCACGGATTCCAGTTGGATCTTCGCTCAAAATGCATAAAAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAaggaggag > 2:5047/1‑139 (MQ=14) ttGGATCTTCGCTCCAACTGCCTAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACAACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGATCTAAAaggagccaaa > 2:5465/1‑136 (MQ=255) ggATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATATATGATAAGTTGACTGCGGTTTCGATGTGGATTTTGGCTCCAGATGCATAAGTGCCACTAATTTTTGTGAGTAATAAGTGGCTCTCAAAGGATGTGATTg > 2:109649/1‑141 (MQ=9) cTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTCCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTcac > 1:131594/1‑141 (MQ=255) cTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTCTAATAATTAATAAGGTGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTcac > 1:405319/1‑141 (MQ=17) cTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTcac < 1:8936/141‑1 (MQ=255) cTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTcac > 1:670593/1‑141 (MQ=255) cTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTcac < 1:825903/141‑1 (MQ=255) tCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTcaca > 2:478112/1‑141 (MQ=255) tCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGATTACAGTTGGACCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATGATAAGTGCCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTcaca > 2:449923/1‑141 (MQ=255) ccAACTGCATAAGCCCCACTAACTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACaa < 1:34286/141‑1 (MQ=255) ccAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACaa < 1:826503/141‑1 (MQ=255) ccAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGATTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAATGAGTTGAATGCTATGTCACaa > 2:473638/1‑141 (MQ=255) acAACTTCATAAGAGCCAGTAATTATTATAAATAATAGGTACACTACGTTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAAGAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACaa < 1:736320/140‑1 (MQ=17) aCTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGaa > 1:51431/1‑141 (MQ=255) aCTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTAGATTTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATATCACAAGaa > 2:53332/1‑141 (MQ=255) agagCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTaaa > 1:707061/1‑141 (MQ=255) agagCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAAGTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCAAAAGAAATTTTaaa > 2:675146/1‑141 (MQ=255) gagCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAAt < 1:199878/141‑1 (MQ=255) aagCCACTAATTACTATAAATAAAAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAAt < 1:251271/140‑1 (MQ=255) agCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATATTAAATg > 2:407081/1‑141 (MQ=255) ccACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGtt < 1:756762/141‑1 (MQ=255) aCTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGa < 2:937424/141‑1 (MQ=255) tAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGACTGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAg > 1:631542/1‑141 (MQ=255) tAATTATTAAAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAg < 1:354697/141‑1 (MQ=255) tattatAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTAt > 2:813191/1‑141 (MQ=255) attatAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATg > 2:845390/1‑141 (MQ=255) attatAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATg > 2:747008/1‑141 (MQ=255) ttaaataaTACTGACACCACGTTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGc < 2:48103/140‑1 (MQ=25) ataaatcaTAATTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGc < 2:268642/141‑1 (MQ=255) ataaataaTAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTTCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGc < 1:881125/141‑1 (MQ=255) ataaataaTAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGc < 1:410948/141‑1 (MQ=255) aaataaTAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTCTAAATAATAAGTCGCTCTAAAAGGAGGTGACTGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCtg > 2:4279/1‑141 (MQ=255) aaataaGTACATTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATCATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTgg < 2:243395/140‑1 (MQ=255) aataaGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGt > 2:8821/1‑141 (MQ=255) cacGACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCaa < 2:656045/141‑1 (MQ=255) cTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCaaaa > 1:459993/1‑141 (MQ=255) tACGGTTTACAGTTGGATCGTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAg < 2:145391/141‑1 (MQ=255) caCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGCGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGCGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAg < 2:885590/140‑1 (MQ=255) cGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTg > 2:138376/1‑141 (MQ=255) ggTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGc < 2:792103/141‑1 (MQ=255) ggTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGc > 1:396589/1‑141 (MQ=255) ggTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGc < 1:510845/141‑1 (MQ=255) ggTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGGGGCTCTCAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCCAAAGTGc > 1:196502/1‑141 (MQ=255) ggTTCACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCCTAAGAGCCCCTACTTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCATAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTgg > 2:573532/1‑140 (MQ=38) gTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCt > 1:293067/1‑141 (MQ=255) tttACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTTACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTg > 1:261424/1‑141 (MQ=255) tttACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTg > 1:519260/1‑141 (MQ=255) ttACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGt > 2:436219/1‑141 (MQ=255) gTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAAt > 1:287623/1‑141 (MQ=255) tGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACCAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCt < 1:318458/141‑1 (MQ=255) gATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGc < 1:126572/141‑1 (MQ=255) gATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGc < 2:399854/141‑1 (MQ=255) cTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCAtt > 1:95222/1‑141 (MQ=255) gaagatCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCGGTTGAATCTGCATTa > 1:18330/6‑141 (MQ=255) tCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGGGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTaa > 1:829253/1‑141 (MQ=255) cGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTaaa > 1:593681/1‑141 (MQ=255) cGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTaaa > 1:509060/1‑141 (MQ=255) gCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAaat < 2:687139/141‑1 (MQ=255) gCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAaat < 2:687048/141‑1 (MQ=255) ctccttttagagCCACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATAtt > 1:602543/9‑141 (MQ=37) ctccttttagagCCACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATAtt > 1:705465/9‑141 (MQ=37) aCTGCATAAGAGCCACTAATTATTCAAGGTGAAGAGGCGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCCCAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTGAATAATAtt > 1:224739/1‑141 (MQ=255) aCTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATAtt > 2:489247/1‑141 (MQ=255) cTGCATAAGAGCAACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTg < 1:25120/141‑1 (MQ=255) aTAAGAGCCAATAATTATTATAAACCATCAGTGGGTCTAAAAGGAGGTGAATGCCATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACgg < 2:660768/141‑1 (MQ=255) tttttttaCTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCATAAGAATTTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGgtg > 2:525502/8‑141 (MQ=255) gCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGTTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCAc > 2:200186/1‑141 (MQ=255) ccACGAATTATTATAAATAATAAGGGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCCATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACt < 1:707885/141‑1 (MQ=255) aCTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTc > 1:234378/1‑141 (MQ=255) tAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAg < 2:802061/141‑1 (MQ=255) tAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAg > 1:596357/1‑141 (MQ=255) aaTTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATATCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGCGTCACTTCAGc > 2:725544/1‑141 (MQ=255) | ATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGC > CP000730/2699207‑2699484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |