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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 76,322 | 0 | G | A | 60.2% | 373.8 / inf | 824 | intergenic (+380/‑754) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 830 total aligned reads displayed.
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< 1:864185/141‑5 (MQ=17) aGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagct > 2:311464/1‑137 (MQ=11) gATATGCATTGAGCTATTGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagctt < 1:230563/141‑6 (MQ=11) tatGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagcttat < 1:4924/141‑8 (MQ=1) gAGTTATCGTGATATATCTGGGATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATAGCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATgg > 1:694647/1‑141 (MQ=255) ttAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGCTCAAGAATATGCCCCAAGTTTATATCAAAGTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCaaaa > 2:151241/1‑141 (MQ=255) | 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |