| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,126,832 | G→A | 4.4% | A238V (GCG→GTG) | ctaA ← | cytochrome oxidase assembly protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,126,832 | 0 | G | A | 4.4% | 287.1 / 2.1 | 90 | A238V (GCG→GTG) | ctaA | cytochrome oxidase assembly protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/47); new base A (2/2); total (41/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.80e-01 | |||||||||||
GTGAATATAAGTAATCATAATAATCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATAGAGAAAATAATCAATGT > CP000730/1126693‑1126968 | gTGAATATAATTGATCATAATAATCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGc < 2:109322/141‑1 (MQ=255) atatAAGTAATCATAATAATCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGt > 1:244826/1‑141 (MQ=255) aaGTAATCATAATAATCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCa > 2:206272/1‑141 (MQ=255) aaGTAATCATAATAATCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTCAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTCGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGtctga < 2:696518/141‑3 (MQ=255) aaGTAACCATAATAATCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCa < 2:765039/141‑1 (MQ=255) aaGTAACCATAATAATCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCa < 2:765009/141‑1 (MQ=255) gTAATCATAATAATCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATTCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACt < 2:98307/141‑1 (MQ=255) gTAATCATAATAATCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTTAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGCCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACt < 2:115694/141‑1 (MQ=255) gTAATCATAATAATCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACt < 2:120205/141‑1 (MQ=255) taataaTCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCAc > 1:373574/1‑141 (MQ=255) aataatCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCACATGTCTCACTAGTGCAcc > 2:672429/1‑141 (MQ=255) aataatCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCACATGTCTCACTAGTGCAcc > 2:672424/1‑141 (MQ=255) ataatCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAGATTGCATCAGCATGTGTCACTAGTAGACCa > 2:205576/1‑141 (MQ=255) ataatCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCa > 1:549888/1‑141 (MQ=255) ataatCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACAATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCACTGGCCAACCACCATCTGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCAccg > 1:910247/1‑140 (MQ=255) ataaaCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGACCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCa > 2:572353/1‑141 (MQ=255) atCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGta < 2:715483/141‑1 (MQ=255) tCGTAAACAGCATAAAAGCCATGATACGATGCGGGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGtat < 2:303675/141‑1 (MQ=255) tCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGtat > 2:909378/1‑141 (MQ=255) tCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGtat > 2:619332/1‑141 (MQ=255) tCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGtaa > 1:664219/1‑140 (MQ=255) tAAACACTATAAAATCCATGATACGATGCGTGAGCTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGCGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATaaa < 1:201905/141‑1 (MQ=255) aaCACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAaca > 1:131638/1‑141 (MQ=255) acTATAAACGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAAcacca < 1:746132/141‑1 (MQ=255) acTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCCTGTCTCACTGGTGCACCAGTATAAAcacca > 2:414595/1‑141 (MQ=255) ctatacgcgCCATGATACAGTGCGTGAGTGTAACCCGATCTTTGTCTGAATGTGGTACACGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCACCTGCCAAACGTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAAcaccac < 2:495703/133‑1 (MQ=255) ccATTATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATTTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAatga < 2:418747/141‑1 (MQ=255) ccATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAatga < 1:116093/141‑1 (MQ=255) ccATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGAACCAGTATAAACACCACAATAAatga < 2:566086/141‑1 (MQ=255) aTGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCGTGTCTCACTAGTGAACCGGTATAAACACCGCGATAAgtgatg > 1:261107/1‑141 (MQ=255) tGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAAAAAAtaatga > 2:290409/1‑141 (MQ=255) gATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATgatgat > 1:599846/1‑141 (MQ=255) cGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAGTAAATGATGATTGCCATTaa > 1:837383/1‑141 (MQ=255) cGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTaa > 1:93444/1‑141 (MQ=255) gTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAAc < 1:943405/141‑1 (MQ=255) gTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGGGGTACAAGATCGTGGAATGGCGATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAAc > 2:668273/1‑141 (MQ=255) gAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGGTTGCCCTTAACCa > 1:660628/1‑141 (MQ=255) aGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTCGTGCACCAGTATACACACCACAAAAAATGATGATTGCCATTACCCAt > 2:461686/1‑141 (MQ=255) tGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGtt < 2:750907/141‑1 (MQ=255) tGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGtt < 1:137398/141‑1 (MQ=255) aCCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTaaa < 1:850269/141‑1 (MQ=255) ttGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAAATTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATCGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTaa > 1:577260/1‑141 (MQ=255) ttCTGAATGTGGTACAAGGTCGTGGCATGGCAATGGCCTACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATgg < 2:854957/141‑1 (MQ=255) ttGACTGTGGTATTAGATCGCGAAATGGCAATGGCCAACCACCATAGGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTCAAACGTCTTAATGGCt < 1:523683/140‑1 (MQ=255) aaTGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCtttt > 2:232579/1‑141 (MQ=255) gtgGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGa > 1:508303/1‑141 (MQ=255) gtgGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGa > 1:786466/1‑141 (MQ=255) gtgGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCGCAACTGGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGa > 1:497227/1‑141 (MQ=255) tgGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGat < 2:373574/141‑1 (MQ=255) aCAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGatataa > 1:759138/1‑140 (MQ=255) cAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGTCTTCTTGAtatata < 2:639940/141‑1 (MQ=255) aaGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTCACCTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTCATGGCTTTTTGATATATaa < 1:614824/141‑1 (MQ=255) aaGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATaa < 1:805731/141‑1 (MQ=255) gtCGTGGAATGGCGATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTc < 2:304584/140‑1 (MQ=255) aTCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATAAAAttt > 2:635403/1‑140 (MQ=255) tCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCg < 2:844754/141‑1 (MQ=255) ggAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAg < 1:290276/141‑1 (MQ=255) ggAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAg > 1:392668/1‑141 (MQ=255) aatggcaatggcCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCGATTAACCATGTTAAACGTCTTAATTGCGTTTTGATATATAATTCGTCAGCt < 2:668611/141‑1 (MQ=255) atggcacaggcCAACACCCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACAACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCtt < 2:637914/141‑1 (MQ=255) tggcaatggcCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCACATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTc < 1:672424/141‑1 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2:896096/141‑1 (MQ=255) atggcCAACCACCATATGCTAAACGTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGCTATATAATTCGTGAGCTTAATCtt < 2:590675/141‑1 (MQ=255) ccAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTg < 2:449859/141‑1 (MQ=255) cAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGa < 2:755332/141‑1 (MQ=255) accaccATATGCTAAACTTGCCTCCGCATGCTTCACTCGTGCACCATGATAATCACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATc < 2:50289/141‑1 (MQ=255) accaccATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGCCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATc > 2:769269/1‑141 (MQ=255) accaacATATGCTAATCTTGCAACCGCATGTCTCACTTGTGCACCAGTATAATCACCACAATAATTGATTATTGCCATTAACCATGTTAATCGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATc < 2:409566/141‑1 (MQ=255) ccaTATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCAGCAGTATAAAGACCACAATAAATGATGATTGCCGTTAACCAGGTTAAACGTCTTAAGGACTTTTTCAGAGAAAATTCGTCAGCTTCATATGTTTGATCtata > 2:316012/1‑141 (MQ=255) caTATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATag < 1:909378/141‑1 (MQ=255) caTATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATag < 1:619332/141‑1 (MQ=255) aatGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGTACCCGCAAAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATagag < 1:638389/140‑1 (MQ=255) atGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATAgaga < 1:787756/141‑1 (MQ=255) cTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATAGAGaaaa < 1:668273/141‑1 (MQ=255) tAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATAGAGAAaat < 2:483370/141‑1 (MQ=255) tAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCAAAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTTATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATAGAGAAaat < 2:419158/141‑1 (MQ=255) aaCTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATAGAGAAaataa > 2:406750/1‑141 (MQ=255) aCTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATACTTCGTCAGCTTCATATTTTTTATCTATAGAGAAaataat < 2:788453/141‑1 (MQ=255) tGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATCTATAATTCGTAATATAAAAAAATTTTATCTATAGAGTATATAATTaa > 2:614870/1‑141 (MQ=255) tGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATAGAGAAAATAATCaa > 2:762119/1‑141 (MQ=255) cATCCGCGTGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGCTGTTTTGAGAAACTATTCTATg > 2:578415/1‑141 (MQ=255) cATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGTTATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATAGACAAAATAATCAGTg > 1:400096/1‑141 (MQ=255) aTCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTTATCTATAGAGAAAATAATCAATGt > 1:288149/1‑141 (MQ=255) aTCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATAGAGAAAATAATCAATGt > 1:374853/1‑141 (MQ=255) aTCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATAGATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATAGAGAAAATAATCAATGt > 1:409311/1‑141 (MQ=255) | GTGAATATAAGTAATCATAATAATCGTAAACACTATAAAAGCCATGATACGATGCGTGAGTTGAACCCAATCTTGTTCTGAATGTGGTACAAGATCGTGGAATGGCAATGGCCAACCACCATATGCTAAACTTGCATCCGCATGTCTCACTAGTGCACCAGTATAAACACCACAATAAATGATGATTGCCATTAACCATGTTAAACGTCTTAATGGCTTTTTGATATATAATTCGTCAGCTTCATATTTTTGATCTATAGAGAAAATAATCAATGT > CP000730/1126693‑1126968 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |