| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,781,307 | T→C | 5.1% | K471E (AAG→GAG) | lysP ← | APC family amino acid‑polyamine‑organocation transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,781,307 | 0 | T | C | 5.1% | 213.3 / 3.6 | 80 | K471E (AAG→GAG) | lysP | APC family amino acid‑polyamine‑organocation transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/35); new base C (2/2); total (41/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.32e-02 | |||||||||||
TTAATCATATCAACAATTCACATTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATAAAAAGCCAGCAA > CP000730/1781167‑1781441 | ttaATCATATCAACAATTCACATTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCtt > 2:158037/1‑141 (MQ=255) aaTCATATCAACAATTCACATTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTAt > 2:659437/1‑141 (MQ=255) aTCATATCAACAATTCACATTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATg < 1:805662/141‑1 (MQ=255) aTCATATCAACAATTCACATTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATg < 2:448672/141‑1 (MQ=255) aTCATATCAACAATTCACATTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTGAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACTTAAATCTACTCGTTCTATTGGTATTTTTTTCGTTTTCTATCGAGGCTTATg > 1:577089/1‑141 (MQ=255) cATATCAACAATTCACATTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGat < 2:135192/141‑1 (MQ=255) cATATCAACAATTCACATTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGaa > 2:655898/1‑140 (MQ=255) caaTTCACATTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAg > 1:795011/1‑141 (MQ=255) aTTCACATTTAAGTCACCACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGaa < 2:500092/141‑1 (MQ=255) aTTCACATTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGaa > 2:528723/1‑141 (MQ=255) cacaTTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGc < 2:472823/141‑1 (MQ=255) acaTTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTCATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCt < 2:694889/141‑1 (MQ=255) acaTTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGACTTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTGATGACAAATAAAGAATGCt < 1:515845/141‑1 (MQ=255) caTTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTGTTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAGGAATGCTa > 2:326184/1‑141 (MQ=255) caTTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTa > 2:416076/1‑141 (MQ=255) caTTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTa > 2:712630/1‑141 (MQ=255) tccacacTATAACTGTAATTATTTTTACTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACt < 1:191321/138‑1 (MQ=255) taaccaatctgaCTGGAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACt < 2:97776/130‑1 (MQ=255) tCAATATTATAATTGTAATTATTTTTTTTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAAACTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACt < 2:332973/141‑1 (MQ=255) aCTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATTTCGACGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCat > 2:37128/1‑141 (MQ=255) tGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGATATTCCCatat > 2:598634/1‑141 (MQ=255) gTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCAtata > 2:305333/1‑141 (MQ=255) ttatttttatttTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTa > 1:397056/1‑141 (MQ=255) ttatttttatttTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTCATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTa > 1:186007/1‑141 (MQ=255) ttatttttatttTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTCATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTa > 1:185882/1‑141 (MQ=255) tatttttattttAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTCATTCCGCTTATTTAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGCTAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTaa < 1:926993/141‑1 (MQ=255) ttttattttaACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATAc < 2:194464/118‑1 (MQ=255) ttttattttaACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATAc > 1:194464/1‑118 (MQ=255) ttttaGCCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCCACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTaagaag < 2:351997/141‑1 (MQ=255) ttttaACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATAAACGTACTTaaaaaa > 2:534202/1‑140 (MQ=255) tttATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACtaaaa < 2:467906/141‑1 (MQ=255) ttCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTATTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACtaaaattaaa < 2:46296/141‑1 (MQ=255) tCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTTGTTTAAGAGGGGAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACtaaaattaaaa < 1:927278/141‑1 (MQ=255) cATCCATTGACACGTCTTGACATAAATCTACTTGTTCTAATAGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACtaaaattaaaat < 1:787181/141‑1 (MQ=255) aTCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTTTTTTTTTTTCTAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTATGACGCGCCtaaaatttaaatt > 2:588816/1‑140 (MQ=255) aTCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAAtc > 2:311462/1‑141 (MQ=255) ttGACACGCCATGACAAAAATCTACTTGTTCTAGTGGAATTGTTTTCGTTCTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCACCTg > 2:692608/1‑141 (MQ=255) acacGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGttt > 2:424511/1‑141 (MQ=255) acacGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAACTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATAATGGAATTACCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGttt > 2:183890/1‑141 (MQ=255) tttacctAAATCTATTTGTTATAATTGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATCCCTACTTAAGATGCGACTAACATTAAAATCTCCTGTTTTAATaaa < 1:597544/135‑1 (MQ=255) ttGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATaaa < 2:900960/141‑1 (MQ=255) ttGACGTAAATCTACTTCTTCTAAATGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATaaa < 1:401745/141‑1 (MQ=255) cGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCa > 1:780862/1‑141 (MQ=255) gTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCaa < 2:397056/141‑1 (MQ=255) gTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTCATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCaa < 2:185882/141‑1 (MQ=255) gTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTCATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCaa < 2:186007/141‑1 (MQ=255) tAAATCTTCTTGTTTTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAAc < 2:68101/141‑1 (MQ=255) tAAATCTACTTTTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTAAATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAAc < 1:222669/141‑1 (MQ=255) tAAATCGTCTTGTTCTAATGGAATTCTTTTCGTTTTATATCGAAGCTGATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATGCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAAc < 2:68021/141‑1 (MQ=255) aaaaCCTACTTGCTCTCATGGAATTTTCTTCGTTTTACAACGAAGCTTATGACAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATAGACGTAATCAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAAc < 1:399498/140‑1 (MQ=255) aaaTCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACa < 1:161897/141‑1 (MQ=255) aTCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATc > 1:862124/1‑141 (MQ=255) cTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCtt > 1:114099/1‑141 (MQ=255) ttGTTCTAATGGATTTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGAcc < 2:23830/141‑1 (MQ=255) ttGTTCTAAAGGAATTTTTTTCGTTATATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGAcc < 2:941109/141‑1 (MQ=255) tGTTCTAATGGAATTTTTTTCGCCATCGTTGGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTCAAATTAAAATCTCGTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCa > 2:668428/1‑141 (MQ=255) taaatgAATTTTTTTCGTTTTATATCCAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGTAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCaataat < 1:223830/136‑1 (MQ=255) aTGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATta > 1:96945/1‑141 (MQ=255) gAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAAAATCTTGACAAATAATtacta > 2:103744/1‑141 (MQ=255) aaTTTTTTTCGTTTTATTTCGAAGCTTATGATAAATAAAAAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATtactac < 2:345570/141‑1 (MQ=255) aaTTGTTTTCGTGTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTTAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAAGCTCCTCTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATtactac > 1:664842/1‑141 (MQ=255) tttttttCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACaa > 2:70241/1‑141 (MQ=255) tttCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACa < 1:659437/141‑1 (MQ=255) ttCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAGGGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACAAATAATTACTACAATACAt > 1:224890/1‑141 (MQ=255) ttCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTCCTACATCACAt > 2:944217/1‑141 (MQ=255) ttCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACAt > 1:313198/1‑141 (MQ=255) ttCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAAAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACAt > 1:597689/1‑141 (MQ=255) ttCGTCTTATATCAAAGCTTATAATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAAGTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATAACTACAATACag < 2:296029/141‑2 (MQ=255) tCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATa < 1:796335/141‑1 (MQ=255) cGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATaa > 2:755624/1‑141 (MQ=255) ttttATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATaaaa > 2:851155/1‑141 (MQ=255) atatCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAGTTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCACTAATTCCAACAATAAATTAAAAgaa > 2:492800/1‑139 (MQ=255) atatCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTAGTAAGAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATAAAAAGcc > 1:306888/1‑141 (MQ=255) atatCAAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATGCGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACCAAAAAAGcc > 2:217597/1‑141 (MQ=255) atggAAGTTTATGATAACCACAGAATGATAAACATACTGGAATCCGCATATACGTCATTAAGAAGTGACTAAAATTACAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATAAAAAGCCAg < 1:902826/138‑1 (MQ=255) atCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATAAAAAGCCAg < 2:19083/141‑1 (MQ=255) atCGAAGCTTAAGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATAAAAAGCCAg < 2:800018/141‑1 (MQ=255) atCAAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATAAAAAGCCAg < 2:503612/141‑1 (MQ=255) cGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATAAAAAGCCAGCa > 2:872014/1‑141 (MQ=255) cGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATAAAAAGCCAGCa > 2:787664/1‑141 (MQ=255) gAAGCTTATGATAAATAAAGAATGGAATCCAAACTAGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGAGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATACAAAGCCAGCaa > 1:693003/1‑141 (MQ=255) | TTAATCATATCAACAATTCACATTTAAGTCAACACTATAACTGTAATTATTTTTATTTTAACCTTTTATTTCATCCATTGACACGTCTTGACGTAAATCTACTTGTTCTAATGGAATTTTTTTCGTTTTATATCGAAGCTTATGATAAATAAAGAATGCTAAAAATACTGGAATTCCCATATACGTAATTAAGAAGCGACTAAAATTAAAATCTCCTGTTTTAATAAAGTCAACATCTTGACCAATAATTACTACAATACATAAAAAGCCAGCAA > CP000730/1781167‑1781441 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |