| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,084,760 | G→T | 8.5% | intergenic (‑22/‑936) | mapW2 ← / → USA300HOU_1944 | cell surface protein MapW2/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,084,760 | 0 | G | T | 8.5% | 296.2 / 3.4 | 102 | intergenic (‑22/‑936) | mapW2/USA300HOU_1944 | cell surface protein MapW2/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (54/38); new base T (8/2); total (62/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ATTTATCTAATGGCTTAGCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTGATTAACTAATTAATT > CP000730/2084627‑2084897 | atTTATCTAATGGCTTAGCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCg < 1:106444/141‑1 (MQ=255) tttATCTAATGGCTTAGCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGt > 2:716261/1‑141 (MQ=255) tCTAATGGCTTAGCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTAttt > 2:567687/1‑141 (MQ=255) ggCTTAGCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCCCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACt > 2:41106/1‑141 (MQ=255) gCTTAGCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTACACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACtt < 1:876924/141‑1 (MQ=255) cTTAGCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTa > 1:335133/1‑141 (MQ=255) cTTAGCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTa > 1:389804/1‑141 (MQ=255) cTTAGCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAACCATCTCTCCTTTTTTGAGTAATTCGTATTTGCAACTTa > 1:618495/1‑141 (MQ=255) aGCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAAtt < 1:676087/141‑1 (MQ=255) gCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATta > 1:110792/1‑141 (MQ=255) tGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATtata > 1:283434/1‑141 (MQ=255) tGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATtata > 2:185271/1‑141 (MQ=255) cGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTGGTAATCAATGCATTGCTTTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGc > 1:447528/1‑141 (MQ=255) gCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCa > 1:71603/1‑141 (MQ=255) gCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCa > 1:773086/1‑141 (MQ=255) gCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCa > 1:71631/1‑141 (MQ=255) cAGACGCTTCATTATTATTAAAGCTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAg < 1:102007/141‑1 (MQ=255) aGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGa > 2:78233/1‑141 (MQ=255) aGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTAATAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGa > 1:594274/1‑141 (MQ=255) gACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAgaaggac > 2:233164/1‑135 (MQ=255) cGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACtt > 2:848588/1‑141 (MQ=255) cGCTGCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTCTACCCAGACtt > 2:134504/1‑141 (MQ=255) gCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTATTtatataataactat > 2:546523/1‑131 (MQ=255) gCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACttt < 2:913858/141‑1 (MQ=255) ttCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTtct < 1:748931/141‑1 (MQ=255) ttattattaAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTACTTATAGCCAGACTTTCCCTAt > 2:220293/1‑141 (MQ=255) taAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGa < 2:110792/141‑1 (MQ=255) aaaGTTTGCACCTGTTGATGATTATACACCGAATTCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGaa < 2:899445/141‑1 (MQ=255) aaGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAAt < 2:721740/141‑1 (MQ=255) gTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTa > 1:619490/1‑141 (MQ=255) ttGCTCCTGTTGATGCGAAAACACCTTATGCTAAAGTTGTTGCAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTGTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTGATTATAGCCAGACTTTCTCTTTTTTTTTATTTAAc < 2:722312/141‑1 (MQ=255) ccTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAat > 2:530349/1‑141 (MQ=255) ccTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTAATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTTTAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGATTTAATTGAat > 2:465295/1‑141 (MQ=255) tGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAATTTTCATAAATTCTCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCTTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTTTCTATTTTTTTATTTATCTGActat > 1:204737/1‑141 (MQ=255) gTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCGACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATAtt > 1:555993/1‑141 (MQ=255) gATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATtaat > 1:408898/1‑141 (MQ=255) aTGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTTTATTTTTTGAATTAACTGAATATtaata > 2:557251/1‑141 (MQ=255) tAAAACACCTAAGGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACGTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATtaataataa < 1:439941/141‑1 (MQ=255) aaaaCACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTTTAGCCATGCTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATaaa > 1:538284/1‑141 (MQ=255) aaaaCACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACGGAATATTAATAATaaa > 1:316281/1‑141 (MQ=255) aaaCCCCTAATGATAAGGTTGTTGTAATTAATGACTTAAATTTCATCAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAAt < 2:129028/141‑1 (MQ=255) aaaCACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAAt < 2:66151/141‑1 (MQ=255) aTGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTTTGTAATTTGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTaa > 2:365106/1‑141 (MQ=255) tGCTAATGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAACTTATCTCTCTTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAAGAATAAATTATCTTTAAc < 2:135484/141‑1 (MQ=255) tGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAAc < 2:908297/141‑1 (MQ=255) gCTAAAGTTGTTGTTATGAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACa < 2:555703/141‑1 (MQ=255) gCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACa < 2:48601/141‑1 (MQ=255) gCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACa < 1:41106/141‑1 (MQ=255) cTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAAAAAATTAttgttaaaga < 1:913709/141‑10 (MQ=255) aGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTATTTTGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACaataat > 2:561832/1‑141 (MQ=255) aGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACaataat > 1:4526/1‑141 (MQ=255) atttttgtAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAAtt < 2:886379/137‑1 (MQ=255) ttgttgTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATATTAATTTATCTTTAACAATAAttt > 2:800541/1‑141 (MQ=255) tgttgtAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAAtttt > 1:650695/1‑141 (MQ=255) tttgtAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAAttttt < 2:810303/140‑1 (MQ=255) ttgtAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAAtttttt > 1:74954/1‑141 (MQ=255) ttgtAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAAtttttt > 1:909458/1‑141 (MQ=255) ttgtAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAAtttttt > 1:288087/1‑141 (MQ=255) ttgtAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAAtttttt > 2:880386/1‑141 (MQ=255) tAATCAATGACTTAAATTTCATATATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTGCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAac < 2:168035/141‑1 (MQ=255) tAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTaat > 2:484994/1‑140 (MQ=255) tAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAac > 1:668191/1‑141 (MQ=255) aaTCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAaca < 1:909633/141‑1 (MQ=255) aaTCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAaca > 1:765772/1‑141 (MQ=255) aaTCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTACAACTTAATTATAGCCAGACTTGCTCTACTTTTTGAATTAACTGAAAAATAATAATAAATTATCTTTAACTATAAttttaaaaaa < 2:896268/141‑7 (MQ=255) aTCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTTTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAacac > 2:500454/1‑141 (MQ=255) aattgttgaaaTTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGt < 1:441043/133‑1 (MQ=255) aaTGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTTTTTTTTTTTAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGt > 2:244295/1‑141 (MQ=255) aaTGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGt > 2:67973/1‑141 (MQ=255) ttaCTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTTTGTAATTCGTATTTTCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTa < 2:633296/139‑1 (MQ=255) tGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTa < 2:39648/141‑1 (MQ=255) tGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTa < 1:706944/141‑1 (MQ=255) tGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTa < 1:934393/141‑1 (MQ=255) agACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTa < 2:43214/140‑1 (MQ=255) aCTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTTTTTTTTGAATTAACTGAATAGTAATCATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTaaa > 2:482704/1‑141 (MQ=255) ttAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAg > 2:20094/1‑141 (MQ=255) tAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAATTTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTataatt > 2:283230/1‑139 (MQ=255) aaaTTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGtt < 1:404911/141‑1 (MQ=255) aTTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGATTTAACTGATTGTTAATACTAAATTATCTTTAACAATATTTTTTTAACACTCTTTAATGtttt > 2:524432/1‑139 (MQ=255) aTTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCt < 2:74954/141‑1 (MQ=255) ttCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTCAAAGTTCttt < 2:637028/141‑1 (MQ=255) tCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCtttt < 2:389804/141‑1 (MQ=255) tCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCtttt > 1:263511/1‑141 (MQ=255) tAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAATACTGTTAAAAGTTCTTTTAAt < 1:484994/141‑1 (MQ=255) aaaTTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAAtt < 1:479191/141‑1 (MQ=255) ttATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAAATGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTATTTTTg > 2:521962/1‑141 (MQ=255) aTCTCTCCTTCTTTGTTTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAAtttaaaa < 2:160971/141‑5 (MQ=255) ctctcCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCGACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTGATTa > 1:262274/1‑141 (MQ=255) ctctcCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAACGTTCTTTTAATTTTGATTa > 2:292533/1‑141 (MQ=255) ctctcCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTGATTa > 1:483308/1‑141 (MQ=255) ctcCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTGATTAAc > 2:843395/1‑141 (MQ=255) ctcCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAAGTATAGCCAGACGTTCTCTCTTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAATACTGTTTAAAGTTCTTTTAATTTTGATTAAc > 2:519846/1‑141 (MQ=255) tcCTTTTTTGTTTAATTCGGATTTTGAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTGATTAACt < 1:118684/141‑1 (MQ=255) cTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTGATTAACtaa < 1:276259/141‑1 (MQ=255) tttttGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTGATTAACtaatt > 2:476415/1‑141 (MQ=255) ttttGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAAATATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTTAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTGATTAACtaatta > 1:611089/1‑141 (MQ=255) ttGTGTAATTCGTATTTGCAACTTGATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTAAATTGACTGAATATTTATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTGAAAGTTCTTTTAATTTTGATTAACtaattaat > 1:689172/1‑141 (MQ=255) tgtgTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTTATTAACTatttaatt > 2:835315/1‑141 (MQ=255) tgtgTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTGATTAACTaattaatt < 1:790785/141‑1 (MQ=255) tgtgTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTGATTAACTaattaatt > 1:906031/1‑141 (MQ=255) | ATTTATCTAATGGCTTAGCTGCGGCAGACGCTTCATTATTATTAAAGTTTGCACCTGTTGATGCTAAAACACCTAATGCTAAAGTTGTTGTAATCAATGACTTAAATTTCATAAATTATCTCTCCTTTTTTGTGTAATTCGTATTTGCAACTTAATTATAGCCAGACTTTCTCTATTTTTTGAATTAACTGAATATTAATAATAAATTATCTTTAACAATAATTTTTTAACACTGTTAAAAGTTCTTTTAATTTTGATTAACTAATTAATT > CP000730/2084627‑2084897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |