| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,331,676 | A→G | 5.4% | Y81Y (TAT→TAC) | lacC ← | tagatose‑6‑phosphate kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,331,676 | 0 | A | G | 5.4% | 242.7 / 2.9 | 88 | Y81Y (TAT→TAC) | lacC | tagatose‑6‑phosphate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/40); new base G (2/3); total (45/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 | |||||||||||
TGTTCAAAATGTTTAATAAATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTAAACCTTTACCACCAGC > CP000730/2331551‑2331816 | tgtttgaaaTGTTTAATATCTCCTGCAGCCTCTTGATTCTCGATCTCCGGTCCCTGCTCTAAACTTTTTGTTTTTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCATTTTCGTGTTTCAACCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTg < 2:790519/135‑1 (MQ=255) tCAAAATGTTTAATAAATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATg > 2:863334/1‑141 (MQ=255) tCAAAATGTTTAATAAATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGAAGTTTCGTGTTTCACCCTTAGTGTTATAAAATGAATGCTTGAtt > 2:281266/1‑140 (MQ=255) cAAATTGTTTAATGAATCCTGCAGCCTCTTGATTATTAATCTCCGGTCTCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGt < 2:30020/141‑1 (MQ=255) aaaTGTTTAATAAATCCTGCACCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCg < 1:756434/141‑1 (MQ=255) aTGTTTAATAAATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAAAGTTATAAAATGCATGCTTgtgttcgac > 2:213583/1‑133 (MQ=255) tttAATAAATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATg > 1:810035/1‑141 (MQ=255) taataaCTCCAGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGAt < 1:547353/141‑1 (MQ=255) aataaATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTGTAAAATGCATGCTTGATGTCgcaatgttc > 2:700347/1‑133 (MQ=255) aataaATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTGTAAAATGCATGCTTGATGTCGACATgtaa > 2:232359/1‑138 (MQ=255) aataaATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGTTTGATGTCGGAATgttt > 2:462630/1‑138 (MQ=255) aataaATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATc < 1:122655/141‑1 (MQ=255) atcaaTCCTCCAGCCTCGTGATTATCCATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCt < 1:103651/138‑1 (MQ=255) ataaATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCt < 1:596683/141‑1 (MQ=255) ataaATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCt > 2:699190/1‑141 (MQ=255) cAGCCTCTGGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAg < 2:883776/141‑1 (MQ=255) aGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATACAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGc > 2:671545/1‑141 (MQ=255) gCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCa > 2:456472/1‑141 (MQ=255) gctctTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAGAAGTTCTGTTTGTTGCCCTTCACGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTACTCTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTACTTTTTTACCat > 2:24163/2‑140 (MQ=255) ccTCTTTATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTCGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTTATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCaa < 2:482992/141‑1 (MQ=255) ccTCTTGATTTTCAATCTTCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCCACTTTAATGTTATATAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCaa < 2:757616/141‑1 (MQ=255) ccTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCaa < 1:102766/141‑1 (MQ=255) ccTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCaa < 1:837307/141‑1 (MQ=255) ctctTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCCTGTAACATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAA‑TTTTTAGCAATa > 1:450562/1‑141 (MQ=255) tctTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATa < 1:356669/141‑1 (MQ=255) gATTATCAATCCCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAAtt < 2:61863/141‑1 (MQ=255) tttATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCCTCATGTAAAATTGCAATGCAGGTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTg < 2:354873/140‑1 (MQ=255) aTTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTg < 2:202522/141‑1 (MQ=255) ttATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCGGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTTGGCATGGTCTAATTTTTTGGCAATAATTTgc > 1:86268/1‑140 (MQ=255) tATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTTGAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGCCGTCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGAc < 2:237929/141‑1 (MQ=255) tATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGAc > 2:264310/1‑141 (MQ=255) aaTCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTaa < 2:375345/141‑1 (MQ=255) aTCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATGGACCTagt > 2:37106/1‑139 (MQ=255) aTCTCCGGGCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATACAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTCTTTAGCAATAAATTGACCTAAt > 2:695881/1‑141 (MQ=255) tcCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTATTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAGTGTTATAAAATGCATGCTTGATTTCGGCATGATCCACTTTTTTAGCCATATATTGACCTACTTCa > 2:934136/1‑141 (MQ=255) ccGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATCAATTGACCTAATTCAc > 2:445370/1‑141 (MQ=255) ccGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCGTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCAc < 1:220176/141‑1 (MQ=255) ggTCCCTGTTCTAGAATTTCTGTTCGTTGCCCTTCATGTAAAACTGCAACGCAGTTTCGTAGTTCCTCCGTTATGGTATATCATGCATGGTTGATGTTGCCCTGATCTAATTTTTTCGCAATAAATTGACCTAATTCACCg < 2:126738/141‑1 (MQ=255) ggTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCg > 1:512673/1‑141 (MQ=255) ggTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTAATAAAATGCATGCTGGATGTCGGCTAGGTCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCg < 1:932251/141‑1 (MQ=255) gTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGGCCTAATTCACCGc > 2:678630/1‑141 (MQ=255) gTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGc > 1:840705/1‑141 (MQ=255) gTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATATAATTTTTTAGTATTAAATTGACCTAATTCAgcgc > 1:18911/1‑141 (MQ=255) tCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTAGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGcc > 2:124654/1‑141 (MQ=255) cccTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCa > 1:176993/1‑141 (MQ=255) cccTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCa > 1:82649/1‑141 (MQ=255) ccTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCaa > 1:153727/1‑141 (MQ=255) gCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATaa < 2:895877/141‑1 (MQ=255) gtctAAAATTTCTGTTTCTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATaaa < 2:166724/140‑1 (MQ=255) ctctAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATaaa < 1:210954/141‑1 (MQ=255) tAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTCATTCACCGCCAATAAAAcc < 1:564226/141‑1 (MQ=255) tAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAAcc < 2:866889/141‑1 (MQ=255) aaaTTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCAc > 1:511102/1‑141 (MQ=255) cTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCaa > 1:698181/1‑141 (MQ=255) ttgttgCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGAc < 2:368245/141‑1 (MQ=255) ttgaTGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCAcc < 1:877232/138‑1 (MQ=255) tCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCt < 1:250179/141‑1 (MQ=255) tCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCt < 1:408243/141‑1 (MQ=255) ataaaagaagacAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCAGGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCACTAAAACGACTCCCGAGGAATAGCTCAccgcc > 2:344844/12‑138 (MQ=255) gTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACtt > 1:792144/1‑141 (MQ=255) tAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCCTGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTg > 2:739474/1‑141 (MQ=255) tAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCACCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTCCttc > 2:427180/1‑140 (MQ=255) aaaTTGCACTGCAGTTTCGTGTTTGACCCTTATTGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTgcg < 1:18599/141‑1 (MQ=255) aaaTTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCTCTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTgcg < 1:273810/141‑1 (MQ=255) aaaGTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTgcg < 1:434758/141‑1 (MQ=255) aaTTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGCCTGGCTCACCTACTTgcgc > 1:755022/1‑141 (MQ=255) ttGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTGTAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCaa < 1:700347/141‑1 (MQ=255) ttGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTGTAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCaa < 1:232359/141‑1 (MQ=255) ttGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCaa < 1:462630/141‑1 (MQ=255) tGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCCAACCTACTTGCGCAAg > 1:367789/1‑141 (MQ=255) cAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTACCTAATTCACCGCAAATAAAACCACTCGCAGGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGtc > 2:166781/1‑140 (MQ=255) aaTGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTAc > 1:597060/1‑141 (MQ=255) gCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTActct < 2:511102/141‑1 (MQ=255) gCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTAGCCTACTTGCGCAAGTAcact > 1:320636/1‑141 (MQ=255) aGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTg < 2:840705/141‑1 (MQ=255) aGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTAACCGCCAATAAAACCACCCGCAAGGACTGGCTCCCCTACTGGCGCAAGTACTCttt > 2:104126/1‑140 (MQ=255) gTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGATCACCTACCTGCGGAAGTACTCTTGt > 1:826195/1‑141 (MQ=255) ttCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGAACAGGTAATACGGCGTGCGCAAGTACTCTTGTTa < 1:456472/141‑1 (MQ=255) tCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTAc > 1:652540/1‑141 (MQ=255) ggggttCAGCTTTTATGTTGTAAAATGGAGGCTTGATGTAGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATGCACCGCCAATAAAACCACTCGCATGGAGTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTGTTGTTACAt < 2:442472/137‑1 (MQ=255) gttttCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACAtt < 2:835129/139‑1 (MQ=255) tttCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGGAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTa < 2:501827/141‑1 (MQ=255) ccTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTAAACCtt < 1:866326/141‑1 (MQ=255) tAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTAAACCTTTac > 1:70051/1‑141 (MQ=255) aTGTTATGAAATTCATTCTTGATTTCGTCTTGGTCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTAAACCTTTacca > 2:789962/1‑141 (MQ=255) aTGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTAAACCTTTacca > 2:676349/1‑141 (MQ=255) aTGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTAAACCTTTacca > 2:432195/1‑141 (MQ=255) gTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTAAACCTTTaccacc > 1:154141/1‑141 (MQ=255) tataAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTAAACCTTTACCACCAg < 2:810035/141‑1 (MQ=255) ataAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTAAACCTTTACCACCAGc > 1:367828/1‑141 (MQ=255) ataAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTAAACCTTTACCACCAGc > 1:798313/1‑141 (MQ=255) | TGTTCAAAATGTTTAATAAATCCTGCAGCCTCTTGATTATCAATCTCCGGTCCCTGCTCTAAAATTTCTGTTTGTTGCCCTTCATGTAAAATTGCAATGCAGTTTCGTGTTTCACCCTTAATGTTATAAAATGCATGCTTGATGTCGGCATGATCTAATTTTTTAGCAATAAATTGACCTAATTCACCGCCAATAAAACCACTCGCAAGGACTGGCTCACCTACTTGCGCAAGTACTCTTGTTACATTTAAACCTTTACCACCAGC > CP000730/2331551‑2331816 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |