| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 1343877 = | 83 (0.800) | 3 (0.030) | 3/248 | NT | 3.9% | coding (14/267 nt) | USA300HOU_1252 | hypothetical protein |
| ? | CP000730 | 1343895 = | 69 (0.700) | coding (32/267 nt) | USA300HOU_1252 | hypothetical protein | |||||
AAGATGGTAAATTTACAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGTGAGTAAATTTTGTGCTA > CP000730/1343757‑1344032 | aaGATGGTAAATTTACAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGCCGGTC‑AGGAtttt > 1:1047738/1‑141 (MQ=255) aGATGGTAAATTTACAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTc > 1:528695/1‑141 (MQ=255) gATGGTAAATTTACAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTTGTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAAACATACTGGACAGTC‑AGGATATTCa > 2:1026692/1‑141 (MQ=255) attttaccatgaaacctatttgacttggtaataaattttacttgtcccttattagtaacgattgtcattgattttattgatggatgcttaaaaaatgtaaataaatcatattctgaaaATCCTGGACAGTC‑AGGAGTTTCa < 1:954316‑M1/23‑1 (MQ=255) ggTAAATTTACAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGaa > 1:652509/1‑141 (MQ=255) gTAAATTTACAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGact > 2:1042863/1‑139 (MQ=255) tAAATTTACAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAata < 1:403156/141‑1 (MQ=255) tAAATTTACAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAata > 2:1115304/1‑141 (MQ=255) tAAATTTACAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGAGCCAGTGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAata < 1:985739/141‑1 (MQ=255) aaTTTACAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATg > 1:914612/1‑141 (MQ=255) aCAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑GGGATTTTCAGAATATGattta > 1:390344/1‑141 (MQ=255) aCAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGattta > 2:325153/1‑141 (MQ=255) cAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGatttat > 2:967539/1‑141 (MQ=255) aaaaaGTATGTGTTAATCAAGTTAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGatttat < 2:1114595/140‑1 (MQ=255) aaaaGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGatttatt < 2:63011/141‑1 (MQ=255) aaggctatGTCAAGCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACGGAAATATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCTTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGAtttattta < 2:697015/136‑1 (MQ=255) aaGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGAtttattta < 2:580815/141‑1 (MQ=255) aaGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGAtttattta > 1:9969/1‑141 (MQ=255) aGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTAc < 2:984931/141‑1 (MQ=255) aGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTAc > 1:1152987/1‑141 (MQ=255) aGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTAc > 1:1164358/1‑141 (MQ=255) gTATATGTCAATCAAGGTAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTGATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACa > 1:667094/1‑141 (MQ=255) atttgacttggtaataaattttacttgtcccttattagtaacgattgtcattgattttattgatggatgcttaaaaaatgtaaataaatcatattctgaaaatcctggacagtcaggatTTTCAGAATATGATTTATTTAc < 1:545145‑M2/22‑1 (MQ=255) tatGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACAttt < 1:155542/141‑1 (MQ=255) tcaatcaaGATGGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTa < 1:1012805/141‑1 (MQ=255) tcaatcaaGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTACACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTa < 1:820596/141‑1 (MQ=255) acaatcaaGATAGTGTATCTTGTGTGCCAAGGTAACAAGGAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATTTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTa < 2:918644/140‑1 (MQ=255) aataaattttacttgtcccttattagtaacgattgtcattgattttattgatggatgcttaaaaaatgtaaataaatcatattctgaaaATCCTG‑ACTGTCCAGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGca < 2:954316‑M1/52‑1 (MQ=255) gagaGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATCTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGcatcca < 1:165235/138‑1 (MQ=255) gATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGcatcca > 1:60078/1‑141 (MQ=255) gggtATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCaa < 1:908373/139‑1 (MQ=255) tgtATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAAt > 1:183708/1‑141 (MQ=255) aTCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATaaa > 2:868253/1‑141 (MQ=255) aTCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATaaa > 2:617545/1‑141 (MQ=255) ttGTGCCAGGGTAACAAGCTACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCaa > 1:778713/1‑141 (MQ=255) tgtgCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAAt > 2:819674/1‑141 (MQ=255) ggCCAGGGTAACAAGAAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGa < 2:325644/140‑1 (MQ=255) gCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGAc < 1:375483/141‑1 (MQ=255) ccAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACa < 1:884008/141‑1 (MQ=255) cAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACaa < 2:1101773/141‑1 (MQ=255) aGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATCAAATCAATGACAAt > 1:174686/1‑141 (MQ=255) gTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGACTTCAATTGTTATGTTACCTAACCATCCTGGACAGTC‑AGCATTTTCATCTTATGCTTTATTTTCGTTTTTGAAGCCTTTGTCATTTAAATCGATCACAATctt < 2:236263/141‑3 (MQ=255) tAACAAGCAACCGTATAACTATTAAACATCAAACCGAAATCAATTGGTATGTTACATAACCATCCTAGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACACTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGtt < 2:599004/141‑1 (MQ=255) tAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGtt < 1:69144/141‑1 (MQ=255) aGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACtaa < 2:528695/141‑1 (MQ=255) gctgccGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACtaat < 1:22942/137‑1 (MQ=255) gCATCCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACtaat < 2:271430/141‑1 (MQ=255) aaCCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCCGACTTTGTTTTATTTACAGTCCTTACGCACCCTTCAATAAAATCAATGACAATCGTTACtaataa < 2:544004/141‑1 (MQ=255) aaCCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACtaataa > 2:333020/1‑141 (MQ=255) tattattTAACAGTAAACCCAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAg < 1:908695/141‑1 (MQ=255) attattTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAATCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATATGGGACAAGt < 2:769491/141‑1 (MQ=255) attattTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGt > 1:960083/1‑141 (MQ=255) tttAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCGGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTataa > 1:48423/1‑141 (MQ=255) tttAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTaaaa < 2:265356/141‑1 (MQ=255) tttAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTaaaa < 1:631895/141‑1 (MQ=255) aaCAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAAttt > 2:371160/1‑141 (MQ=255) tgcttaaaaaatgtaaataaatcatattctgaaaatcctggacagtcaggatTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATttatt < 2:954316‑M2/89‑1 (MQ=255) aaCCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCa < 1:439414/141‑1 (MQ=255) aaCCGAATTCAATTGTTATGCTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAGAATTTATTACCa > 1:729201/1‑141 (MQ=255) ccGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAg < 2:914612/141‑1 (MQ=255) cGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGt < 2:1152987/141‑1 (MQ=255) cGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGt < 2:1164358/141‑1 (MQ=255) aaTTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCa > 1:76170/1‑141 (MQ=255) aaTTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCa > 1:502524/1‑141 (MQ=255) aaTTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCa > 1:244439/1‑141 (MQ=255) gtaaataaatcatattctgaaaATCCTG‑ACTGTCCAGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAAt < 1:545145‑M1/119‑1 (MQ=255) aaTTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAg < 1:761160/141‑1 (MQ=255) aTTCTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAgg < 2:840781/141‑1 (MQ=255) gttatgttaCATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGttt > 1:556829/1‑141 (MQ=255) gttatgttaCATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGttt > 1:1164247/1‑141 (MQ=255) tatgttaCATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTATTGTGAGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGtttat > 1:619763/1‑139 (MQ=255) atgttaCATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCAt < 1:159129/141‑1 (MQ=255) atgttaCATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCAt < 1:159163/141‑1 (MQ=255) taCATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTa < 1:967539/141‑1 (MQ=255) aTAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTaaaa > 1:992977/1‑141 (MQ=255) aTAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGCTaaaa > 2:1197772/1‑141 (MQ=255) tgaaactcctgactgtccaggatTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAAt < 1:954316‑M2/118‑1 (MQ=255) ccATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGt > 2:671909/1‑141 (MQ=255) CCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGTGAGt > 2:60078‑M1/1‑141 (MQ=255) CTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTACTAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTGCATGGTAAAATAGTGAGTa > 2:667094‑M1/1‑141 (MQ=255) CTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATACGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGTGAGTa < 1:272987‑M1/141‑1 (MQ=255) CTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGTGAGTa < 1:329671‑M1/141‑1 (MQ=255) aaaGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGTGAGTAAAtt < 2:15264/139‑1 (MQ=255) aCAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGAGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGTGAGTAAAtt > 1:1156900/1‑141 (MQ=255) cAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGTGAGTAAAttt > 2:19812/1‑141 (MQ=255) aGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGTGAGTAAAtttt < 1:1185670/141‑1 (MQ=255) tC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTAATGGTAAAATAGTGAGTAAATTTtgt > 1:1042623/1‑141 (MQ=255) actatTTTCACAACATGATTGATTTACAGTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTAACGAATAAGGGACAAGGAAAATTTATTACCAAGACAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGTGAGTAAATTTTGTGc < 1:583663‑M2/136‑1 (MQ=255) gatTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAGTAGTGAGTAAATTTTGTGCTa < 1:617545‑M2/138‑1 (MQ=255) gatTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATAAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGTGAGTAAGTTTTGTGCTa < 1:868253‑M2/138‑1 (MQ=255) | AAGATGGTAAATTTACAAAAGTATATGTCAATCAAGATAGTGTATCTTTTGTGCCAGGGTAACAAGCAACCGAATTATTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGACAGTC‑AGGATTTTCAGAATATGATTTATTTACATTTTTTAAGCATCCATCAATAAAATCAATGACAATCGTTACTAATAAGGGACAAGTAAAATTTATTACCAAGTCAAATAGGTTTCATGGTAAAATAGTGAGTAAATTTTGTGCTA > CP000730/1343757‑1344032 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |