Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 383,775 | 0 | C | T | 3.1% | 407.9 / 2.8 | 128 | T44T (ACG→ACA) | USA300HOU_0350 | PTS family porter component IIC |
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Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
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1:1136338/141‑1 (MQ=255) atatCGTTTTAATGGTTCCTGAAGTGATCGTTGCGGCAGGTTTTTTCTGAACGATTAAACCTATAAAGGCAATCAGTGCAACAAGAATGGCTGGTTGACTTAAAATATCGACTATAAAATTAAGGATTGCTTGCATAGGtt > 1:585039/1‑140 (MQ=255) atatCGTTTTAATGGTTCCTGAAGTGATCGTTGCGGCAGGTTTTTTCTGAACGATTAAACCTATAAAGGCAATCAGTGCAACAAGAATGGCTGGTTGACTTAAAATATCGACTATAAAATTAAGGATTGCTTGCATAGGTc < 1:554022/141‑1 (MQ=255) atatCGTTTTAATGGTTCCTGAAGTGATCGTTCCGGCAGGTGTTTTCTGAACGATTAAACCTATAAAGGCAATCAGTGCAACAAGAATGGCTGGTTGACTTAAAATATCGACTATAAAATTAAGGATTGCTTACATAgatg > 2:538011/1‑138 (MQ=255) atCGTTTTAATGGTTCCTGAAGTGATCGTTGCGGCAGGTTTTTTCTGAACGATTAAACCTATAAAGGCAATCAGTGCAACAAGAATGGCTGGTTGACTTAAAATATCGACTATAAAATTAAGGATTGCTTGCATAGGTCGt < 2:679293/141‑1 (MQ=255) atCGTTTTAATGGTTCCTGAAGTGATCGTTGCGGCAGGTTTTTTCTGAACGATTAAACCTATAAAGGCAATCAGTGCAACAAGAATGGCTGGTTGACTTAAAATATCGACTATAAAATTAAGGATTGCTTGCATAGGTAGt > 1:910377/1‑141 (MQ=255) | TTAAGGCTAGTGAGACGATAGCTTCGTTGTTAGGTACGATACCTTGCACACCAAATGCGTGTTGGAATATTTTGCCGAATGGTTCAAGAGATCGAACGACGACATCAGCACCTGCACTTAAAATTAAGAAGCCTAATATCGTTTTAATGGTTCCTGAAGTGATCGTTGCGGCAGGTTTTTTCTGAACGATTAAACCTATAAAGGCAATCAGTGCAACAAGAATGGCTGGTTGACTTAAAATATCGACTATAAAATTAAGGATTGCTTGCATAGGTCGTA > CP000730/383636‑383914 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |