| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 829,785 | A→G | 3.4% | K89E (AAA→GAA) | USA300HOU_0778 → | possible superfamily II DNA/RNA helicase ComFC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 829,785 | 0 | A | G | 3.4% | 351.5 / 2.5 | 117 | K89E (AAA→GAA) | USA300HOU_0778 | possible superfamily II DNA/RNA helicase ComFC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (74/38); new base G (2/2); total (77/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.11e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
ATATTAAAGCAAGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCACATGATTTATCTAGAACA > CP000730/829645‑829925 | atatTAAAGCAAGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTGAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTAGATTGTGAATTTCAATATGACGGTTTAATGa > 2:749602/1‑141 (MQ=255) tatTAAAGCAAGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGaa < 1:240373/141‑1 (MQ=255) ttAAAGCAAGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGCAag > 2:1075486/1‑141 (MQ=255) ttAAAGCAAGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATAACGGTTTAATGAAag > 2:941342/1‑141 (MQ=255) agaGCAAGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAagag < 1:967555/139‑1 (MQ=255) aaGCAAGGCGCTGTACAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAgaga > 2:811485/1‑141 (MQ=255) aGCAAGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTAGCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAAGGAAAGAgat < 2:45912/141‑1 (MQ=255) gCAAGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAgatg < 2:352430/141‑1 (MQ=255) cAAGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGGAAGAgatga > 1:1173152/1‑141 (MQ=255) cAAGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGGAAGAgatga > 1:914821/1‑141 (MQ=255) tttgtgATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAgatgat < 2:1197331/136‑1 (MQ=255) aaGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATAAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAgatgat < 1:336829/141‑1 (MQ=255) aGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGGTGATa > 1:278557/1‑141 (MQ=255) aGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATa > 2:25568/1‑141 (MQ=255) aGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATa > 1:73297/1‑141 (MQ=255) ggCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATAc > 1:582360/1‑141 (MQ=255) gCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTGTTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATCGAACAATTATATTGTCAATCTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGAAACa > 2:655275/1‑141 (MQ=255) cGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTCATGAAAGAGATGATACAt > 2:1058440/1‑141 (MQ=255) gaagTTCAAGGTGCTTAAAACAATTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATc < 2:310778/138‑1 (MQ=255) gATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATc < 2:588605/141‑1 (MQ=255) tGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATTTGACGGTTTAACGAAAGAGATGATACATCAg > 2:281677/1‑141 (MQ=255) ttCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGta < 1:427846/141‑1 (MQ=255) aagTGCTCAAAACAACTAAATCAAAATGCAGTGTTTTTTTTAGACGATAAGTTTCTATCGGTACAAATTAATATAGTATAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATaaa < 2:191292/139‑1 (MQ=255) gTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAAtt > 1:289428/1‑141 (MQ=255) gTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAAtt > 1:650088/1‑141 (MQ=255) aaCACTTAAATCAAGATTAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTACCGTCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAg < 1:105497/141‑1 (MQ=255) aaCACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAg > 2:121067/1‑141 (MQ=255) aaCACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAg < 1:352779/141‑1 (MQ=255) acacTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGa > 1:712486/1‑141 (MQ=255) acTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACt < 1:694437/141‑1 (MQ=255) acTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACt < 1:1089884/141‑1 (MQ=255) cTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTACTGGAACAATTATATTGTCAAGTTCAATATGACTGTTTAATGAAAGAGATGGTACATCAGTATAAATTTTTGAAACACta > 1:360863/1‑141 (MQ=255) cTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACta > 1:148536/1‑141 (MQ=255) cTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACta > 1:957912/1‑141 (MQ=255) tAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACtatt > 1:906204/1‑141 (MQ=255) aaaTCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACtatta > 1:681138/1‑141 (MQ=255) aGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTAtg < 2:1178467/141‑1 (MQ=255) gATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTAtgt > 2:200948/1‑141 (MQ=255) gATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTAtgt > 1:148036/1‑141 (MQ=255) aGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAatt > 1:992904/1‑141 (MQ=255) cGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATAGATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTAATATTTATGTGAatttt > 2:242333/1‑139 (MQ=255) cGTATTGTTTAGACTGCAAGGTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAattat < 1:918500/141‑1 (MQ=255) gTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGACACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAGAGACTATTATTTATGTGAATTATTAGcac > 1:602953/1‑141 (MQ=255) aCTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATttga < 1:140003/141‑1 (MQ=255) atGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCGCTGTCAATATGACGGTTTAATGAAAGTGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATttgat < 1:224977/140‑1 (MQ=255) gCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATttgattg > 2:1058569/1‑141 (MQ=255) cAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATGTTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATttgattga > 2:597102/1‑141 (MQ=255) cAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATttgattga > 2:359020/1‑141 (MQ=255) cAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATttgattga > 2:346231/1‑141 (MQ=255) aGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATGTTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGaaa > 2:597272/1‑141 (MQ=255) aGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGaaa > 1:42253/1‑141 (MQ=255) aGTTTCTATCGGCACACTTGAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACTGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCAGATTTGATTGaaa > 2:668354/1‑141 (MQ=255) gTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGaaaa > 2:279902/1‑140 (MQ=255) gTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGaaaa > 1:373535/1‑140 (MQ=255) gTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAAt > 1:131000/1‑141 (MQ=255) gTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATCTGATTGAAAt > 1:163254/1‑141 (MQ=255) cTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACca > 2:499872/1‑141 (MQ=255) aTCGGCACACTTTAATTTAATGGAACACTTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACcaaa > 1:1077347/1‑139 (MQ=255) tCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTAAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACaa > 1:933047/1‑141 (MQ=255) gCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACa > 1:1150341/1‑141 (MQ=255) gCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAAAGATGATACATTAGTATGAATTTTTGAAAGACTATTATTTTTGTGAATTATTGGCACATTTGATTAAAATACaacaaaca > 2:443227/1‑141 (MQ=255) cacaCTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACAt < 1:340753/141‑1 (MQ=255) cTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTa > 1:1085724/1‑141 (MQ=255) tttaatttaaTGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACAACAAACATCTTAt > 1:582864/1‑141 (MQ=255) taattttatGGGACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGa < 2:801214/141‑1 (MQ=255) taatttaatGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGa > 1:762803/1‑141 (MQ=255) taatttaatGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTGTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAGCATCTTATGa > 2:896920/1‑141 (MQ=255) taatttaatGGAACAATGATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACAGTTGATTGAAATACCACAAATATCTTaggg > 1:762939/1‑138 (MQ=255) tttaatGGGACAATGGTAGTTTCAATTTCAGTATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGCAATATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACta > 2:1146837/1‑141 (MQ=255) aatGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTatat < 1:200948/141‑1 (MQ=255) atGGAAGAATTATATTGTCAATGTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATTATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATAtt < 2:8168/141‑1 (MQ=255) atGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACGTCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTGTAtt > 1:228578/1‑141 (MQ=255) atGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTCTTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTCTGACTATCtt > 1:239362/1‑141 (MQ=255) atGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATAtt > 1:693821/1‑141 (MQ=255) atGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACCATTATTTATGTGACTTATTGGCACACTTGATTCAAATACCACAAACATCTTATGACTATAtt < 2:777373/141‑1 (MQ=255) aaaaaTTTTATTGTCAATTTGAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGc < 2:619956/138‑1 (MQ=255) aCAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGCTTGAAATACCACAATCATCTTATGACTATATTGTGcc > 2:1097040/1‑141 (MQ=255) aCAATTATATTGTCAATTTCAATAGGACGGTTTAATGAACCGAAAGTCTGGGCACGATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGcc < 1:1171799/141‑1 (MQ=255) tatTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCct > 1:487811/1‑141 (MQ=255) tatTGTCAATTTCAATATGACGGTTGAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCGCATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGCTTATATTATGCCAATTCct > 1:504866/1‑141 (MQ=255) atTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCctt < 2:1042180/141‑1 (MQ=255) gTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCcttctt < 2:10246/141‑1 (MQ=255) tttCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCg > 1:361217/1‑141 (MQ=255) tttCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCg > 1:469637/1‑141 (MQ=255) tctCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAACATTTGAAACCATATACTAAATGTGAATTAGTTGCACATGTGAGTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCg > 1:236521/3‑141 (MQ=255) atatGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGcaca > 2:72906/1‑141 (MQ=255) atatGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGcaca < 1:200107/141‑1 (MQ=255) atatGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGCcaca > 2:647773/1‑141 (MQ=255) aCGGTTTAATGGAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCACATGAtt < 2:914821/141‑1 (MQ=255) aCGGTTTAATGGAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCACATGAtt < 2:1173152/141‑1 (MQ=255) aCGGTTTAATGAAAGCGATGATACATCAGTATAAATTTTGGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCTCATGAtt < 1:749602/141‑1 (MQ=255) tgTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTNTGAAGTTTATTTTATATGTGAATAATTTGTACATTTGTTTGCAATACTACAATCATCTGTTCACTAAATTGTGCCAAATCCGACTTCGTCGGCACATGaagta < 2:278557/140‑5 (MQ=255) tttAATGAACGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTTAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACAAATAACATCTTCTCTCCGTTATAAGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCACGTGATTTATc < 1:876030/141‑1 (MQ=255) tttAATGAAAGAGATGATACATCAGTGTAAATTGTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCACATGATTTATc < 2:796597/141‑1 (MQ=255) tttAATGAAAGAGATGATACATCAGTATTAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCACATGATTTATc > 1:760548/1‑141 (MQ=255) tttAATGAAAGAGATGATACATCAATATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCACATGATTTATc > 1:760600/1‑141 (MQ=255) ttAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGACACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTATTCGCGGGCACGTGATTTctct > 2:151319/1‑141 (MQ=255) tGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCACATGATTTATCTAGaa > 2:546278/1‑141 (MQ=255) tGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCACATGATTTATCTAGaa < 2:957912/141‑1 (MQ=255) aaaGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCACATGATTTATCTAGAACa < 2:289428/141‑1 (MQ=255) | ATATTAAAGCAAGGCGATGTTCAAGGTGCTTAAAACACTTAAATCAAGATGAAGCGTATTGTTTAGACTGCAAGTTTCTATCGGCACACTTTAATTTAATGGAACAATTATATTGTCAATTTCAATATGACGGTTTAATGAAAGAGATGATACATCAGTATAAATTTTTGAAAGACTATTATTTATGTGAATTATTGGCACATTTGATTGAAATACCACAAACATCTTATGACTATATTGTGCCAATTCCTTCTTCGCCGGCACATGATTTATCTAGAACA > CP000730/829645‑829925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |