| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,146,228 | A→G | 3.6% | E92G (GAA→GGA) | pheS → | phenylalanine‑‑tRNA ligase alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,146,228 | 0 | A | G | 3.6% | 359.8 / 2.4 | 116 | E92G (GAA→GGA) | pheS | phenylalanine‑‑tRNA ligase alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (58/52); new base G (3/2); total (62/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GAAATTGATGAAGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGATATGAAGTTGAACAA > CP000730/1146088‑1146367 | gAAATTGATGAAGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTga > 1:1034722/1‑141 (MQ=255) aaaTTGATGAAGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTgaa < 1:441691/141‑1 (MQ=255) aTTGATGAAGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTgaaga < 1:825413/141‑1 (MQ=255) ttGATGAATGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAACAATTGGCTgaagaa < 1:888227/141‑1 (MQ=255) gatgaAGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAAc < 2:1149569/141‑1 (MQ=255) atgaAGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGGAGAAACa > 1:147978/1‑141 (MQ=255) atgaAGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGGAGAAACa > 1:752707/1‑141 (MQ=255) tgcaGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAAGTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACaa < 1:501945/138‑1 (MQ=255) tgaAGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAACCAAGTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAATTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATGGGCTGAAGgaagaa > 2:275080/1‑141 (MQ=255) tgaAGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAACTAAGCAATTGGCTGAAGAAACaa > 1:268364/1‑141 (MQ=255) tgaAGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACaa > 1:293679/1‑141 (MQ=255) tgaAGGATTTGCCCAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGCCAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACaa < 1:85823/141‑1 (MQ=255) aaGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAGAAAGTGAATGAATTGCGGCAAACAATTCACACTGACTTAGGTGAAAGACAACAGATGTGAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACGAtt > 2:961351/1‑141 (MQ=255) ggATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGa < 1:690356/141‑1 (MQ=255) ggATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGa > 1:182121/1‑141 (MQ=255) gATTTGCCCAAAGAAGATAAACCTGCCTTAGGTCAAAAAGAGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGAt < 2:962869/141‑1 (MQ=255) aTTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATg > 1:371412/1‑141 (MQ=255) ttGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTa > 1:259189/1‑141 (MQ=255) ttGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTa > 1:8123/1‑141 (MQ=255) ttGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTa > 1:473400/1‑141 (MQ=255) ccGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGATGAAGAAACAATTGATGTATCa > 2:1201053/1‑141 (MQ=255) cGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCAt > 1:1095410/1‑141 (MQ=255) aaTGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTa < 1:164055/141‑1 (MQ=255) aTGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTAc < 2:1029331/141‑1 (MQ=255) tGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTAcc < 2:817494/141‑1 (MQ=255) tAAACCTGCGTTTGCTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATAGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGgt‑cg > 1:662602/1‑141 (MQ=255) aaCCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTCCGTCTAACAATTAAAATTAAATTATATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGCTGTATCATTACCAGgt‑cgtc > 1:169489/1‑141 (MQ=255) tGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCatat > 1:1101687/1‑141 (MQ=255) cGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGGTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACAAGgtaggcagatgg > 2:325500/1‑131 (MQ=255) tttGTTCAAAAAGTGAATTAAATGCCTCAAAAAATACAAAATTAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATGAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGaa < 1:246436/141‑1 (MQ=255) tGGTCAAAAAGTGATTGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAAt < 1:1000359/141‑1 (MQ=255) tGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAAt < 2:684117/141‑1 (MQ=255) tGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAAt < 2:1010781/141‑1 (MQ=255) tGGGCAAAAAGTGAATGAAGTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAAt < 1:370303/141‑1 (MQ=255) cAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTTAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGt < 1:822962/141‑1 (MQ=255) aaaaaGGGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGtt < 2:871519/141‑1 (MQ=255) aaaaGTGAATGAAATGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTc < 1:522906/141‑1 (MQ=255) aaaGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCa > 1:160422/1‑141 (MQ=255) aaGTGAATGAATTGCGTTAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTTGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCaa < 2:296821/141‑1 (MQ=255) aaGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCaa < 1:1028262/141‑1 (MQ=255) aaGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGA‑CGTCATATTGAAATCGGTTCaa > 2:1166297/1‑141 (MQ=255) gactgcctctcGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCa < 2:536131/131‑1 (MQ=255) tGCGTAAAACAATTCAAAATGATTTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTaa < 1:424739/141‑1 (MQ=255) tGCGACAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTGAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTaa < 1:6112/141‑1 (MQ=255) gCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAac < 2:697464/141‑1 (MQ=255) cGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTGAGTTAAAGAAAAATTAACTAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATCGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATACTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAaca < 1:773018/141‑1 (MQ=255) gtaaaaCAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAacac < 1:836909/138‑1 (MQ=255) tCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGATCAAAGCATCCATTAACACg > 1:806546/1‑141 (MQ=255) aaTTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAAt > 2:942152/1‑141 (MQ=255) aaTTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACAAGTACAAt > 2:114971/1‑141 (MQ=255) aTTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATa > 1:1003135/1‑141 (MQ=255) aTTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATa > 1:685000/1‑141 (MQ=255) ttCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATag > 1:968956/1‑141 (MQ=255) cAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATagaa < 1:83453/141‑1 (MQ=255) aTTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGa < 1:1158628/141‑1 (MQ=255) aGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGa > 2:54047/1‑141 (MQ=255) aaTGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGAc < 2:1005203/140‑1 (MQ=255) aaaacaaaaGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTTGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTAtt < 2:1066788/138‑1 (MQ=255) aGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTc > 1:943940/1‑141 (MQ=255) atcaagtgATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCt < 2:293679/134‑1 (MQ=255) caacaGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCtta > 2:683423/1‑141 (MQ=255) caacaGATGTTAGCTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTTtta > 2:286412/1‑141 (MQ=255) aacaGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGCCGAAATTGAAGAGTTATTCttag < 2:1003135/141‑1 (MQ=255) aacaGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCttag > 2:278535/1‑141 (MQ=255) aacaGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGCATCATTACCTGGT‑CGTCATATTGAAACCTGCGCCAATCATCCATTAACATGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCttag > 2:104356/1‑141 (MQ=255) caGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCttaggt > 1:187772/1‑141 (MQ=255) aGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATCCttaggtt > 2:502770/1‑141 (MQ=255) gATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTACCACGTACAATAGAAGAAAATGAAGAATTATTCttaggttt > 2:516707/1‑141 (MQ=255) aTGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTCCAATAGAAGAAATTGAAAACCTATTCttaggttta > 2:345248/1‑141 (MQ=255) tGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCttaggtttag > 1:456708/1‑141 (MQ=255) tagttaAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTtaggtttaggtt > 2:480480/1‑141 (MQ=255) aaGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGGAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGaaa < 2:147978/141‑1 (MQ=255) aaGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGGAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGaaa < 2:752707/141‑1 (MQ=255) gAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAAtt > 1:945629/1‑141 (MQ=255) gAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAAtt > 1:531687/1‑141 (MQ=255) aaaaaTTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATtg < 1:1201053/141‑1 (MQ=255) aaaaaTTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATtg > 1:268314/1‑141 (MQ=255) aaaaaTTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATtg > 2:115640/1‑141 (MQ=255) aaaTTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATtgtg > 1:786984/1‑141 (MQ=255) aaaTTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAACTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATtgtg < 2:632987/141‑1 (MQ=255) aaaaaaGCAATTTGCTGAAGAAAAAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATgg < 1:1075147/141‑1 (MQ=255) aaaTAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CTTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATgg > 1:337857/1‑141 (MQ=255) aaaTAAGCAATTGGCGGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATgg > 2:108729/1‑141 (MQ=255) aTAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGat > 1:356344/1‑141 (MQ=255) tAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGata > 1:1102305/1‑141 (MQ=255) tAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGata > 1:990720/1‑141 (MQ=255) tAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCAATACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGata < 2:461284/141‑1 (MQ=255) aaGCATGTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCCTTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATATAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAACTGTGAATGGatat < 1:800746/141‑1 (MQ=255) aGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGATATg > 1:851384/1‑141 (MQ=255) aGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTCTAGGTTCTGAAATTGTGAATGGATATg > 2:57444/1‑141 (MQ=255) cAATTGGCTTAAGAAACAATTGATCTATCATT‑CAATGTGGGTCATATTGAAATACGATCAAAACATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAAATGTGAATGTATATGaa > 1:876288/1‑141 (MQ=255) aaaTTGGCTGAAGAAACAAGTAATGTACCATTACCAGGT‑CTTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTAAAATAGTAGGACTAGTATATTTATTCTGAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGATATGaa < 2:961650/140‑1 (MQ=255) aTTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGATATGAAGt > 1:358/1‑141 (MQ=255) aTTGGCTGAAGAAACAATTGATGTAGCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTTAGTTAACTAATTGTGAATGGATATGAAGt < 2:255963/141‑1 (MQ=255) ggCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGATATGAAGTTGa > 1:301187/1‑141 (MQ=255) ggCTGAAGAAACAATTGACGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTGAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGATATGAAGTTGa < 1:610098/141‑1 (MQ=255) cTGAAGAAACCACTAATGTAATATACCCAGGT‑CTTAATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCAATTAACACGTACAATAGAATAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGATATGAAGTTGAAc < 1:493239/141‑1 (MQ=255) cTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGATATGAAGTTGAAc < 2:1101687/141‑1 (MQ=255) gaagaaACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGATATGAAGTTGAACaa < 2:473400/141‑1 (MQ=255) gaagaaACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAACTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGATATGAAGTTGAACaa > 2:786937/1‑141 (MQ=255) | GAAATTGATGAAGGATTTGCCGAATGAAGATAAACCTGCGTTTGGTCAAAAAGTGAATGAATTGCGTCAAACAATTCAAAATGAATTAGATGAAAGACAACAGATGTTAGTTAAAGAAAAATTAAATAAGCAATTGGCTGAAGAAACAATTGATGTATCATTACCAGGT‑CGTCATATTGAAATCGGTTCAAAGCATCCATTAACACGTACAATAGAAGAAATTGAAGACTTATTCTTAGGTTTAGGTTATGAAATTGTGAATGGATATGAAGTTGAACAA > CP000730/1146088‑1146367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |