| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 37,542 | T→C | 18.9% | intergenic (+238/‑271) | USA300HOU_0028 → / → ugpQ1 | hypothetical protein/glycerophosphodiester phosphodiesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 37,542 | 0 | T | C | 18.9% | 179.4 / 27.8 | 86 | intergenic (+238/‑271) | USA300HOU_0028/ugpQ1 | hypothetical protein/glycerophosphodiester phosphodiesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/29); new base C (3/13); total (42/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.07e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACGTTAAAAGCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCTTGGGACATAAATGATTTTTTAAAAATGAGATGAGACGTAGATTAA > CP000730/37402‑37680 | aCGTTAAAAGCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGt < 1:310077/141‑1 (MQ=255)aCGTTAAAAGCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGt < 1:609245/141‑1 (MQ=255) ttAAAAGCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTaaa > 1:575940/1‑141 (MQ=255) ttAAAAGCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTaaa > 1:790479/1‑141 (MQ=255) ttAAAAGCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTaaa < 2:712367/141‑1 (MQ=255) tAAAAGCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAAGTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTaaaa > 2:885974/1‑141 (MQ=255) tAAAAGCAATTCCATGCAAAATTGCTGAGAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTaaaa > 1:543426/1‑141 (MQ=255) aaaaGCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAAt < 1:1133372/141‑1 (MQ=255) aaaaGCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAAt > 2:767122/1‑141 (MQ=255) aaaGCAATTGCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCACTCCTAGCACAACTTGCAGATAAGAGGGGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAAtt > 2:50373/1‑141 (MQ=18) aaaGCAATTCCAAGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAAtt < 2:316786/141‑1 (MQ=255) aaGCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGTGTTAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTg < 1:740488/141‑1 (MQ=255) aaGCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTg < 1:1133514/141‑1 (MQ=255) gCAATTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCt < 1:35356/141‑1 (MQ=255) aatgttaTGCAAAATCTCAGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGa < 2:614004/135‑1 (MQ=17) aTTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGAt > 1:442219/1‑141 (MQ=255) aTTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGAt < 1:1076871/141‑1 (MQ=255) aTTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGAt < 2:522110/141‑1 (MQ=255) aTTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGAt < 1:734315/141‑1 (MQ=255) aTTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGAt < 1:463268/141‑1 (MQ=255) aTTCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGAt > 1:364913/1‑141 (MQ=255) aTTCCAAGCAAAATTGCAGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGAt < 2:669413/141‑1 (MQ=255) ttCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTTAAAGCGGTTATCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCGGATAAGAGGTGCGTTCAGAGCAGTTCTCAGTAAGATTGGTGAtg > 1:464679/1‑140 (MQ=18) ttCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATa < 1:1032712/141‑1 (MQ=255) tCCATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATaa > 2:1031214/1‑141 (MQ=255) ccATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATGAg > 2:1140745/1‑141 (MQ=255) ccATGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTATAAGTAAAATTGCTGATAAg > 2:626404/1‑141 (MQ=255) aTGCAAGATGGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCTGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAgcg > 1:878264/1‑139 (MQ=255) aTGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAggg > 1:672272/1‑141 (MQ=255) aTGCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAggg > 1:153145/1‑141 (MQ=255) gCAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAAGTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTAAAAATCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAggggg > 2:763832/1‑140 (MQ=255) cAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTa > 1:625281/1‑141 (MQ=255) aTTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTacaga < 1:479232/141‑5 (MQ=255) aTTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTacaga > 1:486021/1‑137 (MQ=255) aTTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATGGCGGATAAGGGGTacaga > 2:353603/1‑137 (MQ=255) aTTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGAAGATAAGAGTAGCGTTAAAAGCCGTCCTCAATAAAATTGCGGATAAgggagaaggt > 2:1079534/1‑134 (MQ=18) ttGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAGAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATGGCTGATAAGGGGTacagaa > 1:6247/1‑136 (MQ=255) ttGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAgcggaacagaa > 1:5942/1‑134 (MQ=255) ttGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTacagaa > 1:1121189/1‑136 (MQ=255) tGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTacagcaa > 2:388079/1‑135 (MQ=255) tGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTacagaaa > 1:350345/1‑135 (MQ=255) cagagaaGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTacagaaaaa < 1:544203/136‑9 (MQ=255) cTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGCGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTacagaaaaa < 2:1088932/141‑9 (MQ=255) cTGATAAAGGGTAAGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAATGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTacagaaaaa < 2:858051/141‑9 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1:1085062/1‑141 (MQ=255) aGCAGTTCTCAGTAAAATTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGc < 2:148679/141‑1 (MQ=255) aTTGCAGATAAGAGGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGa < 2:871941/141‑1 (MQ=255) gCAGATAAGAGGTACGTTACAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAACATTGCAGATAAGGGGTACAGaaaa < 1:763832/141‑1 (MQ=255) tgagagGTACGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAg < 1:339767/139‑1 (MQ=255) gTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTAc > 2:443662/1‑141 (MQ=255) aGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATGGAAGATAAGGGGTACAGAAAAAATAGACTTGATTACAAAATg > 2:703843/1‑141 (MQ=255) aGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAg > 1:196633/1‑141 (MQ=255) gTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGc < 1:961040/141‑1 (MQ=255) tAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCTTgg > 2:831223/1‑141 (MQ=255) aaaTTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCTTGGAACATa > 2:464066/1‑141 (MQ=255) cAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCTTGGGACATAAATGAt < 1:1063185/141‑1 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< 2:618485/141‑1 (MQ=17) cGTTAAAAGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAAGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTACAGAAACACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCTTGGGACATAAATGATTTTTTAAAAatga < 1:43204/141‑1 (MQ=17) aaaGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCTTGGGACATAAATGATTTTTTAAAAatgagatga < 1:669179/141‑1 (MQ=17) aaGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTGAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCTTGGGACATAAATGATTTTTCAAAAatgagatgag < 2:817374/141‑1 (MQ=255) aaGCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCGTGGGACATAAATGATTTTTTAAAAatgagatgag > 2:1125588/1‑141 (MQ=17) gCAGTTCTCAGTAAAATTGAGGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAACATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGATCTTGGGACATAAATGATTTTTTAAAAAtgagatgagag > 1:777342/1‑140 (MQ=255) gCAGTTCTCAGTAAAANTGCTGATAAAGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGGTTGGGACATAAATGATTTTTTAAAAATGAGATGAGAc < 1:1079534/141‑1 (MQ=255) gCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCTTGGGACATAAATGATTTTTTAAAAATGAGATGAGAc < 2:1066551/141‑1 (MQ=17) gCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCTTGGGACATAAATGATTTTTTAAAAATGAGATGAGAc < 2:765921/141‑1 (MQ=17) gCAGTTCTAGGCAAAATTGCAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCTTGGGACATAAATGATTTTTTAAAAATGAGATGAGAc < 1:283797/141‑1 (MQ=18) gCAGTTCTAGGAAAAATTACAGATAAGAGGTGCGTTAAAAGCAGTTCTCAGAAAAAATGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATGACAAAATCGAGCTTGGGACATAAATAAATAAAAAAAAATGAGATGAGAc < 2:336980/141‑1 (MQ=9) cAGTTCTCAGTAAAATTGCTGATAAGGGGTAAGTTAAAAGCAATCCTAAGTAAAATTGCAGATAAGGGGTACAGAAAAACTAGACTTGATTACAAAATGGAGCTTGGGACATAAATGATTTTTTAAAAATGAGATGAGACg < 1:1137994/141‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |