| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,311,043 | G→T | 4.1% | E302* (GAA→TAA) | recA → | recombination protein RecA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,311,043 | 0 | G | T | 4.1% | 364.6 / 3.2 | 106 | E302* (GAA→TAA) | recA | recombination protein RecA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/48); new base T (2/3); total (55/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
AGCTGAAGTTGATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCATTATTTGACGAAGA > CP000730/1310907‑1311179 | aGCTGAAGTTGATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGaaaa < 1:351320/141‑1 (MQ=255) cTGAAGTTGATTTTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAATCGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATg < 2:651019/141‑1 (MQ=255) cTGAAGTTGATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATg < 2:923543/141‑1 (MQ=255) gAAGTTGATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGGTTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTCTTCTTACAATGGCGAACGCATGCGCGACGGTAAGGGAACTGtt > 2:176089/1‑141 (MQ=255) gAAGTTGATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGtt > 1:1107546/1‑141 (MQ=255) aaGTTGATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGTAAAATGTTa > 1:974789/1‑141 (MQ=255) aaGTTGATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGTAAAATGTTa > 1:974701/1‑141 (MQ=255) aGTTGATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTaa < 1:1120205/141‑1 (MQ=255) aGTTGATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTaa < 1:457892/141‑1 (MQ=255) gTTGATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTaaa > 1:472162/1‑141 (MQ=255) tatatTATGTATGAACAAGGTATTTCTAAAGAAGGTGAAATTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGGCATCGTTGATAAATCAGGAGAATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATg < 1:162878/140‑1 (MQ=255) gATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATg < 1:570070/141‑1 (MQ=255) gATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATg < 1:1191659/141‑1 (MQ=255) gATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATg < 1:172824/141‑1 (MQ=255) atatTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGt > 1:77052/1‑141 (MQ=255) atatTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGt > 1:1059123/1‑141 (MQ=255) tattctGTATGGACAATGCATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTa < 1:65795/141‑1 (MQ=255) attatGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTAc < 1:1079077/141‑1 (MQ=255) attatGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTAc > 1:909083/1‑141 (MQ=255) ttatGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACt > 2:334264/1‑141 (MQ=255) tgtatgGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTga > 2:621117/1‑141 (MQ=255) atgGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTgaaag > 1:394536/1‑141 (MQ=255) aaGGTAGTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGGACTTGAAAGAAAATc < 2:79047/141‑1 (MQ=255) aaGGTAATTCAAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATc < 2:79078/141‑1 (MQ=255) aGGTATTTCTAAAGAGTGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATcc < 2:758291/141‑1 (MQ=255) aGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATcc < 2:394988/141‑1 (MQ=255) ggTATTTCTAAAGAGGGGTAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCca < 2:974183/141‑1 (MQ=255) gTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCcac > 2:846794/1‑141 (MQ=255) tttCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACaaa > 2:201765/1‑141 (MQ=255) ttCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAAt > 2:414977/1‑141 (MQ=255) ttCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAAt > 2:660532/1‑141 (MQ=255) ttCTAAAGAGGGTGAACCTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGCACGAATGGGTCAAGAGAAAGAAAATGTTAAAATGTAATGGAAAGAAAAGCCACAAAt > 2:232145/1‑141 (MQ=255) aaGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAaag > 1:479070/1‑141 (MQ=255) agGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAAAGACATCGTTGATAAATCAGGAGCCTGGCATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAaagaag < 1:565854/141‑1 (MQ=255) ggTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAgaagaa < 1:681069/141‑1 (MQ=255) ggTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAgaagaa > 2:1104686/1‑141 (MQ=255) ggTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAgaagaa < 2:1190455/141‑1 (MQ=255) gTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGaaa > 1:193892/1‑141 (MQ=255) tGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAAt > 2:1047054/1‑141 (MQ=255) aCTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGa > 2:621030/1‑141 (MQ=255) aCTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGa < 1:1112765/141‑1 (MQ=255) tATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAGGAAATTGATCg < 2:1194821/141‑1 (MQ=255) ttGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTa < 2:77052/141‑1 (MQ=255) aTTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAAt > 2:948685/1‑141 (MQ=255) tgtgtTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGCTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTgcga < 2:389883/140‑1 (MQ=255) ggTGTTGAACACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTgaga < 1:87705/141‑1 (MQ=255) ggTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGTAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTgaga < 2:974789/141‑1 (MQ=255) ggTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGTAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTgaga < 2:974701/141‑1 (MQ=255) ggTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTgaga > 1:1051500/1‑141 (MQ=255) gtgtTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTgagag < 2:394536/141‑1 (MQ=255) gtgtTGAAAACGAACTCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAACAGTACTGGAAAGAAAATCCGCAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTgagag < 1:281227/141‑1 (MQ=255) gtTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGaa > 2:939065/1‑141 (MQ=255) gtTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGaa > 1:602452/1‑141 (MQ=255) ttGAAAACGAAATCGTTGATAAATCAGGAGAATGTGATTCATACACTGGCTAACGAATGGTGCAAAGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGaaa > 2:251682/1‑141 (MQ=255) aaaaCGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAAt < 2:1107546/141‑1 (MQ=255) aCGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGGATGGGTCGAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAg > 1:1127946/1‑141 (MQ=255) aCGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAg > 2:866874/1‑141 (MQ=255) aCATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGta < 2:1059123/141‑1 (MQ=255) tCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATGGTAAATTGAGCGAAACATTAGGTatat > 2:270386/1‑141 (MQ=255) gTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGTTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCt > 2:762707/1‑141 (MQ=255) gTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAAACGGTCAATGTAAGTAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCt < 2:362707/141‑1 (MQ=255) ttGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTg > 2:155744/1‑141 (MQ=255) aTCAGGAGAATGGTATTCTTACAATGGCGACCGAATGGTTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGGAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGa < 2:511121/141‑1 (MQ=255) cAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATg < 2:642390/141‑1 (MQ=255) gAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTg > 2:206342/1‑141 (MQ=255) gAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTg > 2:1061742/1‑141 (MQ=255) ggCAGGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTga < 2:1079323/140‑1 (MQ=255) aGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTga < 1:744869/141‑1 (MQ=255) cATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTgaag > 1:151572/1‑141 (MQ=255) ggTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCATAAATTTAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGaaa < 1:524858/141‑1 (MQ=255) gTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTATAGTGAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGTTGATGTTGAAGAAAc > 1:284210/1‑141 (MQ=255) gTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTAAAGGTAAGGAAAATGTTAAAAGGTACGTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAAc > 1:283820/1‑141 (MQ=255) tATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACa > 1:749321/1‑141 (MQ=255) tATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACa > 2:831565/1‑141 (MQ=255) tATTCTTACAATGGACAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGCTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACa < 1:437863/141‑1 (MQ=255) aTTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACag < 1:753027/141‑1 (MQ=255) aTTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACaa > 2:519819/1‑140 (MQ=255) ttACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACagaaga < 1:176039/141‑1 (MQ=255) ttACAACGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACGTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACagaaga < 1:250374/141‑1 (MQ=255) tACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGATAcgaaaaaa > 2:1142397/1‑134 (MQ=255) aaaTGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGc < 2:133354/140‑1 (MQ=255) cgaacgaaTGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGACAAAATAGGTATATCAGATCGTGATGTTGAAGAACCAGAAGATGCACCaaa > 2:15820/1‑141 (MQ=255) cgaacgaaTGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCaaa < 1:1041714/141‑1 (MQ=255) gaacgaaTGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAg < 1:541786/141‑1 (MQ=255) aacgaaTGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGt > 2:968934/1‑141 (MQ=255) acgaaTGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTc > 1:9792/1‑141 (MQ=255) agaaTGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTAGACAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCa < 1:1117507/140‑1 (MQ=255) aTGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCatta > 2:62386/1‑141 (MQ=255) aTGGGACAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCatta < 1:277655/141‑1 (MQ=255) tGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCattat > 2:708657/1‑141 (MQ=255) tGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCattat > 2:936921/1‑141 (MQ=255) agggTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCattat < 2:560843/140‑1 (MQ=255) gggTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCattatt < 2:1140842/141‑1 (MQ=255) gggTCAAGGTAAGGAAAATGGTAAAATGCACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAGGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGATAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCattatt > 1:774413/1‑141 (MQ=255) ggTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCATTAttt < 1:948685/141‑1 (MQ=255) gTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCATTATTTg > 2:361118/1‑141 (MQ=255) aaGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAGTTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCATTATTTGACg > 2:340682/1‑141 (MQ=255) aGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCATTATTTGACga > 2:1159778/1‑141 (MQ=255) gTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAAATGGCTAGATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCATTATTTGACgaag < 1:1060680/141‑1 (MQ=255) tAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCATTATTTGACgaaga > 1:849038/1‑141 (MQ=255) | AGCTGAAGTTGATATTATGTATGGACAAGGTATTTCTAAAGAGGGTGAACTTATTGATTTAGGTGTTGAAAACGACATCGTTGATAAATCAGGAGCATGGTATTCTTACAATGGCGAACGAATGGGTCAAGGTAAGGAAAATGTTAAAATGTACTTGAAAGAAAATCCACAAATTAAAGAAGAAATTGATCGTAAATTGAGAGAAAAATTAGGTATATCTGATGGTGATGTTGAAGAAACAGAAGATGCACCAAAGTCATTATTTGACGAAGA > CP000730/1310907‑1311179 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |