| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 2,818,647 | 0 | A | G | 2.9% | 519.3 / 2.7 | 164 | intergenic (‑319/+226) | USA300HOU_2654/USA300HOU_2655 | serine‑threonine rich protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (74/83); new base G (2/3); total (77/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.51e-01 | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
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CGTATAATCTTTTTTTATATAAATTTGGCTAATTGGCTTTATGTTTAATCATTATAATTGTTTCGTTTTTAAAATAATTATTGTATTAATATATCTATACCATCCACCTTTTATTTATAAATAGTTAATTTACAACTAAACGATAAATATTATATGCAAAATACATCTTTAATATTAAAGTAATACCAATATTTTTTCAATAAACCTAGTGTAATATATGTGTAATTCTAAAAGATTCTTCTTTAAAAATATAAATACCACGACATATTGCTTTAACATT > CP000730/2818508‑2818787 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |