| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,027,191 | A→C | 9.6% | H252Q (CAT→CAG) | vraS ← | sensor histidine kinase VraS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,027,191 | 0 | A | C | 9.6% | 175.8 / 5.9 | 70 | H252Q (CAT→CAG) | vraS | sensor histidine kinase VraS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/29); new base C (4/3); total (37/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGATTTGTCTTTTAAACCAAGCGGTCTTA > CP000730/2027051‑2027327 | tcatcaACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACaaa < 2:591102/141‑1 (MQ=255) catcaACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAAt > 1:496877/1‑141 (MQ=255) aaaCATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGAt < 2:194468/140‑1 (MQ=255) aaCATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATc < 1:254614/141‑1 (MQ=255) cATTAAAACCTTTACCATTATGTTGAATTCTCAACAATAAATACTCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACCTGTGTACTGTTTGTATGTCGCAATGTATTCGTAATTGCTTCCTGTTTGATTCTTAGCAAATGATCtt > 1:478929/1‑141 (MQ=255) cATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCtt < 1:151534/141‑1 (MQ=255) aaaaCCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGGACAAATGTTCTTCAAt > 2:83699/1‑141 (MQ=255) aaaaCCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAAt > 2:369268/1‑141 (MQ=255) ccTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCt > 2:374284/1‑141 (MQ=255) ttACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTa > 1:435840/1‑141 (MQ=255) aTTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAACTGATCTTCAATACCTTTAGGCAc < 1:497375/141‑1 (MQ=255) tATCCTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACtt < 1:139588/141‑1 (MQ=255) aTCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACttt < 1:94935/141‑1 (MQ=255) tGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAACTGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTaaaa > 1:373514/1‑141 (MQ=255) tctcAACAATAAATAATCGTCTTGATTAAACAATTCTACTGTCACTTGTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTGAGGCACTTTAAAATCTTg < 2:340055/141‑1 (MQ=255) ctcAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAACTGATCTTGAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGt > 1:119706/1‑141 (MQ=255) ctcAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGt < 2:424702/141‑1 (MQ=255) caacaaTAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTAt < 2:372231/141‑1 (MQ=255) ataaataaTCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATGTTGTTTTTcct > 2:229347/1‑139 (MQ=255) taaataaTCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTAACGTTTGAATGAAGCAATGTATTAGAAATTGATACCTGCGTATTTCTGAACAAATGAACATCAATACCTCTATGCACGTTAAAATCTTGTATTTCATg > 2:52620/1‑141 (MQ=255) aaataaTCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTACATTCTTGTATTTCATGc < 2:461878/141‑1 (MQ=255) aaataaTCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGc > 2:451930/1‑141 (MQ=255) aaataaTCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGc < 2:48122/141‑1 (MQ=255) aataatCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGca > 1:409008/1‑141 (MQ=255) cTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTAATGAACACCTTTCa > 1:342850/1‑141 (MQ=255) cTTTATCAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCa > 2:337443/1‑141 (MQ=255) tattaAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGCCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTg > 2:424327/1‑141 (MQ=255) tattaAACAATTCTACCGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTg > 2:122619/1‑141 (MQ=255) attaAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGCATTTCATGCACAACTTTCATTgg > 2:96612/1‑141 (MQ=255) ttaAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAACTGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGc > 2:391111/1‑141 (MQ=255) ttaAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGc > 2:263436/1‑141 (MQ=255) taAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGCCGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCa < 1:263436/141‑1 (MQ=255) cAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTGCATTGGCA‑Cttt > 2:579182/1‑141 (MQ=255) cAATTCTAATGTCACTTTCGCACCCTCTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAACGATCTTCAATACCTTTCGGCACTTTAAACTCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑Cttt < 1:326942/141‑1 (MQ=255) tttCTACTGGCACTTTTTTACCGTTTGAATCACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑Cttttt < 1:321293/140‑1 (MQ=255) cTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCGCAACTTTCATTGGCC‑Ctttttttt > 2:7504/1‑141 (MQ=255) cTACTGTCAATTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTACTGTGTAATTCTAAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCGCTTTAAAATCTTGTGTTTCATGCGCAACTTTCATTGGCC‑Ctttttctt > 2:109517/1‑141 (MQ=255) tACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTg > 1:566154/1‑141 (MQ=255) tGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTCAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTaa < 2:438076/141‑1 (MQ=255) ttCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTaaa < 2:484556/140‑1 (MQ=255) gTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTaaa < 1:575626/141‑1 (MQ=255) ccTTTTGTACCGTTTGAATGACGCTATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCa < 2:561678/140‑1 (MQ=255) gTACCGGTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAACTGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGC‑‑CCTTTTTTTGTAAATCAATAACTa > 1:103332/1‑141 (MQ=255) ccGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAACCTTGTCGCGCAGTCACAAATTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTaaa > 1:441432/1‑141 (MQ=255) tttGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCt < 2:294744/141‑1 (MQ=255) gAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTa > 2:542692/1‑141 (MQ=255) gACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATAc < 2:344804/141‑1 (MQ=255) aCGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTTTTTTTCAATAACTAAAACTTTA‑AAAcc > 2:174746/1‑141 (MQ=255) cAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTTTTATTTTTTAACTAAATCTTTA‑ATACCCTc > 2:544991/1‑141 (MQ=255) aaTGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCa > 1:193380/1‑141 (MQ=255) tgtgTTCGAATTTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CCTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCAcc < 2:43416/141‑1 (MQ=255) aTTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAGATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTaa > 1:437459/1‑141 (MQ=255) aTTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATACCTACATCTTTA‑ATACCCTCACCTaa > 2:609724/1‑141 (MQ=255) aTTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTaa > 1:108555/1‑141 (MQ=255) aTTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTaa < 2:374119/141‑1 (MQ=255) gAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGAt < 1:187133/141‑1 (MQ=255) aaaTTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTACATCTCTA‑ACACCCTCAccctcagcct < 2:510813/141‑9 (MQ=255) ttGCTTCCTGTTTAATTCTCATCAAATGAGCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTGCATGGACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCGCCTAAAGATTTGt < 2:155371/141‑1 (MQ=255) gCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATCCCCTCACCTAAAGATTTGTCt > 2:498364/1‑141 (MQ=255) gCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAACGATTTGTCt > 1:108282/1‑141 (MQ=255) ttCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGATTTGTCttt > 1:211066/1‑141 (MQ=255) ccTGTGTAAGTCTTCACAATTGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTAAACATCTAATATATCGTTCACAGCTTTCATTGTCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGACTTGTCTTTTa < 2:489621/141‑1 (MQ=255) cTGTGTACTTCCGAACCACTGCTCTTTAATCCCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGGATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGATTTGTCTTTTaa < 2:476190/141‑1 (MQ=255) cTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑C‑TTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGATTTGTCTTTTaaa < 2:192744/141‑1 (MQ=255) taTTCTGAATAAAACATTTTTAACTCCTTTAGGCAATTTAAAATCTTGTATTTAATGAACAACTTTCATTGGCACCTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTACATTCCGT‑ACCTACAGATTTGTCTTTTAAACCaa < 2:102841/140‑1 (MQ=255) aTTCTGAACAACTGATCGTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACCACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCCAAAGCTTTGTCTTTTAAACCAAGc < 1:314345/141‑1 (MQ=255) tCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGATTTGTCTTTTAAACCAAGCgg > 2:567873/1‑141 (MQ=255) tCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGATTTGTCTTTTAAACCAAGCgg < 1:243125/141‑1 (MQ=255) tGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGATTTGTCCTTTAAACCAAGCGGTc < 1:305092/141‑1 (MQ=255) aaacaacTGATCTTCAATACCTTTAGCCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGATTTGTCTTTTAAACCAAGCGGTCt < 2:119706/140‑1 (MQ=255) aCAAATTATCCTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGAACACCTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGATTTGTCTTTTAAACCAAGCGGTCTTa < 1:201222/141‑1 (MQ=255) aCAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGTTTTGTTTTTTAAACTAAGCAGTCTTa > 2:518982/1‑141 (MQ=255) | TCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAAATAATCGTCTTTATTAAACAATTCTACTGTCACTTTTGTACCGTTTGAATGACGCAATGTATTCGAAATTGCTTCCTGTGTAATTCTGAACAAATGATCTTCAATACCTTTAGGCACTTTAAAATCTTGTATTTCATGCACAACTTTCATTGGCA‑CTTTTTTTTGTAAATCAATAACTAAATCTTTA‑ATACCCTCACCTAAAGATTTGTCTTTTAAACCAAGCGGTCTTA > CP000730/2027051‑2027327 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |