Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP000730 | 2,289,262 | C→G | 100% | W76C (TGG→TGC) | USA300HOU_2153 ← | hypothetical membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP000730 | 2,289,262 | 0 | C | G | 96.2% | 186.1 / ‑1.9 | 68 | W76C (TGG→TGC) | USA300HOU_2153 | hypothetical membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base G (24/39); total (28/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.57e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
GATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGA > CP000730/2289131‑2289397 | gATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAAt > 2:666229/1‑140 (MQ=255) gATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACACCGCATTGAAt > 2:360334/1‑140 (MQ=255) gATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTAAGTCGACCAAGGTGTTCTAAGGCACGTCTAAATTCTGGTAGAAATATTCCTACCAAAGCTACTACCCCGCATTGAAt < 1:159031/140‑1 (MQ=255) aTCAATTTTTCTTCATCTTTACTAAACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGat < 2:726559/140‑1 (MQ=255) aTTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCg < 2:13093/140‑1 (MQ=255) aTTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCg < 2:447336/140‑1 (MQ=255) tttCTTTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGa < 2:320188/140‑1 (MQ=255) ctctTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGaata > 2:432616/1‑140 (MQ=255) tctTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTGGTTCTAAAGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGTTCTAGaataa > 2:95413/1‑140 (MQ=255) ttCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAAGGATATCGAATAAtt < 2:517297/140‑1 (MQ=255) aCTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTg > 1:508017/1‑140 (MQ=255) cgaCGTATTAGAAGTATAGCCTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAg < 2:228331/138‑1 (MQ=255) taCGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTGCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTTCAGt < 2:461954/140‑1 (MQ=255) aTTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTATAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGt < 1:52116/140‑1 (MQ=255) aTTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGt > 2:398260/1‑140 (MQ=255) aTTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGt < 1:64682/140‑1 (MQ=255) tAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACTCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTTTTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTc < 1:441899/140‑1 (MQ=255) aGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCa < 2:241227/140‑1 (MQ=255) caGTATAGGGTTTGAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTTCAGTCAAGTTCAat < 2:578625/139‑1 (MQ=255) acctataGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTTTTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATAACGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCCat > 2:655437/4‑140 (MQ=255) aaGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTTAATAACGATATCGAATAATTTACATGGAGCCGTCAAGGTCaac > 2:38463/1‑139 (MQ=255) tataGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATc > 2:251499/1‑140 (MQ=255) taGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAGTAATATAGATGTTGCTGTTCAGCTCAATATAAt > 2:63363/1‑140 (MQ=255) taGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCAt > 1:9570/1‑140 (MQ=255) aGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATa < 2:596730/140‑1 (MQ=255) gCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAACTTTTTCCCCTCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATAc > 1:748362/1‑140 (MQ=255) gTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACtt > 1:312608/1‑140 (MQ=255) cttttAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCAGCATTGAATACCGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACtt < 2:610102/139‑1 (MQ=255) tttAAAAAGCTCCCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTAt < 2:712897/140‑1 (MQ=255) tttAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTAt < 2:215387/140‑1 (MQ=255) tttAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTAt < 2:194624/140‑1 (MQ=255) tttAAAAAGCTACCTCGTCCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGCATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTAt < 2:252683/140‑1 (MQ=255) tAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATct < 1:296829/140‑1 (MQ=255) tAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTATAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGGTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATct < 1:350919/140‑1 (MQ=255) aaaaaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTTGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATAGAATAATTTAGATGTTGCAGTAAAGTTCAATATCATACTTAtttt > 2:343024/1‑137 (MQ=255) aaaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATctgct < 1:629742/140‑1 (MQ=255) aaaGCTACCTCTACCAAGTTGGTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTAGTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATctgct < 1:173528/140‑1 (MQ=255) gCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGAc < 2:502581/140‑1 (MQ=255) ccTCTACCAAGTTTTTCTAACGTACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAAt < 1:509479/140‑1 (MQ=255) ccTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTTTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAAt < 1:286654/140‑1 (MQ=255) ccTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAAt < 1:422190/140‑1 (MQ=255) tctACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATaa > 2:135109/1‑140 (MQ=255) aGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAAATGTTTCAGTCAACTTCAATATCTTACTAATGTGCTTACCAATAACAATTAc > 1:287137/1‑140 (MQ=255) gttgttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACt < 1:583171/140‑1 (MQ=255) gttgttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACt < 1:631019/140‑1 (MQ=255) gtgcttCTAACGCACGGCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATCATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACt < 2:509167/136‑1 (MQ=255) ttgttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTATATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACCATTACTa < 1:680562/140‑1 (MQ=255) ttgttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTa < 1:500025/140‑1 (MQ=255) ttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTACTGACCAATAACAATTACTAata > 1:37896/1‑140 (MQ=255) cTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACCATTACTAATATc > 2:384920/1‑140 (MQ=255) cTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAataac > 1:453027/1‑138 (MQ=255) cTAACGCACGACTAATTTCTGGTTGGAATATTACTAGTAACGGTCATACCCCATATGTAATAAGGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATc > 2:159797/1‑140 (MQ=255) aaCGCACGTCTAACTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACttaattccc < 2:658222/140‑9 (MQ=255) cGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCtt > 2:655195/1‑140 (MQ=255) cGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACAAAATCAAATAATTTAGATGTAGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCACtt > 1:200919/1‑140 (MQ=255) cACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTTTCTGCTGACCAATAACCATTACTAATATcccgtaa > 2:446043/1‑136 (MQ=255) cTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTaa > 2:366062/1‑140 (MQ=255) tAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAAt > 2:220502/1‑140 (MQ=255) tAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAAt > 2:663006/1‑140 (MQ=255) cTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATc > 1:434186/1‑140 (MQ=255) tGGAAGATTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGTGATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCttt < 2:170958/140‑1 (MQ=255) tatTACTATTAATGCTCATACCCCGCTTTGAATAACGATATCGAATATTTTAGATGTTGCAGTCTAGTTCTATTTCATTCTTTTCTGCTGATCAATATCTATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTc < 1:27236/140‑1 (MQ=255) atTACTATTAAAGCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTcc < 1:398260/140‑1 (MQ=255) gCTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGt < 1:382917/140‑1 (MQ=255) cTAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGtg < 1:350214/140‑1 (MQ=255) tAATACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGtga > 2:634694/1‑140 (MQ=255) gaaTACCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGGTGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGtga < 2:412603/139‑1 (MQ=255) aCCCCGCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATgag < 1:263049/140‑1 (MQ=255) ccccgcATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATgaga < 1:536576/140‑1 (MQ=255) ccccgcATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATgaga < 2:434186/140‑1 (MQ=255) | GATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGA > CP000730/2289131‑2289397 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |