| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,544,339 | C→T | 100% | V189V (GTC→GTT) | hlgC → | gamma hemolysin component C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,544,339 | 0 | C | T | 95.6% | 175.6 / 1.2 | 70 | V189V (GTC→GTT) | hlgC | gamma hemolysin component C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base T (41/24); total (43/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.41e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
ATCGGTGGTAATTTCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTCAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGTTCCAGACAGTGAGTTACCAC > CP000730/2544202‑2544463 | atCGGTGGTAGTTTCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTaa > 2:514077/1‑140 (MQ=255)atCGGTGGTAATTTCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTGTCTGG‑GGCGTTaa > 2:744559/1‑140 (MQ=255)atCGGTGGTAATTTCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTATAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTaa > 2:66587/1‑140 (MQ=255) tCGGTGGTAATTTCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTAAGTAAGTGAAGTAGAACAACAACACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GACGTTaaa > 2:31044/1‑140 (MQ=255) aTTTCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAattca > 2:451060/1‑140 (MQ=255) aTTTCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAAAAACAAAACTCAAAAAGGGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAattaa > 2:20823/1‑138 (MQ=255) ttCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACCAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAattcatt > 2:296749/1‑140 (MQ=255) ttCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATGAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGCTTTATGG‑GGCGTTACAGCGAattcatt > 2:442444/1‑140 (MQ=255) tCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAattcattc > 2:715276/1‑140 (MQ=255) tCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAattcattc > 2:729093/1‑140 (MQ=255) tCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCAc > 2:752121/1‑140 (MQ=255) tCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCAc > 1:194888/1‑140 (MQ=255) tCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAAAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCAc > 1:194937/1‑140 (MQ=255) aGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAATTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTg > 2:169903/1‑140 (MQ=255) aGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTg < 2:663571/140‑1 (MQ=255) cccATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAAt > 2:362631/1‑140 (MQ=255) cATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCa > 1:759357/1‑140 (MQ=255) tacccGGTAGTAATGGAACAATTAACTATTCAAAATCAATCACCAAAACAAAACCTAAATATATAAAACAAATAAAAAAATAAAAATAAAAAAGTATTTTATGG‑CGCGTTAAAGCTAATTCATTCGCCACTGAATCAGGt < 2:283898/136‑1 (MQ=255) ggtggtAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAATGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCaaaa > 1:102073/1‑140 (MQ=255) ggtAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAATTCCTTTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATc < 1:590032/140‑1 (MQ=255) aTGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGcc < 1:567271/140‑1 (MQ=255) aTGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGcc > 1:96729/1‑140 (MQ=255) ggATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGAGAATTAATACGCCCCTGAATCAGAACAAAAagcagcata > 2:716535/1‑137 (MQ=255) tAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCg > 1:454680/1‑140 (MQ=255) aaCTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGa < 1:598544/140‑1 (MQ=255) aaCTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGAATAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGa > 1:589925/1‑140 (MQ=255) aatCTAAATCGATTAACAAAACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGattta < 2:446256/138‑1 (MQ=255) aTTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAATAAGTGTTTTATTG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGattta < 2:428890/140‑1 (MQ=255) ttCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATACGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATGGCGatttat > 2:171786/1‑140 (MQ=255) tCTAAATCGATTATCTTTCCACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTATAATTACTTCACTCTTAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGTGAATTTATTCGTCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGatttatt < 1:670580/140‑1 (MQ=255) cGATTAGCTACACAGAACCAAGTTATACAAGAGAAGNAGAACAACAACCCTCAAGAAGCATCTAACGGCGGTGT‑AAAGCTAATTCATTGGACAAAAAATCAAAACAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGc < 2:1933/140‑1 (MQ=255) gATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCt < 1:677040/140‑1 (MQ=255) aTTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTa < 1:339599/140‑1 (MQ=255) aTTAGCTAGACACAACTAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTa < 2:392039/140‑1 (MQ=255) tAGCTATACAAAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTCAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACa < 1:427427/140‑1 (MQ=255) gCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGCATTACTTCGCCACTGCATCCGGACACAACTCAGACTTGGATAGGGATTTAATTGTAGGCTACaaa > 2:522635/1‑140 (MQ=255) gCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCAATGCATCAGGTCAGCAATCGGCCTTTGAGAGCGAGTTATCTGTAGGCTACaag > 2:522654/1‑139 (MQ=255) tataCACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTCAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAAcc > 2:289957/1‑140 (MQ=255) ataCACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAACGAATTCATTCGCCACTAAATAAGGTCAAAAAGCAGCCATTGATAGCGGTTTATTTGTAGCCTACAAACCt > 1:235177/1‑140 (MQ=255) ataCACAACAAAATTATGTAAGTGAACTAGAACAACATAAAGCAAACAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGACACTGAATCAGGTCACAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCt < 2:728629/140‑1 (MQ=255) cacaACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCAt > 1:597636/1‑140 (MQ=255) cacaACAAAATTATGTAAGAGAAATAGAACAACAAAACTCAAAAATTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCAt < 1:476785/140‑1 (MQ=255) caacaaAATTATGTAAGTGAAGTAGACCAAGTCGACGCTGTAGGTGTTTAATGG‑GGCGTCAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGATACacagctactag < 2:343443/140‑11 (MQ=255) aacaaAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACATCATAGt > 2:119152/1‑140 (MQ=255) caaAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGATAAAGCGAATTCATTCGCCACTGACTCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTAATAGTaa > 1:392025/1‑140 (MQ=255) aaTTATGTAAGTGAAGTAGTACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCAAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGAGTTATTTGTAGGCTACAAACCGCATAGTAAAGa > 2:425781/1‑140 (MQ=255) aaTTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGa > 1:679810/1‑140 (MQ=255) ggaatttaaggaaaacaacTAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGAGATAAAGCGAATTAATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAAACAGCCTAAGATCGTCATTTCTTTTAAGGCTACAAACCACAAAGTACAGACCCTag > 2:728232/14‑140 (MQ=255) gTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCAag > 1:538534/1‑140 (MQ=255) gTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCACATAGCAAAGATCCTag > 2:2801/1‑140 (MQ=255) tGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGatt < 1:264425/140‑1 (MQ=255) gAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAATCCTCATAGTAAAGATCCTAGAGatta < 2:454680/140‑1 (MQ=255) aaGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCGGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATACTAGAGcttat > 2:382596/1‑140 (MQ=255) aaGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGattat < 1:581570/140‑1 (MQ=255) aaGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATACTAGAGattat > 2:458866/1‑140 (MQ=255) gTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTAttt < 1:451060/140‑1 (MQ=255) aGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTAtttgg > 1:166463/1‑138 (MQ=255) aGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCg > 1:276228/1‑140 (MQ=255) gAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATACTAGAGATTATTTCGt > 2:529140/1‑140 (MQ=255) gAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTAGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGt > 2:560162/1‑140 (MQ=255) aacaacAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGtt > 2:628253/1‑140 (MQ=255) aacaacAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGtt > 2:70081/1‑140 (MQ=255) aacaacAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGtt > 1:724876/1‑140 (MQ=255) aaCTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGTTCCAGACAg < 1:433985/140‑1 (MQ=255) aaaaaGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGTTCCAGACAGTGAGt < 1:611545/140‑1 (MQ=255) aaaaGTGTTTGATGG‑GTCGTTAACGCGAAGGCATCCGCCACTGCTTGCTTACAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGTTCCAGACAGTGAGtt < 1:171786/140‑1 (MQ=255) aaGTGTTTTATGG‑GGCTTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTAAAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGTTCCAGACAGTGAGTTac < 2:60172/140‑1 (MQ=255) aaGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGTTCCAGACCGTGAGTTac < 1:557378/140‑1 (MQ=255) aaGTGTTTTATGG‑GGCGTTAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGTTCCAGACAGTGAGTTac < 1:331575/140‑1 (MQ=255) tgtTTTATGG‑GGCGTTAATGCCAATTCATTCGTCACTGAATCAGGTCTAATATCAGTCTTTGATAGCTATTTATTTGTAGGCTACAAACCTTATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGTTCCAGACAGTGAGTTaccac < 2:423670/140‑1 (MQ=255) | ATCGGTGGTAATTTCCAATCAGCCCCATCACTCGGTGGTAATGGATCATTTAACTATTCTAAATCGATTAGCTATACACAACAAAATTATGTAAGTGAAGTAGAACAACAAAACTCAAAAAGTGTTTTATGG‑GGCGTCAAAGCGAATTCATTCGCCACTGAATCAGGTCAAAAATCAGCCTTTGATAGCGATTTATTTGTAGGCTACAAACCTCATAGTAAAGATCCTAGAGATTATTTCGTTCCAGACAGTGAGTTACCAC > CP000730/2544202‑2544463 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |