| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 512620 = | 60 (0.860) | 47 (1.040) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAAAAAAC |
28/170 | NT | 55.0% | intergenic (+688/‑173) | recR/rrs1 | recombination protein RecR/16S ribosomal RNA |
| ? | CP000730 | 2176447 = | 58 (0.830) | noncoding (114/114 nt) | rrf5 | 5S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
ACATTTCTCGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATTC > CP000730/2176312‑2176586 | aCATTTCTCGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTg < 1:285124/141‑1 (MQ=255)aCATTTCTCGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTg > 1:676846/1‑141 (MQ=255)aCATTTCTCGTTTCGTCAGAGTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTTTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTg < 1:48417/141‑1 (MQ=255) cATTTCTCGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTgg > 1:289823/1‑141 (MQ=40) catattgtcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGc < 2:712315‑M2/8‑1 (MQ=255) tttCTCGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCa > 2:139927/1‑141 (MQ=39) tttCTCGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCa > 2:514678/1‑141 (MQ=39) tctcGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAAc > 1:98340/1‑141 (MQ=39) tctcGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGCTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCCAc > 2:298868/1‑141 (MQ=255) attgtcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttataaacatttaagtcaataactttttttctcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAAc > 1:269052‑M2/131‑141 (MQ=255) tgtcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGt > 2:152918‑M2/129‑141 (MQ=255) tgtcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataaatttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaacacTGCCTGGCAACGt > 1:546083‑M2/129‑141 (MQ=255) tcggtgcGTCAGAGTCTGACGTTTTCACTT‑GCCAAGCCATCGGTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGtt > 2:800462/7‑141 (MQ=14) tcGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAGAAAGAGACCTTTCGTTCGCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTCGCacact > 2:168720/1‑137 (MQ=14) tcGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGt > 2:36882/1‑141 (MQ=39) cGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGtt > 2:48733/1‑141 (MQ=39) tcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTc < 1:552990‑M2/15‑1 (MQ=255) gTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCCCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGttt > 1:251802/1‑140 (MQ=255) cattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCt > 2:389098‑M2/126‑141 (MQ=255) ttcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCACCGTTCTAc > 2:637819‑M2/124‑141 (MQ=255) ttcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaacaaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAATGTTCTAc > 2:228241‑M2/124‑141 (MQ=255) tgcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagagttaattatagattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttgactaagatttgactaaaaaactgcctggacagattctac > 2:650677‑M2/124‑130 (MQ=255) gTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCACCGTTCTActc > 1:101409/1‑141 (MQ=255) cagttgttaatgttgatttttcttactgacaataattaatcatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcgtttccattttatttttttaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTActc < 2:324064‑M2/20‑1 (MQ=255) cAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTa < 1:443586/141‑1 (MQ=39) agcGTTTCTACGTCGCCACGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTGAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACg < 2:606668/139‑1 (MQ=14) cGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACCTa > 1:272854/1‑141 (MQ=38) tttCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGt < 1:36882/141‑1 (MQ=39) tttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGtt > 1:450128‑M2/106‑141 (MQ=255) ttCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACt < 1:78893/141‑1 (MQ=39) cttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaacaggggattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACt > 1:384981‑M2/101‑141 (MQ=255) cttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGCACGTAAGTTCGACt > 1:249492‑M2/101‑141 (MQ=255) cttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACt < 1:480438‑M2/41‑1 (MQ=255) cttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCAGAAAGTAAGTTCGACt > 1:231814‑M2/101‑141 (MQ=255) ctagCCAATCCAGCTTTCTTTGTGTTTGCTTCTATTTTGACGTTTTAGACACAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCCCATCGCATCCACTTTCTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACt < 1:61055/138‑1 (MQ=14) ttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTACGTTCGACTa > 1:226205‑M2/100‑141 (MQ=255) tCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTCGACATAGACGCAGAGACCTTGCAGGCGCATTTCGGCGCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTa > 1:189905/1‑141 (MQ=14) taccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTAc < 2:155771‑M2/43‑1 (MQ=255) accgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTAcc < 1:195168‑M2/44‑1 (MQ=255) acaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCg < 1:700948‑M2/48‑1 (MQ=255) aaaagaattaattatcntttttatcaacatttaagtcaataactgtttttagctttgccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCGTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCg < 1:658220‑M2/48‑1 (MQ=255) aaggatttattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGAc < 2:769101‑M2/50‑1 (MQ=255) aagaattaattatacattttttcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGAc < 2:333496‑M2/50‑1 (MQ=255) aagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGAc < 1:173‑M2/50‑1 (MQ=255) aagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGAc < 1:650296‑M2/50‑1 (MQ=255) ttttctttGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCCAGTACCATCGACGCTa < 2:292547/140‑1 (MQ=25) tacttatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAg < 1:89208‑M2/56‑1 (MQ=255) aattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTCCCATCGACGCTAAgg > 1:713948‑M2/85‑141 (MQ=255) ttatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAg < 1:466934‑M2/59‑1 (MQ=255) tatacattttatcatcatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTGTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGc < 1:577433‑M2/60‑1 (MQ=255) tatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGc < 1:132952‑M2/60‑1 (MQ=255) atacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCt < 2:399062‑M2/61‑1 (MQ=255) gtTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTaa < 1:267605/141‑1 (MQ=35) atcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCtg > 2:124474‑M2/72‑141 (MQ=255) 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1:112260‑M2/108‑1 (MQ=255) ttttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAg < 1:285627‑M2/108‑1 (MQ=255) ggTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGCGCTTAACTTCTGTGTTCGGCCTGGGAACAGGTGTGACCTCCTCGCTATAGTc > 2:220498/1‑141 (MQ=12) attttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCAc < 1:634022‑M2/112‑1 (MQ=255) ttttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCAcc > 2:245075‑M2/29‑141 (MQ=255) ttttaatcaaattttggttaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAg > 1:746054‑M2/27‑141 (MQ=255) ttttaatcaaattttggttaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAg > 2:55821‑M2/27‑141 (MQ=255) cGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACata > 1:790214/1‑141 (MQ=32) cGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTCCTATAGTCACCAGACcta > 1:687363/1‑141 (MQ=17) ccaaaatttgattaaaaaacTGCCTTGCAACGTTCTCCTCTAGCGGTACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACatat < 2:200982‑M2/121‑1 (MQ=255) cATCGCATCCACTTTTTGCCTGTCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATCGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGTAt > 2:716572/1‑141 (MQ=12) cATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAAt > 2:463635/1‑141 (MQ=32) cATCGCAGCCACTTTTTGCCTGGCAACGTGCTAGTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCACCGCCGCTAAGGAGTTTAACTTCTGTGTTCTGCATGGGAATAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAAt < 1:679555/141‑1 (MQ=11) aatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAAt < 2:12076‑M2/125‑1 (MQ=255) tCGCATCCACTTTTCGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCAGCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGt < 1:216168/141‑1 (MQ=17) attaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTACTCCTCACCATTCGGGAACAGGTTGGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATgtaatt > 1:792368‑M2/11‑139 (MQ=255) aCTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATtata > 1:468194/1‑141 (MQ=33) ttttGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACAt > 2:591293/1‑141 (MQ=32) ttGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATTc < 2:735623/141‑1 (MQ=32) | ACATTTCTCGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATTC > CP000730/2176312‑2176586 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |