| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 667,735 | A→C | 5.4% | intergenic (+767/‑281) | USA300HOU_0609 → / → adh | phosphohydrolase/alcohol dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 667,735 | 0 | A | C | 5.4% | 209.2 / 4.4 | 74 | intergenic (+767/‑281) | USA300HOU_0609/adh | phosphohydrolase/alcohol dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/46); new base C (2/2); total (26/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.90e-01 | |||||||||||
AAATAATGTCTTAGATTGATTGGGAGTTTTTTTAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGTTGATATCTAACTA > CP000730/667596‑667875 | aagtaatGTCTTAGATTGATTGGGAGTTTTTTTAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAag < 2:352541/138‑1 (MQ=255)aaaTAATGTCTTAGATTGATTGGGAGTTTTTTTAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAag < 2:237769/141‑1 (MQ=255)aaaTAATGTCTTAGATTGATTGGGAGTTTTTTTAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAag < 1:440870/141‑1 (MQ=255)aaaTAATGTCTTAGATTGAGTGGAAGTTTTTTTAATTTTTTTTAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAag < 1:368195/141‑1 (MQ=255) tGTCTTAGATTGATTGGGAGTTTTTTTAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGaa < 1:686622/141‑1 (MQ=255) tGTCTTAGATTGATTGGGAGTTTTTTTAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGaa < 1:509881/141‑1 (MQ=255) aGATTGATTGGGAGTTTTTTTAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAag > 1:231663/1‑141 (MQ=255) aGATTGATTGGGAGTTTTTTTAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACAATATAATAAGAGTGAAAATaaa > 2:117653/1‑140 (MQ=255) tttattgGGAGTTTTTTCAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGt < 2:140532/138‑1 (MQ=255) ttgGGAGTTTTTTTAATTTTTTTGAAATTAAATTAATATGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATAATTTGTGGTTTAATTCACATTATAATAAGAGTAAAGATAAGAGtatta > 2:226860/1‑141 (MQ=255) gggAGTTTTTTTAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATtata > 1:27281/1‑141 (MQ=255) tttttttAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTa > 2:402868/1‑141 (MQ=255) ttttAATTTTTTANAAAATAAATTAATCTCNAATTAATAAAAAATCTGAATAACTGACAAATTTTTTTGATCATCGCTATATACTTTGTGAATTAATTCAAATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCt < 1:55763/141‑1 (MQ=255) tttAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCtt < 2:674606/141‑1 (MQ=255) tttttttGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATACGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTtaaat > 1:706721/1‑141 (MQ=255) tttttttGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATACGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTtaaat > 1:86907/1‑141 (MQ=255) aaattaaTCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTTATTTTTGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGaa > 2:29355/1‑141 (MQ=255) aaattaaTCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGaa > 1:770838/1‑141 (MQ=255) aattaattTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAg < 2:489143/141‑1 (MQ=255) aattaaTCTGTATTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATATTAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAg < 1:543440/141‑1 (MQ=255) aattaaTCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAg < 1:320556/141‑1 (MQ=255) aattaaACTGTAATTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGCAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAg < 2:433025/141‑1 (MQ=255) ttaaTCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTa < 1:463688/141‑1 (MQ=255) ttaaTCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTa < 1:270159/141‑1 (MQ=255) ttaaTCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTa > 1:785709/1‑141 (MQ=255) taaTCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTaa > 1:470407/1‑141 (MQ=255) tCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTaaaaa > 2:178997/1‑141 (MQ=255) cTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAAt < 2:756818/141‑1 (MQ=255) taaAGAATTTGAATAACTGACACATGTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTCTAATAAGAGTGAAGATACGAGTATTATCAATTATCTTTAATTAAATATATGTGACGGAGAAGTTACACGtttg > 2:430083/1‑139 (MQ=255) taaAAAATTTGAATAACTGACACATTTTCTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAg > 2:91639/1‑141 (MQ=255) aaaaTTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATACGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCat < 2:706721/141‑1 (MQ=255) aaaaTTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATACGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCat < 2:86907/141‑1 (MQ=255) aaaaTTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCat < 2:669374/141‑1 (MQ=255) aaaaGTGGAATAACTGACACATTTTTTCTATCATATCTATATACTTGGGGAATTTATGCACATGATAAGAAGAGTGAAGATAAGATTATTAGAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCat < 1:364574/141‑1 (MQ=255) aaaTTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCata > 2:208040/1‑141 (MQ=255) aaaTTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCata > 1:774066/1‑141 (MQ=255) tAACTGACACATTTTTTTGATTATAGCTATATACGTTGGTAATTAATTCAAATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATg < 2:631546/141‑1 (MQ=255) tAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATg > 2:231123/1‑141 (MQ=255) aaCTGACATATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGt < 2:697320/141‑1 (MQ=255) aaCTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGt < 2:119257/141‑1 (MQ=255) aaCTAACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAACATTACACGTTAGCATATCGATTATGt < 2:502642/141‑1 (MQ=255) aCTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATATTCAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATATATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTc < 2:431423/141‑1 (MQ=255) tGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCTATTCTTTCAt > 2:130912/1‑141 (MQ=255) tGACACATTTTTTTGATCATAGATATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCAt < 2:750880/141‑1 (MQ=255) tGACAAATTTTTTTGATCATAGCTATAAACTTTTTGAATTAATTCAAATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCAt < 1:171372/141‑1 (MQ=255) tGAAACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCAt < 2:200654/141‑1 (MQ=255) gACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATACATTATCTTTTAATAAATCTATGTGCAGTAAACATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCAtt < 2:799299/141‑1 (MQ=255) ataTTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCt < 2:79708/139‑1 (MQ=255) caTTTTTTTGATCAGAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGCAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCtt < 2:491455/141‑1 (MQ=255) caTTTTTTTGAGCATAGCTATATATTTTGTTAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCtt < 2:36476/141‑1 (MQ=255) tttttGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATCTTCAAACTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTaa < 1:383059/141‑1 (MQ=255) tttttGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTaa > 2:227364/1‑141 (MQ=255) tttttGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTaa < 2:351213/141‑1 (MQ=255) ttttGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAAc < 1:259425/141‑1 (MQ=255) ttttGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAAc < 1:92752/141‑1 (MQ=255) tGATCATAGCTATATACTTAGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATCTGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACaat > 1:454159/1‑139 (MQ=255) aGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTa < 1:82050/141‑1 (MQ=255) tatataCTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAgga > 1:341422/1‑140 (MQ=255) atataCTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGa > 1:153963/1‑141 (MQ=255) tataCTTTGTGTATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAACTTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAACTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGaa < 1:218584/141‑1 (MQ=255) tataCTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGaa < 2:241094/141‑1 (MQ=255) taCTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAAc > 2:542174/1‑141 (MQ=255) taCTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATCATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAAc < 1:402868/141‑1 (MQ=255) cTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTGTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAAGGAAACGt > 1:253265/1‑141 (MQ=255) tttGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGtt < 1:31428/141‑1 (MQ=255) ttGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTa < 2:143950/141‑1 (MQ=255) tgAATTAATTCAGATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTaaaa < 2:455504/141‑1 (MQ=255) tgAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTaaaa < 2:27281/141‑1 (MQ=255) gAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAg < 1:347050/141‑1 (MQ=255) attaattCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACAGGGTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAAAATATTAACTAGGGGAACGTGAAAAGtg > 1:145988/1‑140 (MQ=255) attaattCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGtt > 1:404150/1‑141 (MQ=255) ttCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACgg < 1:231123/141‑1 (MQ=255) ttCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACgg < 2:231663/141‑1 (MQ=255) ttCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACgg < 1:117653/141‑1 (MQ=255) cacaTTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATCTCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGtt < 2:799254/141‑1 (MQ=255) cacaTTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGtt < 1:661073/141‑1 (MQ=255) cacaTTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGtt < 1:29355/141‑1 (MQ=255) tataATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGTTGatat < 1:705675/141‑1 (MQ=255) taataaGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGTTGATATct < 1:91639/141‑1 (MQ=255) aaataaGAGTAAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGTTGATATct < 1:404062/140‑1 (MQ=255) aataaGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGTTGATATcta > 2:788173/1‑141 (MQ=255) ataaGAGTGAAGATAAGAGTATTGTAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGTTGATATctaa > 2:372738/1‑141 (MQ=255) aaGAGTGAAGAGAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATAGATGTGAAGTAAAAAGTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGTTGATATctaact < 1:769558/141‑1 (MQ=255) agagGGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGTTGATATctaacta < 1:399471/141‑1 (MQ=255) | AAATAATGTCTTAGATTGATTGGGAGTTTTTTTAATTTTTTTGAAATTAAATTAATCTGTAGTTAATAAAAAATTTGAATAACTGACACATTTTTTTGATCATAGCTATATACTTTGTGAATTAATTCACATTATAATAAGAGTGAAGATAAGAGTATTATAAATTATCTTTAAATAAATATATGTGAAGTAAAAATTACACGTTAGCATATCGATTATGTCATTTCTTTTAACATATTAACTAGGGAAACGTTAAAAGTTAACGGTTGATATCTAACTA > CP000730/667596‑667875 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |