| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 835,012 | G→T | 6.9% | M229I (ATG→ATT) | prfB → | peptide chain release factor 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 835,012 | 0 | G | T | 6.9% | 261.5 / 5.6 | 89 | M229I (ATG→ATT) | prfB | peptide chain release factor 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (46/35); new base T (3/4); total (50/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.47e-01 | |||||||||||
GAATTACCCACCACCCCTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAGTGATGGATGGAGACAT > CP000730/834876‑835152 | gatctACCCACCACCCTCCAGGTATAGCTTTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGCTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAGATTGGAAGAGCAGGAACGTGAAATGGCTg < 2:199902/137‑1 (MQ=255)gAATTACCCACCACCCCTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTg < 1:780309/141‑1 (MQ=255) aTTACCCACCACCCCTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCCACTTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGGGAAATGGCTGaa > 1:24238/1‑141 (MQ=255) aTTACCCACCACCCCTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAGGAGCAGGCACGGGAAATGGCTGaa > 1:202537/1‑141 (MQ=255) aTTACCCACCACCCCTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGaa > 1:408428/1‑141 (MQ=255) aTTACCCACCACCCCTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATAGCTGaa > 2:770719/1‑141 (MQ=255) ccaccaCCCCTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCg > 2:302431/1‑141 (MQ=255) agcaccacACAGGTATAGATGTTAATAACCAAAATGAACGTTATCAAATTAAAAACCGACAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATGAAAATTGGAAAAGCAGGCACGTGAAATGGCAGaacagcgta > 2:95006/3‑134 (MQ=255) accaccCCTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTg > 2:18074/1‑141 (MQ=255) accaccCCTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTg > 2:183998/1‑141 (MQ=255) accCCTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCg < 1:267929/141‑1 (MQ=255) accCCGCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCg < 2:757803/141‑1 (MQ=255) cccTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGaa > 1:572717/1‑141 (MQ=255) tCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACaa < 2:642500/141‑1 (MQ=255) tCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACaa < 2:426539/141‑1 (MQ=255) tCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACaa < 1:647330/141‑1 (MQ=255) tCAAGTATAGTTGTAAATAACCAAAATGAACAAACAAAAAAAAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACaa < 2:719132/141‑1 (MQ=255) aGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCGGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCTCGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACaaaa > 1:539946/1‑141 (MQ=255) aGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACaaaa > 1:42299/1‑141 (MQ=255) aGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACaaaa > 2:252877/1‑141 (MQ=255) gTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAg < 2:751860/141‑1 (MQ=255) gTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAg < 1:86952/141‑1 (MQ=255) taGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAACACCGTGCCG‑AGCGCAAGAATAAGCTAAAGGCAATAGCATATCAATTACAAATAAGAGCCAATTCACGTGGGGTGGCTGAAATTCGGGGCGAACAAAAGGaaa > 1:796558/1‑141 (MQ=255) taGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGaaa > 1:681020/1‑141 (MQ=255) taGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGaaa > 1:141996/1‑141 (MQ=255) taGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAAAAAAAAGaaa > 2:518241/1‑141 (MQ=255) ttAATACCCAAAAGGAATGTCCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGCAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTTGCGAACTAAAAGAAATCGGCt < 2:554822/141‑1 (MQ=255) ttAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGcg > 2:718654/1‑140 (MQ=255) aaCCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TAGGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGATCAAAAAGACATCGGCTGGGGa < 1:421363/141‑1 (MQ=255) aCCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATTGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGaa > 2:313985/1‑141 (MQ=255) aCCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATTGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGaa > 2:314059/1‑141 (MQ=255) aCCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGAGAAATTGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGaa > 2:495823/1‑141 (MQ=255) cAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGc > 1:45571/1‑141 (MQ=255) cAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGc > 1:233795/1‑141 (MQ=255) aaaTGCACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAATCAGC‑TATGAAAAAGTGAAAGACAAAATAATAACAATTAAAATTAGAAGATCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAAGAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCa > 2:385683/1‑141 (MQ=255) aaTGAACGTTCTCAGATTATAAACCATGAAGCAGC‑TATGAAAATATTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAACTTCGTGGCGAACAAAAAGAAACCGGCGGGGGAAGCCaa > 1:443634/1‑141 (MQ=255) aaTGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCaa > 1:474184/1‑141 (MQ=255) aaTGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCaa > 2:707835/1‑141 (MQ=255) aaTGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCaa < 1:391102/141‑1 (MQ=255) aaTGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAACCaa > 1:235422/1‑141 (MQ=255) aaCGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAGAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTa > 1:443814/1‑141 (MQ=255) tctcAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCa < 1:422997/141‑1 (MQ=255) cAAATTAAAAACCGTGCAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTTAAACGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCatat < 1:463800/141‑1 (MQ=255) cAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCTTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCatat < 2:302415/141‑1 (MQ=255) cAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAgctttcgg < 2:612394/141‑8 (MQ=255) cAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCatat < 1:661896/141‑1 (MQ=255) cAAAGTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCatat < 2:275313/141‑1 (MQ=255) aaTTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGt < 1:648370/141‑1 (MQ=255) aaTTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGt < 1:408744/141‑1 (MQ=255) tAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAACGAAATCGGCTAGGGAAGCAAAATTAGAACATATGtttt > 2:155373/1‑141 (MQ=255) tAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGtttt > 1:530080/1‑141 (MQ=255) aaaCCGTGAAACAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTtcca < 2:801783/141‑1 (MQ=255) aaCCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAGTTGGATCATATGttttgcca > 2:201154/1‑137 (MQ=255) aaCCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTtccat > 2:651348/1‑141 (MQ=255) tGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGTCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATa < 1:32450/141‑1 (MQ=255) tGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATa < 1:47448/141‑1 (MQ=255) aaGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACt > 1:703402/1‑141 (MQ=255) aaGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGACACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTACATCCATACt > 2:75234/1‑141 (MQ=255) gcagc‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCa > 2:721213/1‑141 (MQ=255) gcagc‑TAAGAAAAGGATAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCa < 2:312036/141‑1 (MQ=255) tATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGt < 1:720011/141‑1 (MQ=255) tATGAAAATGTTAAAGGCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGt < 2:722642/141‑1 (MQ=255) aTGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGat > 2:664796/1‑141 (MQ=255) aGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTa > 1:210726/1‑141 (MQ=255) tAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTacgaa < 1:609146/141‑1 (MQ=255) aaTTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATTGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGTCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTacgaacg < 1:495823/141‑1 (MQ=255) aaTTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATTGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTacgaacg < 1:314059/141‑1 (MQ=255) aaTTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATTGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTacgaacg < 1:313985/141‑1 (MQ=255) atatCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACgaaga > 1:282590/1‑141 (MQ=255) atatCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACgaaga > 1:727493/1‑141 (MQ=255) tatCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACgaagaa > 1:613674/1‑141 (MQ=255) tatCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACgaagaa > 1:613675/1‑141 (MQ=255) tCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAAc > 1:354350/1‑141 (MQ=255) acAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAAc < 1:377656/140‑1 (MQ=255) aaaaTTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAACGCAACAACGGCTGGGGACCCTTAATTATATCATATGTTTTCCATCCGTACTCAAGGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTaa > 1:796315/1‑141 (MQ=255) aaaaTTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAGTGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACGGGTaa > 1:108301/1‑141 (MQ=255) aaaaTTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTaa > 1:8153/1‑141 (MQ=255) aTTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGt < 1:721213/141‑1 (MQ=255) attgAAGAGCAGGCACGTGAAATTGCTGAAATGCGTGGCGAACAAAAAGAGATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATCTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGtt < 2:529030/138‑1 (MQ=255) agCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAg > 1:653164/1‑141 (MQ=255) agCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAg > 1:124366/1‑141 (MQ=255) cAGGCACGTGAAATGGCTTAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCCGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGGGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAGTg < 1:216058/141‑1 (MQ=255) cAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAGTg > 1:302597/1‑141 (MQ=255) gCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGGTGCAGTgatg > 1:89588/1‑141 (MQ=255) gCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGGGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAGTgatg > 1:208826/1‑141 (MQ=255) gTGAAATGGTTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAGTgatggatg < 1:95006/141‑1 (MQ=255) gTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGCACCAAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAGTgatggatg < 1:183998/141‑1 (MQ=255) gTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAGTgatggatg < 1:18074/141‑1 (MQ=255) ggAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAGTGatggatgg < 2:58345/140‑1 (MQ=255) ggCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACCCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAGTGATGGATGGAGACAt < 2:572717/141‑1 (MQ=255) | GAATTACCCACCACCCCTCAGGTATAGTTGTTAATAACCAAAATGAACGTTCTCAAATTAAAAACCGTGAAGCAGC‑TATGAAAATGTTAAAGTCTAAATTATATCAATTAAAATTGGAAGAGCAGGCACGTGAAATGGCTGAAATTCGTGGCGAACAAAAAGAAATCGGCTGGGGAAGCCAAATTAGATCATATGTTTTCCATCCATACTCAATGGTGAAAGATCATCGTACGAACGAAGAAACAGGTAAGGTTGATGCAGTGATGGATGGAGACAT > CP000730/834876‑835152 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |