| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,352,815 | G→A | 100% | A92V (GCA→GTA) | rpsI ← | ribosomal protein S9 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,352,815 | 0 | G | A | 100.0% | 219.4 / ‑6.5 | 73 | A92V (GCA→GTA) | rpsI | ribosomal protein S9 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base A (39/31); minor base C (2/0); total (42/31) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TATCGTCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTGCTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATGGTTGGTTTAAGTCTAAAATTAA > CP000730/2352678‑2352954 | tatCGTCCGACAATTAACGTTTTGAGAAATGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACtt < 1:562221/141‑1 (MQ=255)taccGTCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGATGCATTACGTCCTGGTTTATTCCCTTCTTTCTTACGTAGTTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACtt < 1:634706/138‑1 (MQ=25) tCCTACAATTATCGTTTTGAGAATTGAGGTGATCGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaat < 1:542913/141‑1 (MQ=255) tCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaat < 2:178866/141‑1 (MQ=255) ctaCAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaataa < 2:758217/139‑1 (MQ=255) cGACAATTAACGTTTTGAGAATTGATGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaataa < 2:37301/141‑1 (MQ=255) cGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaataa < 1:177899/141‑1 (MQ=255) cGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaataa < 2:516363/141‑1 (MQ=255) cAATTAACGTTTTGTGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTGTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGc > 1:434709/1‑141 (MQ=255) cAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATCCGTCGGCGTCGGGGGAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTATTAATGc > 1:187702/1‑141 (MQ=25) cAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTCCTTCTAATAATGc > 1:205189/1‑141 (MQ=255) cAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGc > 1:461325/1‑141 (MQ=255) ttAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACg < 1:347559/141‑1 (MQ=255) tttGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGAtt < 2:657510/141‑1 (MQ=255) tGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGCTCTACTTCTGATAATGCACGGGCGATTcc > 1:275468/1‑141 (MQ=255) aaTTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCGCGAGTAAGTAATCCAGCGCGTCTTACAGAACCTCTGTCTTCGGGGTCTCATTGTAATAATGCACCACGGATTCCGTgt > 2:710916/1‑140 (MQ=255) ttGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTTACg > 2:543285/1‑141 (MQ=255) ttGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACg > 2:617937/1‑141 (MQ=255) tGAGGTGAACGACCAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTAACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCGCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACgg < 1:258090/141‑1 (MQ=255) gAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCAAGAGTAAGTAATACAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGa > 2:690672/1‑141 (MQ=255) ggTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATCCGTGGGTCACGAGTAAGTAGTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTTAGCATCTACTTCTAATAATGCACGACCGATTCGGTGACGGGTa > 2:58447/1‑141 (MQ=255) ggTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGCCGGATa > 1:189490/1‑141 (MQ=255) ggTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGAtg > 1:566414/1‑140 (MQ=255) aaCGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagctt < 2:405330/141‑1 (MQ=255) aaCGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagctt < 2:526391/141‑1 (MQ=255) cgacgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttga < 1:470666/141‑1 (MQ=255) cgacgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttga < 2:609992/141‑1 (MQ=255) cgacgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttga < 2:686086/141‑1 (MQ=255) cgaccaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttga < 2:105960/141‑1 (MQ=255) acgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttgagc < 2:531766/141‑1 (MQ=255) acgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttgagc < 2:162958/141‑1 (MQ=255) tAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGa < 2:218357/141‑1 (MQ=255) aGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGaaa > 1:774781/1‑141 (MQ=255) gTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAtccaccac < 1:507576/141‑1 (MQ=255) tACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCGGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTACTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGaa > 2:603137/1‑141 (MQ=255) gTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGt < 1:223281/141‑1 (MQ=255) gTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTACAGTGAAACCACCACCATGAACGt > 1:304164/1‑141 (MQ=255) gTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCGTGTCCAGTGAAACCACCACGATGACCGt > 1:655938/1‑141 (MQ=255) ttttCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTaa < 1:6650/140‑1 (MQ=255) ttCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACACCCATGAACGTTAACt > 2:41011/1‑141 (MQ=255) cATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGTGCTTGTCCATTGAAACCACCACCATAAACGTTAACT‑aa > 2:13484/1‑141 (MQ=255) cATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCCCCATGAACGTTAACT‑aa > 1:439377/1‑141 (MQ=255) cATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑aa > 2:519089/1‑141 (MQ=255) gTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAGTGGCCGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTTCCGTGAAACCACCGCCATGAGCGttgttgtaaagat > 2:203999/1‑130 (MQ=255) gTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAAGATTAACT‑AAAAcat > 2:582568/1‑141 (MQ=255) gggTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAAcatca < 2:793530/141‑1 (MQ=255) gggTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAAcatca < 2:499787/141‑1 (MQ=255) tCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAg > 1:504511/1‑141 (MQ=255) cACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCGGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGt > 2:161545/1‑141 (MQ=255) cACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGt < 1:454225/141‑1 (MQ=255) cACGAGTAAGTAACACAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGt < 1:303776/141‑1 (MQ=255) aCGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGtt > 2:113406/1‑141 (MQ=255) gAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTAc < 1:671069/141‑1 (MQ=255) agtaaTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAACCATCATAGTTACCTTTa > 2:318177/1‑141 (MQ=255) agtaaTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTa > 1:240186/1‑141 (MQ=255) taaTCCAGCGCGTTTTAAAAAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTGCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTCAAACAACCACGCTGAACGCTAACT‑AAAACATCATAggttactttggt > 2:667582/1‑130 (MQ=255) aTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGACACCACCACCCTGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGttt > 1:3861/1‑141 (MQ=255) aTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGttt > 2:588407/1‑141 (MQ=255) aTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGttt > 1:617630/1‑141 (MQ=255) gcgcGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGCGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAACCCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACCTCATAGTTACCTTTAGGTTCAGtt > 1:287126/1‑141 (MQ=255) gTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGCGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACa < 2:402340/141‑1 (MQ=255) gTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGCCGGATAGCTTGAGCTTGTCCAATGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAACAAGCATGATTACCTTTAGtttagattcatt > 1:253/1‑132 (MQ=255) gTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACa < 2:609979/141‑1 (MQ=255) ttttAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCAACATGAACGTTAAGT‑AAAAAATAATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACAta > 1:636305/1‑140 (MQ=255) tAAACAACCTCTCTATTCAGGATCTACTTCTAATAACGCACAAGCGATTCCGTGATGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACAGCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCaaa < 1:71276/141‑1 (MQ=255) ccTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAAtggttgg > 2:410569/1‑141 (MQ=255) tctGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATggcaggtt > 2:354524/1‑141 (MQ=255) tctGTAATCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTCGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGATAACT‑AAAACATCATAGTTTCCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATggttggtt > 2:509890/1‑141 (MQ=255) ctGTTTTCAGGATCTACTTTTAATAATGCAAGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAAAT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAACTggttggttg > 2:492600/1‑140 (MQ=255) ctGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATGGTTGGttt > 1:794223/1‑141 (MQ=255) tGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGATACCCTTAGCTTCAGTTACATCAAACGGTTGGTTTa > 2:189935/1‑141 (MQ=255) aTCTACTTCTAATAATGCACGAGCGCTTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTCGTTTCAGTTACATCAAATGGTTGGTTTAAGTCTAAAAt > 1:444743/1‑141 (MQ=255) tGCTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGAGTGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACACCAAATGGTTGGTTTAAGTCTAAAATTaa > 2:307705/1‑141 (MQ=255) | TATCGTCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTGCTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATGGTTGGTTTAAGTCTAAAATTAA > CP000730/2352678‑2352954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |