| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 310,609 | A→G | 4.8% | intergenic (‑54/‑95) | USA300HOU_0275 ← / → USA300HOU_0276 | GntR family transcriptional regulator/PTS family glucose/glucoside (glc) porter component IIABC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 310,609 | 0 | A | G | 4.8% | 243.0 / 2.9 | 85 | intergenic (‑54/‑95) | USA300HOU_0275/USA300HOU_0276 | GntR family transcriptional regulator/PTS family glucose/glucoside (glc) porter component IIABC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/38); new base G (2/2); total (43/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.11e-01 | |||||||||||
ACGCTTGGCAATTTATCACCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAGCCCAAGACATTCTTACAG > CP000730/310470‑310746 | aCGCTTGGCAATTTATCACCGGGTTTGAAATTAGATTTATGGATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCGCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAAt < 2:254149/141‑1 (MQ=255) cGCTTGGCAATTTATCACCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAAtt > 1:461683/1‑141 (MQ=255) ttGGCAATTTATCACCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTa > 1:353216/1‑141 (MQ=255) ggCAATTTATCACCGGGTTTAAAATTAGATTGATGTATAAACGCTTTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCAGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAGTTGTATc > 2:416087/1‑141 (MQ=255) ggCAATTTATCACCGGGAATGAAATTAACGAGAAGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAGTTGTATc > 2:275746/1‑141 (MQ=255) cAATTTATCACCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCgg < 1:653844/141‑1 (MQ=255) aaTTTATCACCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGc < 2:763962/141‑1 (MQ=255) ttATCACCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGtt < 1:75392/141‑1 (MQ=255) tATCACCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATCCTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAGTTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCTGCGgtt > 2:636262/1‑141 (MQ=255) tATCACCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGttt > 1:297237/1‑141 (MQ=255) aTCACCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTa < 1:418196/141‑1 (MQ=255) aCCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAGACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCGCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACaa > 1:489066/1‑141 (MQ=255) aCCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACaa < 1:614029/141‑1 (MQ=255) cGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAAt > 2:283886/1‑141 (MQ=255) gttttGAAATTAGTTTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTg < 1:184335/139‑1 (MQ=255) tGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATCGCACAAAATATTATAATTTTATCGGCGTTTATAAATTGTAcc > 2:79136/1‑141 (MQ=255) gAAATTAGATTGCTGTGTAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATCGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTGAccaggtgaagag > 2:399093/1‑130 (MQ=255) aaTTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGt > 2:685861/1‑141 (MQ=255) ttAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTCTAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTAc > 2:479455/1‑141 (MQ=255) aGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACaa < 1:435753/141‑1 (MQ=255) aTTGATTTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTGACAACTTGAACCGGTACAAtt < 1:388254/141‑1 (MQ=255) ttGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATta < 2:734114/141‑1 (MQ=255) tGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACGATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACCATtat > 2:486616/1‑141 (MQ=255) tGATGTACAAGCGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACATATTGAACCGGTACAATtat < 1:403479/141‑1 (MQ=255) cGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGgta > 1:241869/1‑141 (MQ=255) ttATGTTGCTTAGCAATATTTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGgtaagta < 2:84651/141‑1 (MQ=255) ttAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACCATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGgtaagta < 1:275245/141‑1 (MQ=255) ttAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGgtaagta < 1:643399/141‑1 (MQ=255) ttAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGgtaagta > 1:473496/1‑141 (MQ=255) tAAGTTTCTTACCAATATGTTCATACTTTAACCATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATATCACAAAATACTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGgtaagtaa < 1:362384/141‑1 (MQ=255) aaGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTaaa > 2:164913/1‑141 (MQ=255) aGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGCGGTAAGTtaaa > 2:23498/1‑140 (MQ=255) aGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAAt < 2:168477/141‑1 (MQ=255) tGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACa < 1:346324/141‑1 (MQ=255) cTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATGCAtt > 1:200836/1‑141 (MQ=255) cTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACAtt > 2:585017/1‑141 (MQ=255) cTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGACTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACAtt > 2:560756/1‑141 (MQ=255) ttAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAGTTGTATCGGCGTTTACTAATTGAACCGGTACAATTCTAATTCGAGGTAAGTAAATACAttt < 1:416087/141‑1 (MQ=255) ttAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAGTTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACAttt < 1:275746/141‑1 (MQ=255) cAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCAt > 1:288053/1‑141 (MQ=255) atatGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCAtta > 1:539566/1‑140 (MQ=255) atatGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTc > 1:129227/1‑141 (MQ=255) atatGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAACTGGAAATGAATAAATACATTTTCATTc < 2:736765/141‑1 (MQ=255) atatGTTCATACTTGAACAATATTCAGTCCTCGTTTCACTTTGTATGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTc > 1:414584/1‑141 (MQ=255) tatGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTct < 2:317019/141‑1 (MQ=255) tGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTctac > 1:441165/1‑141 (MQ=255) cATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATc > 1:202886/1‑141 (MQ=255) cATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGATACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATc > 1:160032/1‑141 (MQ=255) cATACTTTAACAATATGCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATc > 1:449561/1‑141 (MQ=255) tACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCaa < 1:75159/141‑1 (MQ=255) aCTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAg < 1:582000/141‑1 (MQ=255) cTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATCCTTGTATCGGCGTTTACAAATAGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGt < 2:190401/141‑1 (MQ=255) tAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTATGAAGTGAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGa > 1:58218/1‑141 (MQ=255) tAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATAAAGTTGa > 2:744394/1‑141 (MQ=255) aaTATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTTATTATTATAGCACATAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTCGGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAgggg < 2:379220/141‑1 (MQ=255) ttCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTaa < 1:71404/141‑1 (MQ=255) ttCTGGCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATGATACTGGTATCTGCGTTTACACATTGAGCCGTTACAATTATAATTGGAGGTAATTAAATACATTTTCATTCTGCTATCAAGTTGAGGGGGTaa < 2:568846/141‑1 (MQ=255) gTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGCAATAtt > 2:143529/1‑141 (MQ=255) tCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATAttt > 1:38960/1‑141 (MQ=255) tCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATAttt > 1:593681/1‑141 (MQ=255) cTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTAt < 1:211054/141‑1 (MQ=255) gTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACACTTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAg > 2:486630/1‑141 (MQ=255) gTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGGGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGAAATCTTTATGAg > 2:397570/1‑141 (MQ=255) tgaccttGTCTGTAAGTAATAGAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCaa < 1:531978/136‑1 (MQ=255) tCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCaa < 2:102736/141‑1 (MQ=255) tCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCaa < 2:244001/141‑1 (MQ=255) tCACTTTGTCTGGAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCaa < 2:222981/141‑1 (MQ=255) cACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCaat < 1:496856/141‑1 (MQ=255) aCTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCaata < 2:353216/141‑1 (MQ=255) aCTTTGTCTGTAATTATTACAGCACAAAATATTGAAATCGTATCGGCGGTTACGATTTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATCTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGCGGTAATATTTATGAGCaata < 2:415246/141‑1 (MQ=255) gTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAatat > 1:310035/1‑141 (MQ=255) cTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAAGTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATaa < 1:670069/141‑1 (MQ=255) attattATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTCCTATCCAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAAc < 2:125319/141‑1 (MQ=255) attattATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAAc < 1:237867/141‑1 (MQ=255) attatAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAg > 1:73255/1‑141 (MQ=255) ttatAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAGc < 1:415059/141‑1 (MQ=255) tataGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAGcc > 1:62274/1‑141 (MQ=255) tataGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAGcc > 1:645288/1‑141 (MQ=255) tataGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTAAAATTGGAGGTAAGTAAATACATTGTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATCTATGAGCAATAAATATAAAGAGCAAGcc > 2:49681/1‑141 (MQ=255) ataGCACAAAAGATTATAATTGTATCGGCTTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAGccc < 2:133491/141‑1 (MQ=255) aaGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAGCCCa < 2:574370/140‑1 (MQ=255) cacaAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAAAACAAGCCCAAGa > 1:37991/1‑141 (MQ=255) acaAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAGCCCAAGaa > 1:340889/1‑140 (MQ=255) attatAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAGCCCAAGACATTCTTa > 2:145722/1‑141 (MQ=255) taaaaTTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACACTTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCGACTATCAAGCTGCAGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAGCCCAAGACATTCTTACa < 1:751684/138‑1 (MQ=255) ataATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAGCCCAAGACATTCTTACAg < 1:23498/141‑1 (MQ=255) | ACGCTTGGCAATTTATCACCGGGTTTGAAATTAGATTGATGTATAAACGCATTAAGTTGCTTAGCAATATGTTCATACTTTAACAATATTCTGTCCTCGTTTCACTTTGTCTGTAATTATTATAGCACAAAATATTATAATTGTATCGGCGTTTACAAATTGAACCGGTACAATTATAATTGGAGGTAAGTAAATACATTTTCATTCTACTATCAAGTTGAGGGGGTAATATTTATGAGCAATAAATATAAAGAACAAGCCCAAGACATTCTTACAG > CP000730/310470‑310746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |