| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 707,910 | A→G | 100% | intergenic (‑1/‑121) | USA300HOU_0653 ← / → USA300HOU_0654 | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein/possible metal‑dependent transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 707,910 | 0 | A | G | 99.4% | 236.8 / ‑6.6 | 72 | intergenic (‑1/‑121) | USA300HOU_0653/USA300HOU_0654 | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein/possible metal‑dependent transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (30/39); minor base C (2/0); total (32/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
GGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAAGAAA > CP000730/707780‑708046 | gggAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATAcc > 2:292915/1‑141 (MQ=255) gAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTACC‑AAGCGTTTATAcctc > 1:260514/1‑141 (MQ=255) gAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATAcctc < 2:478293/141‑1 (MQ=255) tACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTa > 2:278986/1‑141 (MQ=255) aCCAGCACCCTTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTACCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTaa < 2:496278/141‑1 (MQ=255) aCCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGACATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAG‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTaa < 2:543745/141‑1 (MQ=255) aCCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTaa < 1:627168/141‑1 (MQ=255) aCCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTGCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTaa > 1:431999/1‑141 (MQ=255) aCCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGAACTGGTATCGAGAAGGAAAGGTTTTTCAGTACATGCTTATTCACTAAAAAGAGATATAAATCTTTTGTTACTACC‑AAGCGTTTATACCTCATAATTaa > 2:750337/1‑141 (MQ=255) ccAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTGTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AACCGCTTATAGCTCCTCATTaaa > 2:117381/1‑141 (MQ=255) cACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTGCGGGTATAGATAAGGAAATGCTTTTAAGTAGATGCTTATAACATAAAAACAGAGTTAAATCTTTTTTTTCTAAC‑AAGCGTTTGTACCACCTATGTAATAGtt > 2:572568/1‑141 (MQ=255) cACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGtt < 1:678912/141‑1 (MQ=255) aCCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGttt < 1:197539/141‑1 (MQ=255) cATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAg > 2:36440/1‑141 (MQ=255) ttCGGGTCCATGATACCAATTATTTCGGCGCGTACTGGCCTCGATAAGGAGATGTGTTTAACAACATTTTTAGTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAAGTAAAAGTTTAGGc < 2:270486/141‑1 (MQ=255) gggCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTaa > 2:2427/1‑141 (MQ=255) gggCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTaa > 1:30567/1‑141 (MQ=255) gaccATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGAAAATAAAATAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAAcc < 2:392375/139‑1 (MQ=255) gCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTGTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAAcc < 1:592510/141‑1 (MQ=255) ccATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCta < 2:171336/141‑1 (MQ=255) ccATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATATTCCGATCTGTGC‑AGGCGTTTCTACCTCCCAATTAAAAGTTTCGGCTAACCta > 1:357240/1‑141 (MQ=255) cctGATATCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaa < 1:706575/139‑1 (MQ=255) cATGATACCACTTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAATGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATGACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaa < 2:164076/141‑1 (MQ=255) cATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATTGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaa < 1:186939/141‑1 (MQ=255) cATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaa < 1:239258/141‑1 (MQ=255) cATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTGTATACCTCCTAATTAAAAGGTTAGGCGAACCtaa > 1:312724/1‑141 (MQ=255) aCCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCCaattaatt > 1:342930/1‑141 (MQ=255) ccAATTATTTCGCGGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTg < 2:61059/141‑1 (MQ=255) ccAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTG‑TACTGACTGTCCGTTTTTTTCTACTACTTAGAACATTAGGCTAACCTAATTAATTg > 1:549193/1‑141 (MQ=255) tttCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTataata < 1:535647/141‑1 (MQ=255) tCGCCGCGTACTGGTATCGAGAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAGC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCCAACCTAATTAATTGTATAATaaa > 1:479262/1‑141 (MQ=255) gcgTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTATAAACAGATTTAAGTCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAGTTAATTCTATAATAAACTgag < 2:520951/141‑1 (MQ=255) aagTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAGAAACAGATTTAAGTCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAGTTAATTATATAATAAACTgag < 2:521133/139‑1 (MQ=255) ggTACTGCTATCGATCAGGAATTGTTTTTATGTACATGCTTATTACCTAAGGACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATAACTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATCATAAACTgaga < 2:627563/140‑1 (MQ=255) ttatATCGATTAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AATCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAAGAAACTGAGAATAtt < 2:251106/138‑1 (MQ=255) gTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTa < 2:50190/141‑1 (MQ=255) aaaTGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTa < 2:121863/141‑1 (MQ=255) aaTGTTTTTAATTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTTCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTaa < 2:645682/141‑1 (MQ=255) aTGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTaaa > 2:642752/1‑141 (MQ=255) tGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAAt > 1:639141/1‑141 (MQ=255) agTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTCAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAAt < 1:634348/140‑1 (MQ=255) ttAAGTACTTGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTg > 2:464676/1‑141 (MQ=255) aactACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGat < 2:564834/138‑1 (MQ=255) gTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatat < 1:495667/141‑1 (MQ=255) gTACATGCTCTATACCTAAAAACAGATTTACATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatat < 2:481710/141‑1 (MQ=255) tACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTACACACCCTAATTAAAAGTTTATGCCAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAATTAAATTCTTGatata > 2:360236/1‑141 (MQ=255) aTGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatataaaa > 2:583786/1‑139 (MQ=255) ttaCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACaa > 1:498862/1‑141 (MQ=255) ttaCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACaa < 1:330034/141‑1 (MQ=255) ttaCCAAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACaa < 2:480442/141‑1 (MQ=255) taCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATTTTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGaaaaa > 2:386204/1‑140 (MQ=255) aCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAatg < 1:215382/141‑1 (MQ=255) aCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTACACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAatg < 1:215383/141‑1 (MQ=255) cTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAGGTATATTCGTGATATAATAT‑AGACAatgta < 2:698767/141‑1 (MQ=255) aaaaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAatgtatgt < 2:641935/141‑1 (MQ=255) aaaaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTAGACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATCTAATAT‑AGACAatgtatgt < 1:494209/141‑1 (MQ=255) gATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTg > 1:643449/1‑141 (MQ=255) gATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTg < 1:278986/141‑1 (MQ=255) gATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTAAGGTg > 2:434530/1‑141 (MQ=255) gATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATAAAAAGTTTAGGCCAACCTAATTAATTGTATAATAAAATGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGGGAGGTg > 2:194285/1‑141 (MQ=255) aTTTAAATGTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATTGCTCCGATGTTAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGGTATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGa < 2:342930/141‑1 (MQ=255) tttAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGCATATTTATCTTGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑ACACAATGTATGGGAGGTGaa > 1:163086/1‑141 (MQ=255) ttAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTGATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCGTGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATGAGA‑AATGTGAGTGAGGCGaaa > 1:238701/1‑141 (MQ=255) ttAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGaaa > 1:418216/1‑141 (MQ=255) tCTTTTGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATg < 1:652509/141‑1 (MQ=255) tttGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTa < 1:692469/141‑1 (MQ=255) tttGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTa < 2:431999/141‑1 (MQ=255) ttGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAGTTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTCTGTTaa > 1:663553/1‑141 (MQ=255) ttGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTaa > 1:299895/1‑141 (MQ=255) tGTTTCTAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAAc < 1:151952/141‑1 (MQ=255) tAAC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATCAATTCCATCCTAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGAAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTgaaga > 2:308004/1‑141 (MQ=255) aC‑AAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAAGaaa > 1:229748/1‑141 (MQ=255) | GGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAC‑AAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAT‑AGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAAGAAA > CP000730/707780‑708046 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |