| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 744,511 | G→C | 5.1% | intergenic (+2348/‑578) | USA300HOU_0687 → / → sarX | hypothetical membrane protein/possible staphylococcal accessory protein X |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 744,511 | 0 | G | C | 5.1% | 252.9 / 3.4 | 82 | intergenic (+2348/‑578) | USA300HOU_0687/sarX | hypothetical membrane protein/possible staphylococcal accessory protein X |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/32); new base C (2/2); total (45/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.17e-01 | |||||||||||
ATATTGAACAAGAAAAGCTGATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCAAAATACGAAAAC > CP000730/744373‑744641 | atatTGAACAAGAAAAGCTGATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGAt > 2:290421/1‑141 (MQ=255) tatTGAACAAGAAAAGCTGATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGAtt < 2:615935/141‑1 (MQ=255) tatTGAACAAGAAAAGCTGATTTTACTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGAtt > 1:484121/1‑141 (MQ=255) atTGAACAAGAAAAGCTGATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTa < 1:665038/141‑1 (MQ=255) tGAACAAGAAAAGCTGATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTaaa < 1:96885/141‑1 (MQ=255) aaaaGCTGATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACAtttttt > 2:196923/1‑140 (MQ=255) aaGCTGATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATGACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGAc > 1:368578/1‑141 (MQ=255) aaGCTGATTTGTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGAc < 2:578532/141‑1 (MQ=255) cTGATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAat < 1:677201/141‑1 (MQ=255) gATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTGAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAatca < 1:53078/141‑1 (MQ=255) gATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAatca > 1:764744/1‑141 (MQ=255) gATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAatca < 2:493727/141‑1 (MQ=255) ttCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGGTCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAg > 2:356456/1‑141 (MQ=255) cTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCa > 2:578402/1‑141 (MQ=255) cTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCa > 1:206942/1‑141 (MQ=255) tAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCAt > 2:397312/1‑141 (MQ=255) ttGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATg > 1:629212/1‑141 (MQ=255) tGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGc < 1:382749/141‑1 (MQ=255) tGAAAATCATAAACTGCGTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGc < 1:373553/141‑1 (MQ=255) aaaaTCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAGCATTTTTGACAATCATCAAGAATT‑TAATCCGa > 1:199933/1‑141 (MQ=255) aaaaTCATAAACAGCTTAATAATACAGACACATATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGa > 2:128394/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) cTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTatat < 1:476140/141‑1 (MQ=255) cTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTatat < 1:475909/141‑1 (MQ=255) ataataaAGAACGATATCTAAGTAATAGCGCTCCATTAATTTATAAGACAATAAGGGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACaaaa < 1:20974/141‑1 (MQ=255) ataataaAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACaaaa > 1:288703/1‑141 (MQ=255) ataaAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCCCCATTAATTTGTAAGAGATTAAGTGCGCTATATCACAACTTGGATGGCTATGGATTAAACCATTTTGGCAAACATCAAGCATT‑TACTGCAATGCCACTCAATGAAAAAAATg > 2:138564/1‑141 (MQ=255) aaaGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGa > 1:315083/1‑141 (MQ=255) aaCGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAAGCATCAAGCATT‑GCATGCGATGCCTCTATTTTACAAAAATGAATTTa < 2:737436/141‑1 (MQ=255) aCGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAACATAGATTTaa > 2:399706/1‑141 (MQ=255) cGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATTCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTaaa > 2:286215/1‑141 (MQ=255) gagaTCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTaaaa > 1:753961/1‑141 (MQ=255) gagaTCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTaaaa > 1:608243/1‑141 (MQ=255) tAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCCTT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAacac < 1:593519/141‑1 (MQ=255) aGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGCATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACACCACTa > 2:752329/1‑141 (MQ=255) aGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGCATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTa > 2:752257/1‑141 (MQ=255) gTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATTGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCAGCTATATGACAAAAATGGAGTTAAAACAACAATAGGTCttt > 1:75271/1‑140 (MQ=255) gTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTta < 1:469052/141‑1 (MQ=255) tGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTtat < 1:623857/141‑1 (MQ=255) ggCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTtat < 1:227838/140‑1 (MQ=255) cTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACAATTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCCATATGACAAAAAAGGATTTAAAACAACACTAGGACTTatat > 2:618234/1‑141 (MQ=255) ccATTAATTTATAAGACATTAAATGCGCTGTATAACAACTTTGATGGATTTGGATTACAAATATTTGACAACCCTTAACCATA‑TAATGCGAAGGATCGATAGCACAAAAAACGATGTAAAACAACCCGACGTCTTATATTa > 2:752486/1‑141 (MQ=255) tAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGaaa > 1:357913/1‑141 (MQ=255) tAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGaaa < 1:636963/141‑1 (MQ=255) aaTTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGaaaa > 2:699685/1‑141 (MQ=255) aTTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAg < 2:298856/141‑1 (MQ=255) aTTTATAAGACATTAAGCTCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAg < 1:291908/141‑1 (MQ=255) tttATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGt > 1:669318/1‑141 (MQ=255) ttATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGtt > 1:20638/1‑141 (MQ=255) tataAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGttt < 2:402208/141‑1 (MQ=255) aGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATTGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCg < 2:468730/141‑1 (MQ=255) aGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCg < 1:155994/141‑1 (MQ=255) gACATTACGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGCATTAACAATTCATGACAATCATCAAGCCAT‑TATATTGATGCATCTATTCAAGGATAATGGATGTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGa < 1:752329/141‑1 (MQ=255) gACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGCATCATACATTTGTGACAATCATCAAGCATTGTGCTG‑TATGCAAATTCATTGCAAAAATGTATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGa < 1:752257/141‑1 (MQ=255) ttAAGTCCTCTGTATCACAACTTTCATGCCTTTGAATTAAACATTTTTTACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCAATATAACAAAAATTGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAatat < 1:223531/141‑1 (MQ=255) tAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGAAAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATATATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAatatt > 2:233271/1‑140 (MQ=255) aaGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGt > 2:169840/1‑141 (MQ=255) aaGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGt > 1:295102/1‑141 (MQ=255) gTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGtct > 1:691180/1‑141 (MQ=255) gTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGtct > 2:221621/1‑141 (MQ=255) gTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGtcc > 1:9050/1‑140 (MQ=255) gTGCGCTGTATCACAACTTAGATGGCATCGGAATAAACATTTTTGACAATCAACAAGCATT‑TAAAACGATGCATCTATATGACAAAAATGGAATTAAAACAACACCAAGACTTATAATAGAACAGATTATCGAataagacc > 2:88196/1‑136 (MQ=255) gcgcTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCg > 2:605819/1‑141 (MQ=255) gcTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATATCTCGaa > 2:182218/1‑141 (MQ=255) aacatATCACAAGCTTGATGGCTTTAAAGGAAACACGTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGaa < 1:356456/137‑1 (MQ=255) gTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAAcc < 1:658089/141‑1 (MQ=255) gTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAAcc < 1:290421/141‑1 (MQ=255) tCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCaaa > 1:644791/1‑141 (MQ=255) ccacaGCTGTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCaaa > 2:196924/2‑141 (MQ=255) tacaACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑GAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGACAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCaaaa < 2:181216/140‑1 (MQ=255) cacaACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCaaaa > 1:334746/1‑141 (MQ=255) acaACTTTGATGGCTTTGAATTAAACATTATTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCAAAAt < 1:337008/141‑1 (MQ=255) caACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCAAAATa < 1:585852/141‑1 (MQ=255) aCTGTGATGGCTTTGGATTAAGCATTTTTGCCAATCATCAAGCATT‑GAATTCGATGCGTCTATATGACACAAATGGATGTAAAACAACACTAGGGCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCAAAAGAct < 2:199933/141‑2 (MQ=255) gATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTGGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCAAAATACGaaaaa > 2:23390/1‑140 (MQ=255) gATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCAAAATACGaaaaa > 2:409520/1‑140 (MQ=255) gATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCAAAATACGAAAAc > 1:433370/1‑141 (MQ=255) | ATATTGAACAAGAAAAGCTGATTTTTCTAAATGTTGAAAATCATAAACTGCTTAATAATAAAGAACGAGATCTAAGTAATAGTGCTCCATTAATTTATAAGACATTAAGTGCGCTGTATCACAACTTTGATGGCTTTGGATTAAACATTTTTGACAATCATCAAGCATT‑TAATGCGATGCATCTATATGACAAAAATGGATTTAAAACAACACTAGGTCTTATATTAGAAAAGTTTATCGAATATGTCTCGAAACCAAAATACGAAAAC > CP000730/744373‑744641 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |