| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,371,220 | C→T | 17.1% | intergenic (‑4337/+1221) | rpmC ← / ← USA300HOU_2234 | ribosomal protein L29/NCS2 family nucleobase:cation symporter‑2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,371,220 | 0 | C | T | 17.1% | 161.7 / 24.6 | 70 | intergenic (‑4337/+1221) | rpmC/USA300HOU_2234 | ribosomal protein L29/NCS2 family nucleobase:cation symporter‑2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/19); new base T (7/5); total (46/24) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.08e-01 | |||||||||||
CTTCTACTACTGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGGATGATTGTGTAA > CP000730/2371080‑2371360 | cTTCTACTACTGTTACAGGGATTAATTATCAGAGTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTacac > 1:366416/1‑141 (MQ=255) tCTACTACTGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCa < 2:127644/141‑1 (MQ=255) tactacTGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGa > 2:615008/1‑141 (MQ=255) tactGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATgg > 2:552407/1‑141 (MQ=255) tGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTaa > 1:349200/1‑141 (MQ=255) tGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTaa > 1:349131/1‑141 (MQ=255) gTTACAAGCATTAATTCCCCGTTTTCTCCTAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAg < 2:458882/141‑1 (MQ=255) ttACAGGGATTAATTCACCTTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGt < 2:361008/141‑1 (MQ=255) ggATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGc > 1:458808/1‑141 (MQ=255) aTTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGccc > 2:296140/1‑141 (MQ=255) ttAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGccct > 1:650018/1‑140 (MQ=255) ttAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCa > 2:528352/1‑141 (MQ=255) ttAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCa > 2:685640/1‑141 (MQ=255) ttAATTCACCGTTTTCTCAGCCTACTGTTGTTGGCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCa > 1:756046/1‑141 (MQ=255) tAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCAt > 1:624056/1‑141 (MQ=255) ttCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTaa > 2:241731/1‑141 (MQ=255) cACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACAAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAg > 2:383053/1‑141 (MQ=255) aCCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCAAAGATTCCTTTTTTCATCGAAAGTCCACCGCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGc < 1:143207/141‑1 (MQ=255) ttttttCCGAATACTTGTTTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGGTTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCa < 2:345881/141‑1 (MQ=255) ttCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCTATGTCTACACCAGATGGTAAGGTTAAGCCCATTAAAGCGTCAAc > 1:469915/1‑141 (MQ=255) tcCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCGTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGt < 2:96619/141‑1 (MQ=255) tcCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGCTGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGATAACTGt > 2:17002/1‑141 (MQ=255) ccGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTGGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGtt < 2:313149/141‑1 (MQ=255) aCTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGgt < 1:7637/141‑1 (MQ=255) ttCATCCCAATTTTTCCTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTggg < 1:743180/140‑1 (MQ=255) gtCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTggg < 1:743280/141‑1 (MQ=255) tCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGt < 1:91031/141‑1 (MQ=255) tCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTa > 1:119708/1‑141 (MQ=255) tCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTa > 1:665124/1‑141 (MQ=255) cccAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTAc < 2:107117/141‑1 (MQ=255) ttttttttttttCCTCTGGTCAGCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATTTCTACACCACATGGTAATTTTAAGCCCATTACAGCTTCAGCTGTTTTTGGGGTTGGGTTTACAATATCGttt > 2:342000/11‑141 (MQ=255) aTTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTtg < 1:7103/141‑1 (MQ=255) tttGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTgtgtgt > 1:576441/1‑141 (MQ=255) ttGGTCATCGAAAGTACACGTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTa > 1:567394/1‑141 (MQ=255) ggTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACg < 1:243424/141‑1 (MQ=255) aTCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACgttgt < 2:458808/141‑1 (MQ=255) tCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACgttgtt > 2:624615/1‑141 (MQ=255) tCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACCGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACgttgtt > 2:228789/1‑141 (MQ=255) cGAAAGTCCACCTCCTGAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTAGGTTGTTc > 1:450524/1‑141 (MQ=255) cGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTc < 2:639668/141‑1 (MQ=255) aaGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCTACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGaa > 1:51104/1‑141 (MQ=255) aGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTTAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGCGTGTACGTTGTTCGAAt < 2:616273/141‑1 (MQ=255) ccACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGt > 2:572725/1‑141 (MQ=255) ccACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGt > 2:413109/1‑141 (MQ=255) ctcctAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCAc < 2:469915/141‑1 (MQ=255) tAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGCATTTTTCACGTGa > 1:50658/1‑141 (MQ=255) aaTTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGGTCGAATTGTTCACGTGAATc > 1:89062/1‑141 (MQ=255) aTTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAGTTGTTCACGTGAATCt > 1:349900/1‑141 (MQ=255) ttGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCtt > 1:206836/1‑141 (MQ=255) ttGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCCACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCtt < 1:528352/141‑1 (MQ=255) tGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCttt > 2:98411/1‑141 (MQ=255) tGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATAttt > 1:249881/1‑141 (MQ=255) tCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGGCCATTAAAGCGTCAACTGTTGTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCtttct > 1:150395/1‑139 (MQ=255) tCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTtat < 1:296140/141‑1 (MQ=255) cTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTtata > 1:141646/1‑141 (MQ=255) cTATTATAATTTGATATCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTtata > 1:379267/1‑141 (MQ=255) attatAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACt > 2:722856/1‑141 (MQ=255) attatAATTTGATTTAAATGTGTAAACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACt > 2:163347/1‑141 (MQ=255) tataATTTGATTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTa < 1:12366/141‑1 (MQ=255) taATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGCATCTTTATACTTTTg > 2:127115/1‑141 (MQ=255) tcgATTTCGATCTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTATTGGAGTGGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacg > 2:317260/3‑141 (MQ=255) gATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggc > 2:446901/1‑141 (MQ=255) gATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATGAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggc > 1:342455/1‑141 (MQ=255) aTTTCGATGTCTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggca > 2:280437/1‑141 (MQ=255) ttCTATGTCTACCCCAGATGGTTAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAATTGCTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggcacg < 2:518419/141‑1 (MQ=255) ttCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggcacg > 2:639866/1‑141 (MQ=255) ttCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATgcacggcacg < 1:615008/141‑1 (MQ=255) gATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGgat > 1:531160/1‑141 (MQ=255) tGTCTACCTCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGgatga < 2:58202/141‑1 (MQ=255) cTACATCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGGATGATtg > 1:695025/1‑141 (MQ=255) tACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGGATGATtgt > 1:425781/1‑141 (MQ=255) ccAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTGCGTTGTGGGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGGATGATTGTGTaa > 1:61643/1‑141 (MQ=255) | CTTCTACTACTGTTACAGGGATTAATTCACCGTTTTCTCCGAATACTTGTGTCATCCCAATTTTTCTTCCTAAGATTCCTTTGGTCATCGAAAGTCCACCTCCTAAAATTGTCTATTATAATTTGATTTCGATGTCTACACCAGATGGTAAGTTTAAGCCCATTAAAGCGTCAACTGTTTTTGGTGTTGGGTTTACAATATCGATTAAACGTTTGTGTGTACGTTGTTCGAATTGTTCACGTGAATCTTTATACTTATGCACGGCACGGATGATTGTGTAA > CP000730/2371080‑2371360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |