| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,816,469 | G→C | 15.2% | Y620* (TAC→TAG) | USA300HOU_2654 ← | serine‑threonine rich protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,816,469 | 0 | G | C | 15.2% | 220.6 / 21.7 | 76 | Y620* (TAC→TAG) | USA300HOU_2654 | serine‑threonine rich protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/32); new base C (8/4); total (40/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGTTGGTGCTGTCGTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGTTTGATTGCCTACAGTTACAGTTGG > CP000730/2816331‑2816600 | tGTTGGTGCTGTCGTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGCTTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTa < 1:747421/141‑1 (MQ=255) gTTGGTGCTGTCGTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGGCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCCTaa > 1:400608/1‑141 (MQ=255) ttGGTGCTGTCGTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAAc < 2:523199/141‑1 (MQ=255) tGGTGCTGTCGTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACt > 2:714298/1‑141 (MQ=255) gTGCTGTCGTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTa < 1:248161/141‑1 (MQ=255) gTGCTGTCGTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCCTAACTTa < 2:676488/141‑1 (MQ=255) gCTGTCGTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCCTAACTTAAt > 2:617569/1‑141 (MQ=255) gCTGTCGTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGACAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCATTGCACTATCCTAACTTAAt > 1:103033/1‑141 (MQ=255) gTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCtt < 2:105498/141‑1 (MQ=255) gTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGGCGATTTGTTATTTGCTTGGTCCGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCtt < 1:268756/141‑1 (MQ=255) gTATCCACAACATTTATTGGAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCtt < 2:22936/141‑1 (MQ=255) ccaagtttgatttgaaaaGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAAt < 2:372959/127‑1 (MQ=255) acaacaTTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAAt < 2:373529/141‑1 (MQ=255) aacaTTGATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTTCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATcc < 1:107973/141‑1 (MQ=255) acaTGTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCt < 2:761716/141‑1 (MQ=255) aTTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGt > 2:239178/1‑141 (MQ=255) tATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGGACTATCCTCACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAAc > 1:624552/1‑141 (MQ=255) tATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAAc > 2:359454/1‑141 (MQ=255) gTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCCTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTa < 1:113369/141‑1 (MQ=255) aaaaGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTAtt > 2:468301/1‑141 (MQ=255) aaaaGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCCTAACTTAATCAGCTTGGTAATCCTGTAACTGTAtt > 1:378942/1‑141 (MQ=255) aaGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTg > 1:61108/1‑141 (MQ=255) aaGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTg < 1:482295/141‑1 (MQ=255) gtcgtcGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTcaca > 2:112775/1‑141 (MQ=255) gtcgtcGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTcaca > 1:257801/1‑141 (MQ=255) gtcgtcGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGGTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTcaca < 1:711272/141‑1 (MQ=255) ccgATTCGTCATTTGCTTGCTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGCAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTcc < 2:687565/140‑1 (MQ=255) tttGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCCTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGt > 2:592114/1‑141 (MQ=255) tGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATACGCTTGGTAATGCTGTAACTGTATTTTTTAAAGTCCCAGTaa > 1:252410/1‑140 (MQ=255) gTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAGTGATTGACTTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGCATTTGTCACAGTCCCAGTAcc > 2:536956/1‑141 (MQ=255) tATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCAt < 1:83644/141‑1 (MQ=255) tATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCAt > 1:416210/1‑141 (MQ=255) tATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGCATTTGTCACAGTCCCAGTACCAt > 1:479408/1‑141 (MQ=255) tATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTAGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTCATCCTGTAACTGTATTTGTCACTGTCCCAGTACCAt > 1:324734/1‑141 (MQ=255) tgtttttGGTCTGTAGACACAACTGTCGATGTTGATTGACCAATTTTTGTTCGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCGCTGCAGGTGTTTGTCACAGTCCCAGTACCATTa < 2:502549/136‑1 (MQ=255) ttGGGCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGt < 1:226573/141‑1 (MQ=255) tGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGtt < 1:522579/141‑1 (MQ=255) tGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGtt > 1:48454/1‑141 (MQ=255) tGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTATAACTGTATTTCTAACAATCCCAGttgctagattcctt > 2:490320/1‑128 (MQ=255) cAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTTTTTGTCGCAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAg > 1:212318/1‑141 (MQ=255) gTAGACCCAACTGCCACTGTTGATTTACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGCTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCACCGTACCATTATCCGTTGTAGTc < 2:292163/141‑1 (MQ=255) gTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTc < 1:761660/141‑1 (MQ=255) aGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCATTACCATTATCCGTTGTAGTcaa > 2:532115/1‑141 (MQ=255) aGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTcaa > 2:208455/1‑141 (MQ=255) aGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCCTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTcta > 2:743917/1‑139 (MQ=255) acacAACTTTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTcaata < 1:411556/141‑1 (MQ=255) aCTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTcaatacaata < 2:547542/141‑1 (MQ=255) gTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGa < 1:614114/141‑1 (MQ=255) gTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGa > 1:154620/1‑141 (MQ=255) tCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGAt > 1:242650/1‑141 (MQ=255) ttgattgaCCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCGTTg < 2:257801/141‑1 (MQ=255) tgattgaCCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGt > 1:572193/1‑141 (MQ=255) ttgaCCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGtttt < 1:259997/141‑1 (MQ=255) gaCCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTCACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTAc > 2:189997/1‑141 (MQ=255) tttttGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCCTTGTCCGTTGTAGTCAATACAATAGGACTGATTGTTTTACCCCCtt > 1:628528/1‑141 (MQ=255) ttttCTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTGACCCACttt > 2:527187/1‑140 (MQ=255) gttgGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATg < 2:244698/141‑1 (MQ=255) gttgGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATg > 1:73871/1‑141 (MQ=255) ttgGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCGCTTCTATgg > 2:367294/1‑141 (MQ=255) ttgGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATgg < 1:468301/141‑1 (MQ=255) ttgGTGTCCCAATGATTGAATGCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATgg < 2:678479/141‑1 (MQ=255) ggTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGtt > 1:592917/1‑141 (MQ=255) ggTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGtt > 1:563288/1‑141 (MQ=255) ggTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGtt > 1:131683/1‑141 (MQ=255) ggTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCCTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGtt < 2:400608/141‑1 (MQ=255) gtgtCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGtttt > 1:51469/1‑141 (MQ=255) ccAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTCTGGTTTGATTg > 1:326/1‑141 (MQ=255) aTGAGTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGTTTGATTGCCt < 2:561290/141‑1 (MQ=255) ttGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGTTTGATTGCCtacag < 2:61108/141‑1 (MQ=255) ttGAATTCGTTGCACTATCCTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTGCCATTATCCTTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATAGTTTTACCCACTTCTATGGGTTGATTGCCtacag > 1:91495/1‑141 (MQ=255) aaTTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGTTTGATTGCCtacagtta > 1:203985/1‑141 (MQ=255) aTTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGTTTGATTGCCtacagttac < 1:383781/141‑1 (MQ=255) ttCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGTTTGATTGCCtacagttaca < 1:239178/141‑1 (MQ=255) ttCGTTGCACTATCCTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACCATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGTTTGATTGCCtacagttaca < 2:103033/141‑1 (MQ=255) cGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGTTTGATTGCCtacagttacagt > 2:697819/1‑141 (MQ=255) tGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGTTTGATTGCCTACAGTTACAGTTgg < 1:463886/141‑1 (MQ=255) | TGTTGGTGCTGTCGTATCCACAACATTTATTGTAAAAGTTGTCGTCGATTTGTTATTTGCTTGGTCAGTAGACACAACTGTCACTGTTGATTGACCAATTTTTGTTGGTGTCCCAATGATTGAATTCGTTGCACTATCGTAACTTAATCCGCTTGGTAATCCTGTAACTGTATTTGTCACAGTCCCAGTACCATTATCCGTTGTAGTCAATACAATAGGATTCATTGTTTTACCCACTTCTATGGTTTGATTGCCTACAGTTACAGTTGG > CP000730/2816331‑2816600 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |