| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,100,582 | A→G | 6.2% | intergenic (‑146/+184) | USA300HOU_1033 ← / ← pdf1 | hypothetical protein/formylmethionine deformylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,100,582 | 0 | A | G | 6.2% | 228.8 / 2.1 | 80 | intergenic (‑146/+184) | USA300HOU_1033/pdf1 | hypothetical protein/formylmethionine deformylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/39); new base G (3/2); total (39/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.20e-01 | |||||||||||
AAAATTAGTGAAATAACACTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAAAGGAAAAGCTTAG > CP000730/1100442‑1100721 | aaaaTTAGTGAAATAACACTAAAATTTCAATTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAgaga < 2:193555/141‑1 (MQ=255) ttAGTGAAATAACACTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAAGGTAGAGATtat > 1:215924/1‑141 (MQ=255) aGTGAAATAACACTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATaa < 2:431517/141‑1 (MQ=255) aGTGAAATAACACTAAAATTTCAGCTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGGTTATaa > 1:632477/1‑141 (MQ=255) aGTGAAATAACACTAAAATTTCAGCTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGGTTATaa > 1:632368/1‑141 (MQ=255) aaaTAACACTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTTTTTATTAAAATACATGTAGATCTTATAAATTa > 1:49857/1‑141 (MQ=255) aaTAACACTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTAtaaataaa > 1:99808/1‑141 (MQ=255) aaTAACACTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTaa > 1:362256/1‑141 (MQ=255) aTAACACTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAAt < 2:16803/141‑1 (MQ=255) aTAACACTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAAt < 1:235263/141‑1 (MQ=255) aTAACACTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAAt < 1:120918/141‑1 (MQ=255) cacTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTa > 2:616242/1‑141 (MQ=255) cacTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTa > 1:151894/1‑141 (MQ=255) tAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTaaga > 1:706148/1‑141 (MQ=255) aaaaTTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTaagaa < 2:262460/141‑1 (MQ=255) ttCATTTAAATTTAATTTTAGATGATGAATGATAAGAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAAGGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAAt < 1:761590/141‑1 (MQ=255) ttATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTta < 1:464043/141‑1 (MQ=255) aTTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCCCTAGTAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGAATATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTtata > 2:653536/1‑141 (MQ=255) cATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCCATAGAAATCTAAGTATTTCGAATAGATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGAAGAGATTGTAAATTAATGTTAAGAAAGAGTTAAAGGATTTTATATTaaaa > 2:380731/1‑140 (MQ=255) cATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGaaaa > 1:537534/1‑140 (MQ=255) attatgaatgaTAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAACTAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACg < 1:250775/138‑1 (MQ=255) tgatgaATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAACTCTCATTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACgg < 1:371543/141‑1 (MQ=255) tgatgaATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAACGAGGTAAAGGATTTTATATGAAACgg < 2:185319/141‑1 (MQ=255) tgaTAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAAtt < 1:296528/141‑1 (MQ=255) tgaTAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAAtt < 1:453478/141‑1 (MQ=255) tgaTAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAAtt > 1:503117/1‑141 (MQ=255) ataataAATAAAGAAGTTTTTCCCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGCGATTATAACTTAATGTTAGGCAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGGAAAAGTTa > 2:365183/1‑141 (MQ=255) ataaataaATCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAAt < 2:854772/141‑1 (MQ=255) ataaataaAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAAt > 1:311803/1‑141 (MQ=255) aaGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGa < 2:596108/141‑1 (MQ=255) aGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAACTTTAAATGAGGGGaa > 2:449854/1‑140 (MQ=255) aGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGAt > 2:464351/1‑141 (MQ=255) aGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGAt > 1:80064/1‑141 (MQ=255) gCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATa < 1:835883/141‑1 (MQ=255) gCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATa > 2:209411/1‑141 (MQ=255) gCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATa > 2:657421/1‑141 (MQ=255) gCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATa > 2:412003/1‑141 (MQ=255) gCAGTTTATCTCACGAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATa < 1:698857/141‑1 (MQ=255) cAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATaa < 2:64069/141‑1 (MQ=255) tATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTACAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGt > 1:28805/1‑141 (MQ=255) aTCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGtt > 2:419002/1‑141 (MQ=255) aTCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGtt > 2:838941/1‑141 (MQ=255) aTCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGtt < 1:775915/141‑1 (MQ=255) ctcACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTg > 2:484246/1‑141 (MQ=255) cACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGt < 2:207963/141‑1 (MQ=255) cACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGt < 2:207946/141‑1 (MQ=255) cTAGAAATCTAAGTATTTCGAACAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAg < 1:599133/141‑1 (MQ=255) aaTCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAgg < 2:612035/141‑1 (MQ=255) aaTCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAgg < 2:763305/141‑1 (MQ=255) aaTCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATACGTAACTGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAgg < 1:166842/141‑1 (MQ=255) aTCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTCGAGGTTATAAATTAGTGTTAAGAAGGAATTTAAGTTGATTAGGGTTAACTTTATATGTTAAAAGAGGGGAAAAAAAGTTTGGTGGAAAggg > 2:831797/1‑140 (MQ=255) aTCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGCTAAAAAGTTTGGTAGAAAGGt > 2:869287/1‑141 (MQ=255) aGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAata < 2:349766/141‑1 (MQ=255) cGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAACGGTGAATATATTTaa > 2:44754/1‑141 (MQ=255) cGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTaa > 1:201418/1‑141 (MQ=255) cGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTaa > 1:460675/1‑141 (MQ=255) cGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTaa > 2:728938/1‑141 (MQ=255) aTAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAAcgt > 2:233347/1‑139 (MQ=255) aTAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATGAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACtg > 2:813574/1‑141 (MQ=255) gCAGTTCTATTAATGAAAATAAATGTATAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAACATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTAt < 2:308995/141‑1 (MQ=255) gCAGTTAAATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGAATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACtgaaaaaaaa < 2:806100/141‑9 (MQ=255) gTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCg < 1:616242/141‑1 (MQ=255) tCTATTTATTAAAATCAATGAAGAGATTATCAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTACATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGaa > 2:598068/1‑141 (MQ=255) tCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGaa > 2:597793/1‑141 (MQ=255) tCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAAATTAAATGAGGGGATAAAAAGGTTGGTAGCAAGGTGAATATATTAAAGTGTTGTCTTGTCGaa > 2:425075/1‑141 (MQ=255) tatttattAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGaaaa < 1:16198/141‑1 (MQ=255) atttattAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGaaaaa < 1:699367/141‑1 (MQ=255) ttattaAAATAAATGTAGAGGTTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTGACTGTTGTTTATTCGAAAAAGt < 2:632368/141‑1 (MQ=255) ttattaAAATAAATGTAGAGGTTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTGACTGTTGTTTATTCGAAAAAGt < 2:632477/141‑1 (MQ=255) tattaAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGCTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTAGTTTAtcagacaacgtt > 1:828683/1‑130 (MQ=255) attaAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTGGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTg > 1:552237/1‑141 (MQ=255) aaataaatGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTaaa > 1:351467/1‑141 (MQ=255) taaatGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAAAgg < 1:1480/141‑1 (MQ=255) taaatGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAAAgg < 1:728938/141‑1 (MQ=255) aaaatGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAAAgg < 2:180339/140‑1 (MQ=255) aaatGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAAAGGa < 1:563535/141‑1 (MQ=255) aaatGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAAAGGa < 1:31742/141‑1 (MQ=255) atGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAACCAGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAAAGGaaa < 2:831716/141‑1 (MQ=255) tGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAAAGGaaaa < 2:802537/141‑1 (MQ=255) tGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTAGATTAATCGAAAAAGTTGTAAAAGGaaaa < 2:315406/141‑1 (MQ=255) agagATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAACGGAAAAGCt < 2:328729/141‑1 (MQ=255) gagaTTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAAAGGAAAAGAtt > 2:648254/1‑141 (MQ=255) gaTTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAAAGGAAAAGCTTAg > 1:334747/1‑141 (MQ=255) | AAAATTAGTGAAATAACACTAAAATTTCAGTTAAATCTTATTTTACATGATGAATGATAATAAATAAAGCAGTTTATCTCACTAGAAATCTAAGTATTTCGAATAAATGTGCAGTTCTATTTATTAAAATAAATGTAGAGATTATAAATTAATGTTAAGAAAGAATTAAAGGATTTTATATGAAACGGTAAAATTTAAATGAGGGGATAAAAAGTTTGGTAGAAAGGTGAATATATTTAACTGTTGTTTATTCGAAAAAGTTGTAAAAGGAAAAGCTTAG > CP000730/1100442‑1100721 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |