| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 76,969 | G→A | 100% | intergenic (+1027/‑107) | USA300HOU_0072 → / → USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 76,969 | 0 | G | A | 98.9% | 261.1 / ‑4.7 | 86 | intergenic (+1027/‑107) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (51/34); minor base C (1/0); total (52/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.31e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
GATCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAGGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTCA > CP000730/76837‑77102 | gATCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAAtt > 2:627152/1‑141 (MQ=255)gATCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAAtt < 1:665895/141‑1 (MQ=255) aTCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAAttt > 2:119870/1‑141 (MQ=255) tCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTACTTta > 2:821744/1‑141 (MQ=255) tACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATATTATACATGGGCTTAAAAGGTTAATTtata < 2:835621/141‑1 (MQ=255) aCGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCCAGTTACGAGTAAACTGAAATGATAATATTGAGGTTTGTTCTATTTTTTGACTTTGCAATTGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTtatat > 2:633838/1‑141 (MQ=17) cGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCACCTGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTtatata > 1:371340/1‑141 (MQ=255) gttgtcgcatggCCGCGTAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAATCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATGTATATAGTa < 2:370927/130‑1 (MQ=17) ttttCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTAt < 1:274902/141‑1 (MQ=255) ttttCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTAt < 1:864847/141‑1 (MQ=255) ttCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTa > 2:211816/1‑141 (MQ=255) ttCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTa > 2:437235/1‑141 (MQ=255) ccctgcacagAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGc < 1:537449/132‑1 (MQ=255) acgacACGACACTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTTGTGGTTAGCTATATTTTCTTACTTTGCAACAGATCCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGAATTACTGaaa < 2:192765/137‑1 (MQ=18) aTGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCaa < 2:864593/141‑1 (MQ=255) aTGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCaa < 2:657347/141‑1 (MQ=255) ccACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACa < 2:758693/141‑1 (MQ=255) cACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACAt < 1:151880/141‑1 (MQ=255) aaaTTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTCGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGAt > 1:843527/1‑141 (MQ=255) aaTTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGAtt > 2:508984/1‑141 (MQ=255) ttAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTg < 1:5633/141‑1 (MQ=255) tAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTgg > 1:504214/1‑141 (MQ=255) aGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACCGCAAACATTGATATggg > 2:418554/1‑141 (MQ=255) catcatGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑Tc < 2:474698/141‑1 (MQ=255) tAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACTTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTa > 2:130393/1‑141 (MQ=255) aGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAg > 1:725542/1‑141 (MQ=255) aGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAg > 2:499998/1‑141 (MQ=255) gCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGT‑TCAAAAATTAgg > 2:423697/1‑141 (MQ=255) aaGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTCTAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTa > 2:483593/1‑141 (MQ=255) aaGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGA‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTa > 2:370975/1‑141 (MQ=255) aaGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACATATAAAAAACATGGGATTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑Atga > 2:626498/1‑139 (MQ=255) gCGAACACTGCCATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTTCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTaaa < 1:379585/141‑1 (MQ=255) gCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACATAAAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTaaa < 2:723912/141‑1 (MQ=255) acacTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTaaaaaaa > 1:795549/1‑141 (MQ=255) gACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGA‑TTAAAAATTCGGGGT‑ATTAAAAAaatgaat > 1:326548/1‑141 (MQ=255) gACAGGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTCTTTTCTTTTCTTCAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTAATATAGTATTGCTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAaatgaaa > 2:524696/1‑140 (MQ=255) aCATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAGCAGAACCTATAAAAAACAAGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACAATGATTTGGG‑TCAAAAAATAGGAGT‑TTTAAAGAaatgcata > 1:62162/1‑140 (MQ=37) aCATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAaatgaatg > 1:724615/1‑141 (MQ=255) aTGAGAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAACAGGTTAATTTATATAGTATTAATACCAACATTGCTTTGGT‑TCAAAGATTACGGGT‑ATTaaaaaaagaaattaa > 2:523495/1‑133 (MQ=25) gATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATc < 1:288281/141‑1 (MQ=255) aTAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCa < 1:474040/141‑1 (MQ=255) aTAAATGAGTGGTGAGTGATGTTTTTTTACTTTGCAAGCGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TAAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCa < 1:821744/141‑1 (MQ=255) aaaTTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTTTTTTTTTTTAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGATTcttt > 2:415668/1‑138 (MQ=255) aaaTTAGCGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATa > 1:786031/1‑141 (MQ=255) aaTTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATaa > 1:48275/1‑141 (MQ=255) atgaGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAAt < 2:531626/138‑1 (MQ=255) tGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTAt > 1:638662/1‑141 (MQ=255) ttAGCTATATTTTTTTATTTTTTTACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGATTGAATCATAATTTTATCaa > 2:776298/1‑141 (MQ=255) ttAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCaa > 1:66222/1‑141 (MQ=255) tAGCTATATTTTTTTTTTTTTTTTTAGAACCTATAAAAAACAAGAGCTTAAAAGGTTAATTATTGGAGTATTACTGCAAACATTGCGTTGGG‑ACAAATATTAGGGGT‑ATTAAAAATATGATTGATTCATAATTTTATCagg > 2:814056/1‑139 (MQ=255) tAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTACAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAg > 1:744061/1‑141 (MQ=255) tAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAg > 1:744120/1‑141 (MQ=255) cTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAACGGTTACTTTATATAGTATTACTGCAACCATTGATTTGGG‑TCAAACATTCGGGGT‑ATTAAAAAACTGAATGAATCATACATTTCTCAAGCTg > 1:826405/1‑141 (MQ=255) cTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTg > 2:508029/1‑141 (MQ=255) cTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTg < 1:148208/141‑1 (MQ=255) cTATATCTTTTTACTTTGCAAAAGAACCTAAAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTg < 1:576002/141‑1 (MQ=255) tttttttACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑‑CGACCACGAGTATTGATAAAAACACTAAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTgg > 1:195299/1‑141 (MQ=255) ttttACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGgaga > 1:14219/1‑141 (MQ=255) ttACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAgg > 1:211539/1‑141 (MQ=255) ttACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATCTTATGAAGCTGATTGGAGAgg < 1:442629/141‑1 (MQ=255) aatttGCAAGAAAACCTATAAAAAACAAGGGCTTAAAACGTTAAATTATATCCTATTACTACAAACATTGATTTGGGATCACCAA‑AAACTCA‑ATTAAAAAAATGCTTTAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGTGATGtt < 2:393299/139‑1 (MQ=255) cTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTa > 1:746514/1‑141 (MQ=255) ttGCACCAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTCTCTAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑CTTAAAAAAATGCATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGgagacgataga > 2:720824/1‑134 (MQ=255) ttGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTaaa > 2:574258/1‑141 (MQ=255) gCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAAt > 1:67076/1‑141 (MQ=255) 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1:758562/1‑141 (MQ=255) ccTATAAAAAACGTGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATtatat < 2:217970/141‑1 (MQ=255) ccTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATtatat < 2:48275/141‑1 (MQ=255) cgacagaaaaGATGGGATTAAAAGATTAATTTATATAGTACTACTGCAAACAATGAAAAGAA‑AAAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATtatata < 2:343412/135‑1 (MQ=255) taAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATaaaa > 1:506142/1‑141 (MQ=255) aaaaaCATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAAtt > 2:159999/1‑141 (MQ=255) aaCATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTAt < 2:725542/141‑1 (MQ=255) aCATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGTGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAAAGGTTACAATGCATTATATAAAATTTAtt > 2:219564/1‑141 (MQ=255) aCATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTAtt < 1:211816/141‑1 (MQ=255) tGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAg < 2:66222/141‑1 (MQ=255) gggCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGt > 1:708006/1‑141 (MQ=255) gggCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGt > 2:284900/1‑141 (MQ=255) ggCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTc < 1:23797/141‑1 (MQ=255) ggCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTc > 2:338310/1‑141 (MQ=255) gCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAATTGCATTATATAAAATTTATTGAGTCa < 1:725915/141‑1 (MQ=255) gCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTCa < 1:22540/141‑1 (MQ=255) | GATCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAGGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGG‑TCAAAAATTAGGGGT‑ATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTCA > CP000730/76837‑77102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |