| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,850,161 | A→G | 4.2% | intergenic (+150/‑2) | USA300HOU_2691 → / → pcp | rhodanese domain sulfurtransferase/C15 family pyroglutamyl‑peptidase I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,850,161 | 0 | A | G | 4.2% | 345.1 / 2.8 | 113 | intergenic (+150/‑2) | USA300HOU_2691/pcp | rhodanese domain sulfurtransferase/C15 family pyroglutamyl‑peptidase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (56/51); new base G (3/2); total (59/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
AATACCTTTCAAAACACGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAACCTCTTTTAAGAA > CP000730/2850021‑2850299 | aaTACCTTTCAAAACACGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTaa > 2:776497/1‑141 (MQ=255) aCCTTTCAAAACACGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATCAAATTTTAATACTGCGGGCTGTCTTAAAAt > 1:154591/1‑141 (MQ=255) ccTTTCAAAACACGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAAta > 1:399839/1‑140 (MQ=255) ccTTTCAAAACACGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATg < 1:358866/141‑1 (MQ=255) ccTTTCAAAACACGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTATTTTTTATGCGCATACATAACGTGATATGTTTTTAATTCTGCGCGTGTTAGACTTAATAAAATTTTTATAGTGGGGGGGGTCTTAAAATg > 2:625704/1‑141 (MQ=255) tCAAAACACGCTTTGAAAATCGGATTTATAAAGGTTATTCAATGTTTTTTTTTATGCTCATACATAACCGGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTTCGGGGTGTTATAAACTGaaca > 2:812798/1‑141 (MQ=255) tCAAAACACGCTTTGAAAATCCGTTTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGcaca < 2:53217/141‑1 (MQ=255) tCAAAACACGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGcaca < 2:640970/141‑1 (MQ=255) tCAAAACACGCTTTGAAAATCCAAGTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGcaca < 1:478449/141‑1 (MQ=255) aaaaCACGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAGAATGCACAtt > 2:156793/1‑141 (MQ=255) aaaCACGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTTAAATGCACAttt > 1:662671/1‑141 (MQ=255) aaaCACGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACAttt > 1:235844/1‑141 (MQ=255) aaCAGGCATTTAAAAGCCGTTTCATTAATGTTTTTCAAGGCTTTTTTTTACGCGCATACATAACATGATCAGCTTTTAATTATGCTCGTTATATACTAAATTAAATTTTAATATAGCGGGGTGTCTTAAAAAGCTCAtttt < 2:41734/141‑1 (MQ=255) cacGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTTCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAg > 2:856703/1‑141 (MQ=255) cacGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAg > 1:604723/1‑141 (MQ=255) acGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTTCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGt > 1:510186/1‑141 (MQ=255) ccTTTGAAAATCCCATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATCCACAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTaa < 2:830317/140‑1 (MQ=255) aaaTCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGtt > 1:676243/1‑141 (MQ=255) aaTCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGttt < 1:770299/141‑1 (MQ=255) aaTCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTGTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGttt < 2:722484/141‑1 (MQ=255) tCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATCTGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTgc < 1:484464/141‑1 (MQ=255) aTTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCt > 2:318840/1‑141 (MQ=255) tttATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCtt < 2:596754/141‑1 (MQ=255) aGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACaa < 1:553755/141‑1 (MQ=255) aGGTTTTTCAAGGCTGTTTCTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAAGTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACaa < 1:686762/141‑1 (MQ=255) ggTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTg < 2:490166/127‑1 (MQ=255) ggTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGCTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTg > 1:490166/1‑127 (MQ=255) tttttCAAGGGTGTTTTTTATCCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCa < 1:128417/141‑1 (MQ=255) tttttCAAGGCTGTTCTCTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTTACAATCa < 1:539077/141‑1 (MQ=255) ttttCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCaa < 2:406221/141‑1 (MQ=255) ttCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCaaaa > 1:295093/1‑141 (MQ=255) ttCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCaaaa > 2:316337/1‑141 (MQ=255) tCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAat < 1:316337/141‑1 (MQ=255) cAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAAAAGGGTTTGCGCCTTTTGAAAATCaatgta > 2:166344/1‑137 (MQ=255) aGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATc < 2:555179/141‑1 (MQ=255) ggCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATTGGTTTTTAATTATACGCGTGTTATACAAAATTACATTTTAATACTGCGGGGGTACTTAGAATGCACATTTTAGTAACGGGGTTTGCGCACTTTGACAATTaaacaattc > 2:522692/1‑135 (MQ=255) ggCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTATTTAATTATGCGCGTGTTATACTACATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTCACAGGGTTTGCGCCTTTTGACGATGAAAATCTCa > 2:697835/1‑141 (MQ=255) ttttATGCGCATACATCACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTc > 1:430654/1‑141 (MQ=255) tATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGGTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATATATCCCTCATg > 1:216168/1‑141 (MQ=255) tATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATAATAAATTAAATTTTAATACTACGGGGTGTCTTAAAATGCACATGTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCCCATg > 2:350861/1‑141 (MQ=255) aTGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAGAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATgg < 1:156793/141‑1 (MQ=255) aTGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAGAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATgg < 1:52640/141‑1 (MQ=255) tGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATggg < 1:834594/141‑1 (MQ=255) tGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATggg < 1:312768/141‑1 (MQ=255) atacataACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCt < 1:681670/141‑1 (MQ=255) tacataACCTTATATGTTTTTAATGAAGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCtg < 2:226475/141‑1 (MQ=255) tacataACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCtg < 2:510186/141‑1 (MQ=255) cataACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATGCAAAGATCTGTCCGTCATGGGGACCtgtg > 1:405443/1‑141 (MQ=255) ataACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAGTACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGa > 2:550980/1‑141 (MQ=255) ataACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGa > 1:786327/1‑141 (MQ=255) ataACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGa > 1:788449/1‑141 (MQ=255) taACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAGATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGGGAc > 2:5624/1‑141 (MQ=255) aaCCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACt < 1:813989/141‑1 (MQ=255) aCCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTc < 2:681200/141‑1 (MQ=255) tGATATGTTTTTAATTATGGGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAAc < 2:450019/141‑1 (MQ=255) tattctgttAATTATGCGCGTGTTAAACTAAATTAAATTTTAATACTGCTGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTCTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTag < 2:365590/134‑1 (MQ=255) tatGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTag > 1:75313/1‑141 (MQ=255) tGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTagaa < 1:3457/141‑1 (MQ=255) tttttAATTATGCGGGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACGTTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTagcaga > 1:462775/1‑141 (MQ=255) ttttAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGat > 2:45677/1‑141 (MQ=255) aaTTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGAtatta < 1:776497/141‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGTTATAGTAAATTAAAGTTGAATACTGCGGGGTGTCTTAAAAGGCAGATTGTAGTAACAGGATTTGCGCCTTTTGACAATCAAAGTATCAATCCCTCATGTGAAGCTCGGCCTCAACTCTAAGaaatgcaggg > 2:294712/1‑135 (MQ=255) aTGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTgg > 2:30842/1‑141 (MQ=255) aTGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTCTAATTCTGCGGGGCGGCTTAAAATGCACATTTTAGGAACGGGGTTGGCGCCTTTGAAGAATCAAAATATTAATCCCCCAAGGTAGCCAGTGTCTCAACTATCAGATATTATTgc > 2:294715/1‑140 (MQ=255) tGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTTATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGc > 2:210526/1‑141 (MQ=255) tGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGACGCTGTGCCTCAACTCGAAGCTATTATTGGc > 1:820579/1‑141 (MQ=255) gcgTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGcaca < 2:113857/141‑1 (MQ=255) cgTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGcacac > 1:337463/1‑141 (MQ=255) gtgtTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGcacaca < 1:360141/141‑1 (MQ=255) tgtTATACTAAATTAAATTTTGATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACAt > 1:445043/1‑141 (MQ=255) ttATACTCAATTAAATTGTAATAAAGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACCGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCGCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCGCACATaa > 1:77035/1‑140 (MQ=255) ttATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATAc < 1:210526/141‑1 (MQ=255) ataCTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACaa > 1:275584/1‑141 (MQ=255) taCTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAAt < 1:131132/141‑1 (MQ=255) aCTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATATTAGTAACAAAGATTAAACCTTTTGACAATCAAAATCTCAATCCCTCATGGAGAGCCGAGACCTAACTATAAATAATTATTTGCAGAAATACAATc > 2:818093/1‑141 (MQ=255) cTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCg > 2:577896/1‑141 (MQ=255) ttaagttTTAAGAATACAGGCAGTCGTAAAAGGCACCTTTTAGTAACTGGAATTCCGCCTTTTGACAACCAAAATATCAACTGCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATGATTGGCACAAATACGATCGATaaa < 2:278881/141‑1 (MQ=255) ttaaattTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATaaa < 2:278876/141‑1 (MQ=255) aaattTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAAtt > 1:717930/1‑141 (MQ=255) aattTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTa > 1:819866/1‑141 (MQ=255) attTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACCTACAATCGATACATTaa > 1:223781/1‑141 (MQ=255) tttAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTaaaa > 2:825573/1‑141 (MQ=255) tACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTGAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTAcc > 2:19579/1‑141 (MQ=255) tACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTAcc > 1:861595/1‑141 (MQ=255) aCTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATCTTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCa > 2:465567/1‑141 (MQ=255) cTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGGCTCAACTACAAGATATTATTGGCACACATGCACTCGATAAATTAAAACTACCac > 2:684724/1‑140 (MQ=255) cTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCaa > 1:149276/1‑141 (MQ=255) cTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCaa < 1:700235/141‑1 (MQ=255) tGCGGGGTGTCTTAAAATGCTCATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAAc < 2:20915/141‑1 (MQ=255) gggTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAGAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTACAAGATATTATTGGGACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAACatct > 2:566578/1‑141 (MQ=255) ggTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAACCTCtt > 2:497632/1‑141 (MQ=255) tgtCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCATTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAACCTCtttt < 2:515379/141‑1 (MQ=255) tCTTATATTGGAAATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAAGCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAACCTCTTTTaa < 2:387367/141‑1 (MQ=255) tCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAACCTCTTTTaa > 1:504029/1‑141 (MQ=255) tCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAACCTCTTTTaa > 2:716762/1‑141 (MQ=255) tCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAACCTCTTTTaa > 1:687108/1‑141 (MQ=255) cTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATACATTAAAACTACCAACCTCTTTTAAg < 1:463371/141‑1 (MQ=255) tAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAACCTCTTTTAAGaa < 1:52709/141‑1 (MQ=255) tAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAACTAAAACTACCAACCTCTTTTAAGaa < 1:860788/141‑1 (MQ=255) tAAAACACACGTTTTAGCAATAGGGTTTGCGCCTTTTTGCAACCAAAATATTAAGCCCACATTGGAAGCTGTTACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAACCTCTTTTAAGaa < 1:178352/141‑1 (MQ=255) | AATACCTTTCAAAACACGCTTTGAAAATCCGATTTATAAAGGTTTTTCAAGGCTGTTTTTTATGCGCATACATAACCTGATATGTTTTTAATTATGCGCGTGTTATACTAAATTAAATTTTAATACTGCGGGGTGTCTTAAAATGCACATTTTAGTAACAGGGTTTGCGCCTTTTGACAATCAAAATATCAATCCCTCATGGGAAGCTGTGACTCAACTAGAAGATATTATTGGCACACATACAATCGATAAATTAAAACTACCAACCTCTTTTAAGAA > CP000730/2850021‑2850299 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |