| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,852,714 | G→T | 8.4% | intergenic (+68/‑170) | USA300HOU_2695 → / → USA300HOU_2696 | hypothetical protein/DASS family divalent anion:sodium (Na+) symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,852,714 | 0 | G | T | 8.4% | 235.6 / 3.1 | 83 | intergenic (+68/‑170) | USA300HOU_2695/USA300HOU_2696 | hypothetical protein/DASS family divalent anion:sodium (Na+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/33); new base T (5/3); total (46/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAATGCCATTCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTAAATTGAAATA > CP000730/2852574‑2852851 | aaaTGACATTCACATCCCACTTCATGCGTGTAAAATTGAAGACATCTCTCTCATATTAAAAAATTGAAAATAAATATTTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTg < 2:413765/141‑1 (MQ=255) aaTGCCATTCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGa > 1:99199/1‑141 (MQ=255) tGCCATTCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAAt < 2:799894/141‑1 (MQ=255) ccATTCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAAttt > 1:104188/1‑141 (MQ=255) ccATTCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAAttt > 2:427368/1‑141 (MQ=255) ccATTCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATGTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTCTTTTGAAttt < 1:628233/141‑1 (MQ=255) cATTCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTta < 2:322812/141‑1 (MQ=255) cATTCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTta < 2:710039/141‑1 (MQ=255) aTTCACATCCCACTTCATGCTGGTACAACAGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTtttatttat > 2:146139/1‑140 (MQ=255) aTTCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGATAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTtat > 2:390891/1‑140 (MQ=255) ttCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATGGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATGAATATGTGTTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTtaat < 2:451507/141‑1 (MQ=255) tCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTtaata < 1:149692/141‑1 (MQ=255) ccccccccACTTTATTGTGGTAACGTTGTAAAGATTGCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTtaataa < 1:194699/136‑1 (MQ=255) cacaTCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTtaataa > 1:661630/1‑141 (MQ=255) caTCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAGTCTGTAAGTTCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAac < 1:199839/141‑1 (MQ=255) caTCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAac > 2:272842/1‑141 (MQ=255) caTCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGGTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAac > 1:157094/1‑141 (MQ=255) caTCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATGTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCATTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATCAac < 1:621776/141‑1 (MQ=255) aTCCCACTTCATGCTGGTACAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTTAAAGGTCACTTTTTTGATTTtactaaccc > 2:839056/1‑138 (MQ=255) aTCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAaca > 2:703982/1‑141 (MQ=255) tccctattaattcTGGTAAAATTGAAGAGATGCCTCGTATAATAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTAAAAAAAGAATAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAacac < 2:119195/129‑1 (MQ=255) tCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATacacac > 1:252591/1‑141 (MQ=255) tCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGAAAATTAAAAAATTTCAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTCTAAAGGTCGCTCTTTTGATTTTAATAAacac > 2:430660/1‑141 (MQ=255) ccACTGCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTATCGCATAACCAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCa < 1:668272/141‑1 (MQ=255) cACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCAt > 1:622709/1‑141 (MQ=255) aCTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAATTAGGGTCTGATTAACCGTTAACAACACGATAACGGGTTTTTTATTGGTTTAAACGGTCACTTTTTTGAATGTAATAAACACAATc > 2:216417/1‑141 (MQ=255) aCTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGCTTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATc < 2:27868/141‑1 (MQ=255) cATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCtata > 1:566588/1‑141 (MQ=255) aaaTTGAAGAGATGTTTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGttcttc < 1:248009/141‑1 (MQ=255) agagATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTTATTTTTTTTTACACATTCTATACTTGttcgtctcgtctt > 2:699707/1‑134 (MQ=255) agagATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCAATTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCAAtt > 2:286449/1‑141 (MQ=255) tcGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCTATTCCCGaaaaa > 2:295810/1‑141 (MQ=255) atatTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGATAaataat > 1:749911/1‑141 (MQ=255) atTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCAc > 2:657014/1‑121 (MQ=255) atTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCAc < 1:657014/121‑1 (MQ=255) ttAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATtat > 1:140667/1‑141 (MQ=255) ttAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGGTAACGGGTGTTTTATATGTTTAAAAAGTCACTTTTTTGAAATTAATAAACACCATCTATCCCAGTAATTCCGCGATTATTGAAAattaaacat > 2:654158/1‑137 (MQ=255) aaaaTTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTa < 1:650120/141‑1 (MQ=255) aaaTTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTaa < 2:267620/141‑1 (MQ=255) aaaTTTAAAATAAATATGCGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTaa < 2:854899/141‑1 (MQ=255) tAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACAAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGAtt > 1:123920/1‑141 (MQ=255) aaataaatATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTACACCATCTATACCAATTCTTCACCGCTTCTCGAACACTAATTATATCAATGATTTc > 2:371170/1‑141 (MQ=255) aaaaaaagATGTGCCTATGAACCGTTAACAACACGGTAACGCGTTATTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTGTTCATTCAATATACACCATCGATAACAGTTCTTCCCCGATTCTCGTAATACAATTATATTatacattcg < 2:206779/141‑9 (MQ=255) agtaataTGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGt < 2:264929/138‑1 (MQ=255) taaataTGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGCTTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGtt < 2:417657/141‑1 (MQ=255) taaataTGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGtt > 1:173607/1‑141 (MQ=255) tgtgCTTATTAACCGTGAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAACTAATTATATTTATGATTTCTttaattta > 1:444408/1‑141 (MQ=255) gtgCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGttaatttaa > 1:413129/1‑141 (MQ=255) gtgCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTATATTTGTTTTAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTTTACCAGTTCTTCACCGATTTTCGAAAATTAATTATATTATTTATTTGTttactttaa > 1:105292/1‑141 (MQ=255) aaCCGTTTACATCACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATAtt < 2:40358/141‑1 (MQ=255) aaCCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATAtt > 2:250289/1‑141 (MQ=255) aaCCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTAATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATAtt < 2:260785/141‑1 (MQ=255) cGTTAACATCACGTGAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAACGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTaa < 2:578379/141‑1 (MQ=255) cGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTaa < 1:12536/141‑1 (MQ=255) ttAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAatt < 2:33332/141‑1 (MQ=255) aacgtgttgTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAattat > 1:681722/9‑141 (MQ=255) aacaacACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAattat > 1:570036/1‑141 (MQ=255) aacaacACGTTAACGGGTTTTTTATTTGGTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTCATGATTTCGTTAATTTGATTTTATATttatttat > 1:547313/1‑141 (MQ=255) ccaacaCGTTAACGGGGTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAattatt > 2:146416/2‑141 (MQ=255) caacaCGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAAttatta > 2:232316/1‑141 (MQ=255) gtgttgTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTAc > 1:183432/6‑141 (MQ=255) acGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGt < 2:248422/141‑1 (MQ=255) cGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTTAATTTAATAGACACCAGCTATACCAGTCCTTCTCCTATGCTCGAAAAATAAGTATATCAATGATTTCGTTAATTTAATTTCATACTTAATTATTACTGTa < 1:646747/141‑1 (MQ=255) cGTTAACGGGTTTTTTATGTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTa < 2:584471/141‑1 (MQ=255) tAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACAt < 1:530888/141‑1 (MQ=255) aCGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTTTTTTTTTTTAACACCATATATACCCGTTATACATCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGCTTTCTTTAATTTAATTTTATATTTGattatttttgttctttt > 2:714524/1‑130 (MQ=255) ggTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTTTTTTTTTTTAACACAATATATACCAGTTCTTAACTGCTTATAGAAACATAATTATATTAATGATTTCTTTCATTTAATGTTATATTTAATTATTACTGTACATcagtt > 2:239684/1‑137 (MQ=255) aTTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAg > 1:118100/1‑141 (MQ=255) gTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCttt < 1:272842/141‑1 (MQ=255) ttAGAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTAt > 1:623176/1‑141 (MQ=255) aaGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCtt < 2:597495/141‑1 (MQ=255) aaGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGCAGTTAGCTTTATTCtt < 1:427368/141‑1 (MQ=255) gTCACTTTTTTTTTTTTTTTTAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTGATTTATTTTTATATTTAATTATTTCTGTTTATTTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTaaa > 2:385573/1‑141 (MQ=255) gTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTaaa > 2:623467/1‑141 (MQ=255) gTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTaaa > 2:505984/1‑141 (MQ=255) gTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTaaa > 1:122066/1‑141 (MQ=255) tCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTAAAt > 1:801917/1‑141 (MQ=255) cACTTTTTTGAATTTAATATCGACCATCTATAGCAGTTCTTCACCGATTTTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAAGTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTAAAtt < 2:604616/141‑1 (MQ=255) ccTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTAAATTg < 2:126020/140‑1 (MQ=255) aCTTTTTTTAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTAAAAGATAAAAAAAAAATAACTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTAAATTg < 2:620828/141‑1 (MQ=255) aCTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTAAATTg > 1:495900/1‑141 (MQ=255) aCTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTAAATTg > 1:752121/1‑141 (MQ=255) aCTTTTTTCAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTAAATTg < 2:509669/141‑1 (MQ=255) tttGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCTATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTAAATTGAAata < 2:819867/141‑1 (MQ=255) tttGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTACTTTTATATTTAGTTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTAAATTGAAata > 1:445512/1‑141 (MQ=255) | AAATGCCATTCACATCCCACTTCATGCTGGTAAAATTGAAGAGATGTCTCGTATATTAAAAAATTTAAAATAAATATGTGCTTATTAACCGTTAACAACACGTTAACGGGTTTTTTATTTGTTTAAAAGGTCACTTTTTTGAATTTAATAAACACCATCTATACCAGTTCTTCACCGATTCTCGAAAAATAATTATATTAATGATTTCGTTAATTTAATTTTATATTTAATTATTACTGTACATCTTTTGTAGTTAGCTTTATTCTTAAATTGAAATA > CP000730/2852574‑2852851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |