| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 512620 = | 34 (0.830) | 24 (0.820) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA |
17/200 | 0.6 | 44.1% | intergenic (+688/‑173) | recR/rrs1 | recombination protein RecR/16S ribosomal RNA |
| ? | CP000730 | 1998278 = | 51 (1.250) | intergenic (‑6/+5) | USA300HOU_t0050/rrf4 | tRNA‑Val/5S ribosomal RNA | |||||
ACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATT > CP000730/1998138‑1998413 | aCTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTa > 1:645581/1‑141 (MQ=35) ttaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaa > 1:125600‑M2/139‑141 (MQ=255) ttaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgtgcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttctcttgtccctctcctagtgtaaccaaaatgtgactaaaaa > 1:668736‑M2/139‑141 (MQ=255) cgATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTATGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGACCCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTaaa < 1:398676/140‑1 (MQ=255) cgATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTaaa < 1:239426/140‑1 (MQ=38) gacatattgtcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTg < 1:124085‑M2/11‑1 (MQ=255) ttgtcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccgaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACg > 1:306784‑M2/125‑141 (MQ=255) tGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTACGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGt > 1:290710/1‑141 (MQ=255) tGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGt > 1:354427/1‑141 (MQ=255) tGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGt > 1:132802/1‑141 (MQ=255) ctctACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTc > 1:356379/1‑141 (MQ=255) ctACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTa < 1:391118/141‑1 (MQ=255) tACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTAc > 1:875074/1‑141 (MQ=255) tACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTAc > 1:434083/1‑141 (MQ=255) ccAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTActc < 1:237817/141‑1 (MQ=255) ccAATTGAGCCAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTActc < 1:237811/141‑1 (MQ=255) ccAATGGAGCGAGGCCGGCAAGATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTActc < 1:324534/141‑1 (MQ=255) cAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACTGGTTCGATCCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTActct < 1:685131/141‑1 (MQ=255) agttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaggtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAGAACTGCCTGGCAACGTTGtactgt > 1:35804‑M2/116‑139 (MQ=255) agttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTActct > 1:930217‑M2/116‑141 (MQ=255) ttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaacaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAg > 1:395516‑M2/114‑141 (MQ=255) tttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaatttttgattaaAAAACTGACTGGCAACGTTTTGCTCTAGc > 1:190003‑M2/113‑141 (MQ=255) aatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGaa > 1:569530‑M2/109‑141 (MQ=255) gttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGt > 1:712071‑M2/106‑141 (MQ=255) tttcttaccgacaaaaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCg > 1:605235‑M2/99‑141 (MQ=255) tatGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACt < 1:924387/141‑1 (MQ=255) tGTAAGAATAAATGGTGGGGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTATAAGGCAGTTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTGCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTTTACTCTATCGGAACGTAAGTCCGACTAc < 1:600250/141‑1 (MQ=17) aGAATATATGGTGGAGAATGACGGGTTCGACCCGCCGACCCTCTGCTTGTACGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATc < 1:476943/141‑1 (MQ=255) aGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATc < 1:281555/141‑1 (MQ=255) agaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgataaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAAAGTAGGTTCGACTACCATCGACg > 1:411775‑M2/86‑141 (MQ=255) gaattaattatacattttatcnanattnaagtcaataaccttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAACACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGGACGTAAGTTCGACTACCATCGACGc < 1:465548‑M2/57‑1 (MQ=255) aTGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTa > 1:92925/1‑141 (MQ=255) tggAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGa < 1:495220/141‑1 (MQ=255) tggAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGa > 1:752986/1‑141 (MQ=255) ggAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGCCCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGTCTACCATCGACGCTAAGGAg < 1:600925/141‑1 (MQ=255) gagaATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTaagaaga > 1:135625/1‑140 (MQ=255) gagaATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGc < 1:93824/141‑1 (MQ=255) gagaATGACGGGTTAGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGATAATTCTCCGATTTAAAACGGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGAGACGTAGGTTCGACTACCATCGACGCTAAgcaca > 1:458439/1‑137 (MQ=14) atacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCt > 1:787952‑M2/76‑141 (MQ=255) gaATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATACACTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGACCGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCtt > 1:406444/1‑141 (MQ=255) aTGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTCAGCCCGCCTACCCTCGACGCTAAGGAGCGTac > 1:624072/1‑140 (MQ=17) tGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAAc > 1:896621/1‑141 (MQ=255) tGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATGCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTGCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAAc > 1:450406/1‑141 (MQ=255) gACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTGAGTTCGACTACCATCGACGCTAGGGGGCTTAACt > 1:385437/1‑141 (MQ=255) cGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTc < 1:469148/141‑1 (MQ=255) tcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCtgt > 1:337239‑M2/66‑141 (MQ=255) tcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCtgt > 1:738133‑M2/66‑141 (MQ=255) caacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCtgtg > 1:168035‑M2/65‑141 (MQ=255) catttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTc > 1:501666‑M2/62‑141 (MQ=255) taagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCa < 1:432444‑M2/84‑1 (MQ=255) ccccgACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCGCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAACCTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCa < 1:242055/139‑1 (MQ=255) gccgACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAATCTTAGTTGGACTAACATCGACGGTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCAt > 1:670823/1‑141 (MQ=17) aagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCAt > 1:186552‑M2/57‑141 (MQ=255) ccTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCTACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAAc < 1:446726/141‑1 (MQ=255) tctGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAg > 1:765882/1‑141 (MQ=255) ttGTAAGGCAGATGCGCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGtgtg < 1:783526/141‑1 (MQ=255) ttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGa < 1:415203‑M2/99‑1 (MQ=255) tttctcttgtccctttgattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGAc < 1:855529‑M2/100‑1 (MQ=255) tttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGAc < 1:604626‑M2/100‑1 (MQ=255) tttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGAAACGTTCATGTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGAc < 1:214839‑M2/100‑1 (MQ=255) gTAAGGCAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCGCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCACGGGAACAGGTGTGAc < 1:635863/141‑1 (MQ=255) gTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGAc < 1:47136/141‑1 (MQ=255) gTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGAc < 1:762613/141‑1 (MQ=255) cttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGAcctcct > 1:728729‑M2/37‑141 (MQ=255) cAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTGATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGGGCTACTCTAGCGAAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGGGGTTAACTTCTGTGTTGGGCATGGGAACAGGTGTGACCTGCtt > 1:510678/1‑141 (MQ=14) gATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGc < 1:818189/141‑1 (MQ=255) cattttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCATGGtat > 1:248472‑M2/31‑141 (MQ=255) ctctCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCtata < 1:811592/141‑1 (MQ=255) ctctCCCAGCTGAGCTAATCCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTCCTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCtata < 1:139602/141‑1 (MQ=255) attttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCtata > 1:327108‑M2/30‑141 (MQ=255) ttttattttttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAg < 1:125673‑M2/113‑1 (MQ=255) tctcCCAGCTGAGCCAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAg < 1:530078/141‑1 (MQ=255) tttatttttcaaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGt < 1:342013‑M2/114‑1 (MQ=255) ctcCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGt > 1:92690/1‑141 (MQ=255) cgCTGAGCTAATTCCCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTGACTTCGGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCa < 1:405451/140‑1 (MQ=255) aGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCa < 1:322088/141‑1 (MQ=255) ttaaccaaaatttgattaaAAAACTGCATGGCAACGTTCTACTCTAGCGGCCCGAAACTTCGACTGCCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGCGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGAc > 1:402893‑M2/20‑141 (MQ=255) taaccaaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACa < 1:558352‑M2/123‑1 (MQ=255) aGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACat > 1:11917/1‑141 (MQ=255) gCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACata > 1:235902/1‑141 (MQ=255) caaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTACGTGCCACCACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCATCAGAcatata < 1:673437‑M2/127‑2 (MQ=255) caaaatttgattaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGAGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATCGTCACCAgacatcta > 1:479286‑M2/15‑138 (MQ=255) aaaaatttgcttaaAAATCTGCCTGGCAACGTTCTACCCCAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATg < 1:2061‑M2/127‑1 (MQ=255) cGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAt < 1:717694/141‑1 (MQ=38) gATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAtt > 1:796023/1‑141 (MQ=38) attaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTCAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGCCCTCCTTGCTATCGTTACCAGAATGCTGAATGTAAtt > 1:889105‑M2/6‑141 (MQ=255) attaaAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGGGACCGCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGGATGTAAtt > 1:50756‑M2/6‑141 (MQ=255) | ACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATT > CP000730/1998138‑1998413 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |