Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA CP000730 707,910 A→G intergenic (‑1/‑121) mntB ← / → sirR ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein/possible metal‑dependent transcriptional regulator

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP000730707,9100AG100.0% 165.2 / NA 47intergenic (‑1/‑121)mntB/sirRABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein/possible metal‑dependent transcriptional regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (18/29);  total (18/29)

CTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAAGAA  >  CP000730/707772‑708045
                                                                                                                                          |                                                                                                                                       
cTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTTCATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCg                                                                                                                                       >  1:868727/1‑141 (MQ=255)
 ttGATAAGGTAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGt                                                                                                                                      >  1:924973/1‑141 (MQ=255)
 ttGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGt                                                                                                                                      >  1:453605/1‑141 (MQ=255)
      aaGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTtata                                                                                                                                 <  1:585254/141‑1 (MQ=255)
                        cccATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGttt                                                                                                               <  1:453490/140‑1 (MQ=255)
                              cGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTa                                                                                                         >  1:336802/1‑141 (MQ=255)
                                ggCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAAc                                                                                                       <  1:154831/141‑1 (MQ=255)
                                ggCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGATATCGATAAGGAAATGTTTTGAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAAc                                                                                                       <  1:575682/141‑1 (MQ=255)
                                   ccATGATACCGATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCta                                                                                                    >  1:671252/1‑141 (MQ=255)
                                        ttACCAATTATTTCGCCGCGTAATGGTCTCGATAAGTAAATGTTTTTTAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGACTTAAATCTTTTGTTGCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAGGTTTAGGCTGACCtaattaa                                                                                               <  1:671210/140‑1 (MQ=255)
                                        aTACCAACTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtacttaa                                                                                               >  1:582339/1‑141 (MQ=255)
                                           ccAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTGTACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTaattaattt                                                                                            >  1:83597/1‑140 (MQ=255)
                                           ccAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTg                                                                                            >  1:443203/1‑141 (MQ=255)
                                                tattTCGCCGCGTACTGGTATCAAGAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTTTataa                                                                                       >  1:450207/1‑141 (MQ=255)
                                                      gccgcGTACTGGCATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAATCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTATTTAAAAGTTTAGGCTAGTCAAAGTAATTGTATAATAAACt                                                                                 <  1:683613/141‑1 (MQ=255)
                                                          cgTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCATATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTgaga                                                                             >  1:637553/1‑141 (MQ=255)
                                                            tACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAat                                                                           <  1:520796/141‑1 (MQ=255)
                                                                ggTATGGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATAttt                                                                       <  1:239787/141‑1 (MQ=255)
                                                                ggTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATAttt                                                                       <  1:239745/141‑1 (MQ=255)
                                                                ggTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCCAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACCAAGAATAttt                                                                       >  1:165841/1‑141 (MQ=255)
                                                                      gATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATg                                                                 >  1:357225/1‑141 (MQ=255)
                                                                         aaGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCa                                                              <  1:303101/141‑1 (MQ=255)
                                                                           ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAg                                                            <  1:273864/141‑1 (MQ=255)
                                                                            gAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGt                                                           <  1:147210/141‑1 (MQ=255)
                                                                             aaaTGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTa                                                          <  1:687178/141‑1 (MQ=255)
                                                                             aaaTGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTATAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTa                                                          <  1:602318/141‑1 (MQ=255)
                                                                             aaaTGTTTTTAAGTACATGCTTATTAACTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTa                                                          <  1:70512/141‑1 (MQ=255)
                                                                             aaaTGTTTTTAAGTACATGCTTACTACCTACAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTa                                                          <  1:117087/141‑1 (MQ=255)
                                                                              aaTGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTaa                                                         <  1:764292/141‑1 (MQ=255)
                                                                              aaTGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTaa                                                         <  1:764141/141‑1 (MQ=255)
                                                                                tGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGAGTTTCAACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAAt                                                       <  1:214897/141‑1 (MQ=255)
                                                                                    tttAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGt                                                   >  1:842945/1‑141 (MQ=255)
                                                                                        aGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGata                                               <  1:38658/141‑1 (MQ=255)
                                                                                        aGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGata                                               <  1:128129/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                  tattaCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGAc                                     >  1:624123/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                        cTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTAGTGATATAATATAGACAatgta                               >  1:504190/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                            aaaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAGCAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGAAAATGTAtgtg                           >  1:449717/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                            aaaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTAtgtg                           <  1:381743/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                            aaaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTAtgtg                           <  1:583870/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                            aaaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCACCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCACGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTAtgtg                           >  1:635547/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                             aaCTGACTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGa                          <  1:860159/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                               cAGATTTAAATCTTTTGTTTATAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTCTAGGCAAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTAATATAATATAGACAATGACTGTGAgg                        >  1:565280/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                     tAAATCTTTTGTTTCTAACAAGACTGTATGCTTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAg                  <  1:18577/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                 ttCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTga      <  1:112436/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                 ttCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTga      <  1:882930/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                 ttCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGGTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTga      <  1:339923/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                     aaCAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTgaagaa  <  1:405985/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                          |                                                                                                                                       
CTTGATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAAGAA  >  CP000730/707772‑708045

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: