| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,502,141 | C→A | A222D (GCC→GAC) | USA300HOU_2364 → | AraC transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,502,141 | 0 | C | A | 98.7% | 254.9 / ‑3.2 | 77 | A222D (GCC→GAC) | USA300HOU_2364 | AraC transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (44/32); total (44/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.72e-01 | |||||||||||
TGTTCTAATCTTTTTGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGATAACGTATCACAAT > CP000730/2502014‑2502278 | tGTTCTAATCTTTTTGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGt > 1:102694/1‑141 (MQ=255) ttCTAATCTTTTTGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCa < 1:181593/141‑1 (MQ=255) ttCTAATCTTTTTGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCa < 1:632636/141‑1 (MQ=255) cTAATCTTTTTGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATa < 2:56998/141‑1 (MQ=255) tAATCTTTTTGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATAc > 1:34937/1‑141 (MQ=255) aTCTTTTTGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACaa > 2:594131/1‑141 (MQ=255) tCTTTTTGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACaaa > 2:66923/1‑141 (MQ=255) cTTTTTGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAAt > 1:95892/1‑141 (MQ=255) cTTTTTGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAAt > 1:95947/1‑141 (MQ=255) tttttGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAAtt > 2:232599/1‑141 (MQ=255) ttttGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAAttt < 1:734712/141‑1 (MQ=255) gTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCa > 1:374604/1‑141 (MQ=255) tCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCaaa > 1:221212/1‑141 (MQ=255) cGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAAt > 1:807626/1‑141 (MQ=255) acgaatTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAAt < 2:358596/137‑1 (MQ=255) atatTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCa < 2:746922/141‑1 (MQ=255) gAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAGAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTaa < 2:301515/141‑1 (MQ=255) gAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTaa < 1:602603/141‑1 (MQ=255) gTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGa > 2:175952/1‑141 (MQ=255) gTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGa > 1:526943/1‑141 (MQ=255) aTGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAAt < 2:470481/141‑1 (MQ=255) aaTTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTAc > 1:572091/1‑141 (MQ=255) aTTTTAGAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCACCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACt < 2:825358/141‑1 (MQ=255) aTTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACt < 1:279006/141‑1 (MQ=255) aTTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACt < 1:702022/141‑1 (MQ=255) aTTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACt < 2:544941/141‑1 (MQ=255) aTTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACt < 2:771863/141‑1 (MQ=255) tttAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTg > 1:329493/1‑141 (MQ=255) tAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCa > 2:530315/1‑141 (MQ=255) gATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCAtttt > 1:708873/1‑141 (MQ=255) tattTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGt > 1:112243/1‑141 (MQ=255) ttttACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTcc < 2:300375/141‑1 (MQ=255) ttttACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTcc < 1:484393/141‑1 (MQ=255) tttaataCTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGtt > 2:143601/7‑141 (MQ=255) ttAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTcc < 1:189458/141‑1 (MQ=255) aaCTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGtt < 1:751819/141‑1 (MQ=255) aCTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTc > 2:96853/1‑141 (MQ=255) aCTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTc > 2:630683/1‑141 (MQ=255) cTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCa < 1:834355/141‑1 (MQ=255) tGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACt < 1:855047/141‑1 (MQ=255) tGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACt < 1:711333/141‑1 (MQ=255) aCGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGttt > 1:315291/1‑141 (MQ=255) aCGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGttt > 1:292737/1‑141 (MQ=255) gCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTcc < 2:12875/141‑1 (MQ=255) cAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGAt < 2:387356/141‑1 (MQ=255) aTTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTa > 1:58887/1‑141 (MQ=255) tattaCTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATATAAGAAGTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTg > 1:35163/1‑141 (MQ=255) attaCTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGa > 1:858427/1‑141 (MQ=255) attaCTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGGTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTTATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCTGTTCACTCGTTTCCAACATTACTGa > 2:557496/1‑141 (MQ=255) ttaCTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGaa > 1:6200/1‑141 (MQ=255) taCTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAac > 1:476985/1‑141 (MQ=255) tACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACcaca < 2:237126/141‑1 (MQ=255) cAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACaaa > 2:306000/1‑141 (MQ=255) aaaCATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATa > 2:525132/1‑141 (MQ=255) aaaCATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATa > 2:261663/1‑141 (MQ=255) aaCATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATac > 2:624813/1‑141 (MQ=255) aaCATTCTATTACAACAGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCAATTTAGTTCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATac > 2:146753/1‑141 (MQ=255) aCATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATaca > 2:566152/1‑141 (MQ=255) aTTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACt < 2:780333/141‑1 (MQ=255) tCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTc > 2:619708/1‑141 (MQ=255) cTATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCCTACAAATTTTGCAAATCCATCTAAGAATTACTTGCATTCTAGTCCTCAACAGTTCAGTTCACACGGTTCCAAGAATACTCAACCACGACAAATACACTccc > 2:230727/1‑141 (MQ=255) tATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCca > 2:343209/1‑141 (MQ=255) ttACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCcaac > 2:255087/1‑141 (MQ=255) cAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAg > 2:683573/1‑141 (MQ=255) aCTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGAt < 1:175952/141‑1 (MQ=255) aCTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGAt < 1:605844/141‑1 (MQ=255) aCTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGAt > 1:189775/1‑141 (MQ=255) tGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGATaa < 1:756461/141‑1 (MQ=255) gTTTCTGAATTGGACGGTTATAACAGTCATAGAAATTTTGCAGATCAATTTAACAATTACTTGCATTTTCGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGGTTACTGAGCCACCACAAATACACTACCAACTCGATacc < 2:844355/141‑3 (MQ=255) ttCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGATAACGt < 1:378670/141‑1 (MQ=255) cTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGATAACGTAt > 2:466015/1‑141 (MQ=255) cTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGATAACGTAt < 1:434348/141‑1 (MQ=255) tGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGATAACGTATc > 1:736307/1‑141 (MQ=255) tGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGATAACGTATc < 2:804238/141‑1 (MQ=255) tGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGATAACGTATc < 1:4775/141‑1 (MQ=255) tGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGATAACGTATCACAAt > 1:159679/1‑141 (MQ=255) tGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACGTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGATAACGTATCACAAt > 2:681731/1‑141 (MQ=255) | TGTTCTAATCTTTTTGTTCGATATTTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACACTTCCAACAAGATAACGTATCACAAT > CP000730/2502014‑2502278 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |