| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 911,610 | G→A | intergenic (‑221/‑107) | USA300HOU_0869 ← / → sufC | hypothetical membrane protein/ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 911,610 | 0 | G | A | 100.0% | 257.0 / NA | 72 | intergenic (‑221/‑107) | USA300HOU_0869/sufC | hypothetical membrane protein/ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (36/36); total (36/36) | |||||||||||
TAAATTCATAAAATCCATTGAGAAATTATGTGCACTTATTATCATTTATATTTTTAAAGAGAGCGGATTAGAGTTGTACTTTAGAGTTATTAAAAATAATAAAAAGGGTTTAAGTTGTTTATATTAAGGTATAAGTAAGTTATAATTAACTGAACGCATTATTACAAAGTCTTTTTGACTACAAATTAAAATTATTATAAACTAGTTAAGAAAACTTTATATTTTACGGAGGGAATATAAAATGGCATCAACATTAGAAATCAAAGACCTA > CP000730/911476‑911746 | tAAATTCATAAAATCCATTGAGAAATTATGTGCACTTATTATCATTTATATTTTTAAAGAGAGCGGATTAGAGTTGTACTTTAGAGTTATTAAAAATAATAAAAAGGGTTTAAGTTGTTTATATTAAGGTATAAATAAGtt < 2:173026/141‑1 (MQ=255)tAAATTCATAAAATCCATTGAGAAATTATGTGCACTTATTATCATTTATATTTTTAAAGAGAGCGGATTAGAGTTGTACTTTAGAGTTATTAAAAATAATAAAAAGGGTTTAAGTTGTTTATATTAAGGTATAAATAAGtt < 1:200024/141‑1 (MQ=255) aaaTTCATAAAATCCATTGAGAAATTATGTGCACTTATTATCATTTATATTTTTAAAGAGAGCGGATTAGAGTTGTACTTTAGAGTTATTAAAAATAATAAAAAGGGTTTAAGTTGTTTATATTAAGGTATAAATAAGTta > 2:507959/1‑141 (MQ=255) aaTTCATAAAATCCATTGAGAAATTATGTGCACTTATTATCATTTATATTTTTAAAGAGAGCGGATTAGAGTTGTACTTTAGAGTTATTAAAAATAATAAAAAGGGTTTAAGTTGTTTATATTAAGGTATAAATAAGTtat > 1:51468/1‑141 (MQ=255) 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TAAATTCATAAAATCCATTGAGAAATTATGTGCACTTATTATCATTTATATTTTTAAAGAGAGCGGATTAGAGTTGTACTTTAGAGTTATTAAAAATAATAAAAAGGGTTTAAGTTGTTTATATTAAGGTATAAGTAAGTTATAATTAACTGAACGCATTATTACAAAGTCTTTTTGACTACAAATTAAAATTATTATAAACTAGTTAAGAAAACTTTATATTTTACGGAGGGAATATAAAATGGCATCAACATTAGAAATCAAAGACCTA > CP000730/911476‑911746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |