| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 512620 = | 63 (1.110) | 29 (0.790) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAAAAAAC |
26/170 | NT | 38.4% | intergenic (+688/‑173) | recR/rrs1 | recombination protein RecR/16S ribosomal RNA |
| ? | CP000730 | 2176447 = | 80 (1.410) | noncoding (114/114 nt) | rrf5 | 5S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TTTACATTTCTCGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATT > CP000730/2176309‑2176585 | gacatattgtcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTg < 2:111483‑M2/6‑1 (MQ=255) cATTTCTCGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTgg > 1:590203/1‑141 (MQ=40) catattgtcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattacaaaacTGCCTGGc > 1:178039‑M2/134‑141 (MQ=255) attgtcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAAc < 1:161602‑M2/11‑1 (MQ=255) ttgtcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagcattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTTGCAACg > 1:294507‑M2/130‑141 (MQ=255) ctcGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACg < 1:590673/141‑1 (MQ=39) ctcGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTATTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCAGCCACTTTTTGCCTGGCAACg > 1:493573/1‑141 (MQ=255) cGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATATTGTAGTCTTGAACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCACAGCATCCACCTCTTGCCTGGCCACgct > 2:570637/1‑139 (MQ=14) tcattcagttttcaatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTc < 1:586681‑M2/15‑1 (MQ=255) ttCGTCACATTCAAACGTTTTCACTTCGACACGCCAACTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTa > 1:423222/1‑141 (MQ=255) ttCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATATTTCATTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGAACCGTTCTACTCTAGCgg > 2:76224/1‑141 (MQ=255) aatgttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGaa > 1:513352‑M2/114‑141 (MQ=255) gttcattttttttattgtctagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaatagctttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTTCCTGCCAACCTTCTCCTCTAGCGATACGt > 2:200341‑M2/111‑141 (MQ=255) gttcatttttcttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGt > 1:366666‑M2/111‑141 (MQ=255) cGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTa > 2:430326/1‑141 (MQ=39) gTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTaa < 2:525414/141‑1 (MQ=39) tCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTc < 2:21167/141‑1 (MQ=39) tttcttacagacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCg < 2:615595‑M2/38‑1 (MQ=255) cACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCg > 1:611966/1‑141 (MQ=38) cACTTCGCCAAGCCAACTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACGTAAAAAATGAGACCTTGAGGTCTCAATGCGGCGCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTAGTCTAGCGTAACGTAAGTTcc > 2:592518/1‑140 (MQ=14) cTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGGACGTAAGTTCGAc > 2:412192/1‑141 (MQ=255) cTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGAc > 1:272780/1‑141 (MQ=39) cttaccgacaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCTGCACGTAGGTTCGACt > 1:7440‑M2/101‑141 (MQ=255) tCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTa < 1:574417/141‑1 (MQ=40) aaGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATc > 2:259481/1‑141 (MQ=39) acaagaattaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCACCGTTCTACTCTAGCGGAAAGAAAGTTCAACTACCATCg > 2:602475‑M2/94‑141 (MQ=255) ccATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGAc < 1:536636/141‑1 (MQ=39) cATCTTTCTTTGTGTTTGCCTTTATTTTGCCGTTTTAGACATAACAACAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGGATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACg < 2:200119/141‑1 (MQ=14) aTCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCCTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTGGACTATCATCGACGc > 1:555613/1‑141 (MQ=255) ctttctttGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTa > 1:116384/1‑141 (MQ=37) attaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTa > 1:409827‑M2/88‑141 (MQ=255) attaattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTa < 2:63732‑M2/54‑1 (MQ=255) tttctttGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTaa < 1:472052/141‑1 (MQ=37) ttacttatacattttatcaacatttaaggcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttggtgaaaatacTGCCTGGCAACGTTCTCCCCTCGCGGAACGTTAGTTCGACTACCATCGACGCtag > 2:402679‑M2/87‑140 (MQ=255) taattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAg > 1:525643‑M2/86‑141 (MQ=255) aattatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttcttttttaaaaaaaatttaattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGAAACGTAAGTTCGACTAGCATGGGCGCTAAgg > 2:629575‑M2/85‑141 (MQ=255) ctttGTGTCTGCTTTTATTATAACTATTTTGACAGAAAAAAAGATACCTGGCGGTGTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGa > 2:60174/1‑141 (MQ=11) ttGTTTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGCACGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGc < 2:507879/141‑1 (MQ=255) tatacattttatcaacatttaagtcaataactttttttttttttttttttttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCATGGCAACATTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAATGAGc > 1:492889‑M2/82‑141 (MQ=255) tgtgGTTGCTGTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCt < 1:604997/141‑1 (MQ=25) atacattttattaacatttaagttaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCt < 2:381323‑M2/61‑1 (MQ=255) ttGCGTTGATTTTGACGTTTTAGTCATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCCCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACCCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACt < 2:512983/141‑1 (MQ=11) tcTTTTATTTTTACCTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACTTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTc < 1:80362/140‑1 (MQ=255) ttATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATACACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGAAGCTACGGAGCTTACCTTCtatg > 2:316632/1‑141 (MQ=11) caacatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCtgtg > 1:176165‑M2/70‑141 (MQ=255) acatttaagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGtt < 1:578926‑M2/74‑1 (MQ=255) gACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGGGCTTAACTTCTGTGTTCGGCa > 2:220173/1‑141 (MQ=17) gACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGGGCTCGGCa > 2:514234/1‑141 (MQ=17) aagtcaataactttttttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCAt > 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gACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAg < 1:495105/141‑1 (MQ=35) gACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAg > 2:91020/1‑141 (MQ=34) gACATAAAAAAAGAGACCTTGCCGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAg < 1:305632/141‑1 (MQ=25) ttttgttaccttgtccattttattttttaaccaaaatttgattacaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCAGCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGgtg < 2:344126‑M2/91‑1 (MQ=255) tttatcttgtccattttattttttaaccaaaatttgattaaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGa < 2:540649‑M2/94‑1 (MQ=255) aaaaaaGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGa < 1:83119/141‑1 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2:322690/141‑1 (MQ=32) ttaaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGAc < 2:475879‑M2/117‑1 (MQ=255) aTGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGCCGCTAAGGAGCTTACCTTCTGTGTTCGGCCTGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAggc > 2:395015/1‑139 (MQ=12) aaccaaaatttgattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACat > 1:595493‑M2/23‑141 (MQ=255) gggCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACata < 2:450154/140‑1 (MQ=17) cgcctgaTCGCACCCACTTTTTGCCTGACAACCTTCTACTCTCGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTAACCCCCTTGCTATAGTCACCAGACata < 2:152327/135‑1 (MQ=11) cGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGTCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACata < 2:607742/141‑1 (MQ=17) cGGCTCACCGCATCCACTTTTTGCCGGGCAACGTTCTTCTCTATCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACata < 2:152333/141‑1 (MQ=255) cTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGa > 1:239100/1‑141 (MQ=32) tCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTCCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGaa > 1:85096/1‑141 (MQ=17) cATCGTATCCACTTTTTGCCTGGCCACGTTCTACTCTAGCGGAACGAAAGTTCGACTACCATCGACGCGAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAAt < 2:266086/141‑1 (MQ=255) cATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCAGCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAAt > 2:75753/1‑141 (MQ=17) tCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGt < 1:13933/141‑1 (MQ=32) gattaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGtaat > 1:11999‑M2/12‑140 (MQ=255) cATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTaaa < 1:259481/141‑1 (MQ=32) attaaaaaacTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATgtaatt > 2:33151‑M2/11‑139 (MQ=255) ccACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTataatt < 1:79620/141‑6 (MQ=17) tttGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACAtt < 2:460973/141‑1 (MQ=32) | TTTACATTTCTCGTTTCGTCAGATTCAAACGTTTTCACTTCGCCAAGCCATCTTTCTTTGTGTTTGCTTTTATTTTGACGTTTTAGACATAAAAAAAGAGACCTTGCGGTCTCAATGCGGCTCATCGCATCCACTTTTTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATT > CP000730/2176309‑2176585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |